CISBP-RNA Database: Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences of RNA binding proteins
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CIMG_06140
(
Coccidioides immitis
)
CCCH ZF
RBP Information
Pfam ID
Interpro ID
Gene ID
CISBP-RNA ID
Sequence source
PF00642 (zf-CCCH)
IPR000571
CIMG_06140
T01296_0.6
Broad (2011-Oct-27)
Directly determined binding motifs
Name/Motif ID
Species
Sequence Logo
IUPAC
Type/Study/Study ID
RBD
Identity
No direct experiments
Motifs from related RBPs
Name/Motif ID
Species
Sequence Logo
IUPAC
Type/Study/Study ID
RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains
RNA Binding Domains
Protein ID
Domain
From
To
Sequence
CIMG_06140T0
CCCH ZF
171
197
FAPDVCKDYKQTGFCGFGDTCKFLHAR
Links
Other
CCCH ZF
family RBPs
Other
Coccidioides immitis
RBPs
227 Related RBPs
Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
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Action
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Oryza sativa
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