LOC_Os02g25180 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os02g25180 T10916_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os02g25180.1 CCHC ZF 531 548

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

612 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
13113.t00024 Oryza sativa 13113.t00024 N 0.722
13113.t00032 Oryza sativa 13113.t00032 N 0.722
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13113.t00063 Oryza sativa 13113.t00063 N 0.833
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13114.t00059 Oryza sativa 13114.t00059 N 0.778
13114.t00077 Oryza sativa 13114.t00077 N 0.778
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fgenesh2_pg.C_scaffold_2000617 Heterobasidion annosum fgenesh2_pg.C_scaffold_2000617 N 0.722
LOC_Os01g14450 Oryza sativa LOC_Os01g14450 N 0.778
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