LOC_Os02g24530 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os02g24530 T10912_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os02g24530.1 CCHC ZF 100 114
LOC_Os02g24530.1 CCHC ZF 201 216
LOC_Os02g24530.1 CCHC ZF 237 253
LOC_Os02g24530.1 CCHC ZF 309 326

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

52 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os12g34140 Oryza sativa LOC_Os12g34140 N 0.789
LOC_Os09g23840 Oryza sativa LOC_Os09g23840 N 0.824
LOC_Os09g17140 Oryza sativa LOC_Os09g17140 N 0.817
LOC_Os09g13990 Oryza sativa LOC_Os09g13990 N 0.809
LOC_Os09g09070 Oryza sativa LOC_Os09g09070 N 0.814
LOC_Os09g01190 Oryza sativa LOC_Os09g01190 N 0.803
LOC_Os08g24540 Oryza sativa LOC_Os08g24540 N 0.803
LOC_Os08g24230 Oryza sativa LOC_Os08g24230 N 0.817
LOC_Os08g21020 Oryza sativa LOC_Os08g21020 N 0.809
LOC_Os08g20260 Oryza sativa LOC_Os08g20260 N 0.809
LOC_Os08g10830 Oryza sativa LOC_Os08g10830 N 0.803
LOC_Os08g08540 Oryza sativa LOC_Os08g08540 N 0.803
LOC_Os10g12260 Oryza sativa LOC_Os10g12260 N 0.809
LOC_Os10g13340 Oryza sativa LOC_Os10g13340 N 0.817
LOC_Os12g34050 Oryza sativa LOC_Os12g34050 N 0.817
LOC_Os12g30100 Oryza sativa LOC_Os12g30100 N 0.824
LOC_Os12g29060 Oryza sativa LOC_Os12g29060 N 0.817
LOC_Os12g29030 Oryza sativa LOC_Os12g29030 N 0.803
LOC_Os12g28940 Oryza sativa LOC_Os12g28940 N 0.817
LOC_Os12g26820 Oryza sativa LOC_Os12g26820 N 0.803
LOC_Os12g11180 Oryza sativa LOC_Os12g11180 N 0.789
LOC_Os11g31210 Oryza sativa LOC_Os11g31210 N 0.789
LOC_Os10g18590 Oryza sativa LOC_Os10g18590 N 0.817
LOC_Os10g17150 Oryza sativa LOC_Os10g17150 N 0.824
LOC_Os10g14250 Oryza sativa LOC_Os10g14250 N 0.824
LOC_Os08g05240 Oryza sativa LOC_Os08g05240 N 0.803
LOC_Os07g30720 Oryza sativa LOC_Os07g30720 N 0.829
LOC_Os05g08020 Oryza sativa LOC_Os05g08020 N 0.789
LOC_Os05g07490 Oryza sativa LOC_Os05g07490 N 0.824
LOC_Os04g38110 Oryza sativa LOC_Os04g38110 N 0.761
LOC_Os04g21420 Oryza sativa LOC_Os04g21420 N 0.824
LOC_Os04g18260 Oryza sativa LOC_Os04g18260 N 0.803
LOC_Os04g13390 Oryza sativa LOC_Os04g13390 N 0.732
LOC_Os04g06480 Oryza sativa LOC_Os04g06480 N 0.809
LOC_Os04g06420 Oryza sativa LOC_Os04g06420 N 0.831
LOC_Os03g23140 Oryza sativa LOC_Os03g23140 N 0.803
LOC_Os01g24380 Oryza sativa LOC_Os01g24380 N 0.803
LOC_Os01g24180 Oryza sativa LOC_Os01g24180 N 0.714
LOC_Os05g17290 Oryza sativa LOC_Os05g17290 N 0.803
LOC_Os05g17330 Oryza sativa LOC_Os05g17330 N 0.803
LOC_Os07g14960 Oryza sativa LOC_Os07g14960 N 0.803
LOC_Os06g32770 Oryza sativa LOC_Os06g32770 N 0.803
LOC_Os06g32090 Oryza sativa LOC_Os06g32090 N 0.803
LOC_Os06g31850 Oryza sativa LOC_Os06g31850 N 0.778
LOC_Os06g31544 Oryza sativa LOC_Os06g31544 N 0.757
LOC_Os06g25120 Oryza sativa LOC_Os06g25120 N 0.855
LOC_Os06g17200 Oryza sativa LOC_Os06g17200 N 0.803
LOC_Os05g20250 Oryza sativa LOC_Os05g20250 N 0.829
LOC_Os05g19780 Oryza sativa LOC_Os05g19780 N 0.817
LOC_Os05g18270 Oryza sativa LOC_Os05g18270 N 0.803
LOC_Os05g18260 Oryza sativa LOC_Os05g18260 N 0.803
LOC_Os01g02629 Oryza sativa LOC_Os01g02629 N 0.803