LOC_Os12g23580 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os12g23580 T12561_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os12g23580.1 CCHC ZF 627 644

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

599 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity
Action
LOC_Os09g13180 Oryza sativa LOC_Os09g13180 N 1.000
LOC_Os08g23080 Oryza sativa LOC_Os08g23080 N 1.000
LOC_Os08g23070 Oryza sativa LOC_Os08g23070 N 1.000
LOC_Os08g22820 Oryza sativa LOC_Os08g22820 N 1.000
LOC_Os08g22680 Oryza sativa LOC_Os08g22680 N 1.000
LOC_Os08g21860 Oryza sativa LOC_Os08g21860 N 0.944
LOC_Os08g20967 Oryza sativa LOC_Os08g20967 N 1.000
LOC_Os08g20849 Oryza sativa LOC_Os08g20849 N 1.000
LOC_Os08g14530 Oryza sativa LOC_Os08g14530 N 1.000
LOC_Os08g12700 Oryza sativa LOC_Os08g12700 N 1.000
LOC_Os08g12300 Oryza sativa LOC_Os08g12300 N 1.000
LOC_Os08g12080 Oryza sativa LOC_Os08g12080 N 1.000
LOC_Os08g11930 Oryza sativa LOC_Os08g11930 N 1.000
LOC_Os08g11920 Oryza sativa LOC_Os08g11920 N 1.000
LOC_Os08g24560 Oryza sativa LOC_Os08g24560 N 1.000
LOC_Os08g24570 Oryza sativa LOC_Os08g24570 N 1.000
LOC_Os09g13100 Oryza sativa LOC_Os09g13100 N 0.944
LOC_Os09g12940 Oryza sativa LOC_Os09g12940 N 1.000
LOC_Os09g10470 Oryza sativa LOC_Os09g10470 N 0.944
LOC_Os09g09130 Oryza sativa LOC_Os09g09130 N 1.000
LOC_Os09g09050 Oryza sativa LOC_Os09g09050 N 1.000
LOC_Os09g02020 Oryza sativa LOC_Os09g02020 N 1.000
LOC_Os09g01270 Oryza sativa LOC_Os09g01270 N 1.000
LOC_Os09g01260 Oryza sativa LOC_Os09g01260 N 1.000
LOC_Os09g01250 Oryza sativa LOC_Os09g01250 N 1.000
LOC_Os09g01060 Oryza sativa LOC_Os09g01060 N 1.000
LOC_Os08g29250 Oryza sativa LOC_Os08g29250 N 1.000
LOC_Os08g27900 Oryza sativa LOC_Os08g27900 N 1.000
LOC_Os08g26920 Oryza sativa LOC_Os08g26920 N 1.000
LOC_Os08g11380 Oryza sativa LOC_Os08g11380 N 1.000
LOC_Os08g08550 Oryza sativa LOC_Os08g08550 N 1.000
LOC_Os07g16720 Oryza sativa LOC_Os07g16720 N 1.000
LOC_Os07g16560 Oryza sativa LOC_Os07g16560 N 1.000
LOC_Os07g16460 Oryza sativa LOC_Os07g16460 N 0.944
LOC_Os07g06020 Oryza sativa LOC_Os07g06020 N 1.000
LOC_Os06g48110 Oryza sativa LOC_Os06g48110 N 1.000
LOC_Os06g38606 Oryza sativa LOC_Os06g38606 N 1.000
LOC_Os06g33750 Oryza sativa LOC_Os06g33750 N 1.000
LOC_Os06g33020 Oryza sativa LOC_Os06g33020 N 1.000
LOC_Os06g32890 Oryza sativa LOC_Os06g32890 N 1.000
LOC_Os06g32820 Oryza sativa LOC_Os06g32820 N 0.944
LOC_Os06g32110 Oryza sativa LOC_Os06g32110 N 1.000
LOC_Os06g32060 Oryza sativa LOC_Os06g32060 N 1.000
LOC_Os06g32050 Oryza sativa LOC_Os06g32050 N 1.000
LOC_Os07g16850 Oryza sativa LOC_Os07g16850 N 1.000
LOC_Os07g16910 Oryza sativa LOC_Os07g16910 N 1.000
LOC_Os08g03130 Oryza sativa LOC_Os08g03130 N 1.000
LOC_Os07g38340 Oryza sativa LOC_Os07g38340 N 1.000
LOC_Os07g30880 Oryza sativa LOC_Os07g30880 N 1.000
LOC_Os07g27560 Oryza sativa LOC_Os07g27560 N 0.944
LOC_Os07g24700 Oryza sativa LOC_Os07g24700 N 1.000
LOC_Os07g24520 Oryza sativa LOC_Os07g24520 N 1.000
LOC_Os07g24440 Oryza sativa LOC_Os07g24440 N 1.000
LOC_Os07g24420 Oryza sativa LOC_Os07g24420 N 0.944
LOC_Os07g17800 Oryza sativa LOC_Os07g17800 N 1.000
LOC_Os07g17720 Oryza sativa LOC_Os07g17720 N 1.000
LOC_Os07g17620 Oryza sativa LOC_Os07g17620 N 0.944
LOC_Os07g17610 Oryza sativa LOC_Os07g17610 N 1.000
LOC_Os07g17580 Oryza sativa LOC_Os07g17580 N 1.000
LOC_Os06g31910 Oryza sativa LOC_Os06g31910 N 1.000
LOC_Os12g35110 Oryza sativa LOC_Os12g35110 N 1.000
LOC_Os12g15750 Oryza sativa LOC_Os12g15750 N 1.000
LOC_Os12g14800 Oryza sativa LOC_Os12g14800 N 1.000
LOC_Os12g14420 Oryza sativa LOC_Os12g14420 N 1.000
LOC_Os12g11290 Oryza sativa LOC_Os12g11290 N 1.000
LOC_Os11g44730 Oryza sativa LOC_Os11g44730 N 1.000
LOC_Os11g36220 Oryza sativa LOC_Os11g36220 N 1.000
LOC_Os11g26670 Oryza sativa LOC_Os11g26670 N 1.000
LOC_Os11g26050 Oryza sativa LOC_Os11g26050 N 1.000
LOC_Os11g21980 Oryza sativa LOC_Os11g21980 N 0.944
LOC_Os11g19420 Oryza sativa LOC_Os11g19420 N 1.000
LOC_Os11g12870 Oryza sativa LOC_Os11g12870 N 1.000
LOC_Os11g12210 Oryza sativa LOC_Os11g12210 N 1.000
LOC_Os11g12110 Oryza sativa LOC_Os11g12110 N 1.000
LOC_Os12g15820 Oryza sativa LOC_Os12g15820 N 1.000
LOC_Os12g18460 Oryza sativa LOC_Os12g18460 N 1.000
LOC_Os12g34180 Oryza sativa LOC_Os12g34180 N 1.000
LOC_Os12g34090 Oryza sativa LOC_Os12g34090 N 1.000
LOC_Os12g30214 Oryza sativa LOC_Os12g30214 N 1.000
LOC_Os12g28990 Oryza sativa LOC_Os12g28990 N 1.000
LOC_Os12g28920 Oryza sativa LOC_Os12g28920 N 1.000
LOC_Os12g28490 Oryza sativa LOC_Os12g28490 N 1.000
LOC_Os12g27150 Oryza sativa LOC_Os12g27150 N 1.000
LOC_Os12g23120 Oryza sativa LOC_Os12g23120 N 1.000
LOC_Os12g22990 Oryza sativa LOC_Os12g22990 N 1.000
LOC_Os12g22250 Oryza sativa LOC_Os12g22250 N 1.000
LOC_Os12g19980 Oryza sativa LOC_Os12g19980 N 1.000
LOC_Os12g19920 Oryza sativa LOC_Os12g19920 N 1.000
LOC_Os10g38402 Oryza sativa LOC_Os10g38402 N 1.000
LOC_Os10g25530 Oryza sativa LOC_Os10g25530 N 1.000
LOC_Os10g09490 Oryza sativa LOC_Os10g09490 N 0.944
LOC_Os10g09400 Oryza sativa LOC_Os10g09400 N 1.000
LOC_Os10g09220 Oryza sativa LOC_Os10g09220 N 1.000
LOC_Os10g06450 Oryza sativa LOC_Os10g06450 N 1.000
LOC_Os10g06330 Oryza sativa LOC_Os10g06330 N 0.944
LOC_Os10g06290 Oryza sativa LOC_Os10g06290 N 1.000
LOC_Os09g24080 Oryza sativa LOC_Os09g24080 N 1.000
LOC_Os09g23920 Oryza sativa LOC_Os09g23920 N 1.000
LOC_Os09g21860 Oryza sativa LOC_Os09g21860 N 0.944
LOC_Os09g17400 Oryza sativa LOC_Os09g17400 N 1.000
LOC_Os09g14360 Oryza sativa LOC_Os09g14360 N 1.000
LOC_Os09g14340 Oryza sativa LOC_Os09g14340 N 1.000
LOC_Os09g13750 Oryza sativa LOC_Os09g13750 N 1.000
LOC_Os10g11672 Oryza sativa LOC_Os10g11672 N 1.000
LOC_Os10g11690 Oryza sativa LOC_Os10g11690 N 1.000
LOC_Os10g24580 Oryza sativa LOC_Os10g24580 N 1.000
LOC_Os10g24560 Oryza sativa LOC_Os10g24560 N 1.000
LOC_Os10g24510 Oryza sativa LOC_Os10g24510 N 1.000
LOC_Os10g20020 Oryza sativa LOC_Os10g20020 N 1.000
LOC_Os10g17340 Oryza sativa LOC_Os10g17340 N 1.000
LOC_Os10g16910 Oryza sativa LOC_Os10g16910 N 1.000
LOC_Os10g16600 Oryza sativa LOC_Os10g16600 N 1.000
LOC_Os10g16550 Oryza sativa LOC_Os10g16550 N 1.000
LOC_Os10g16480 Oryza sativa LOC_Os10g16480 N 1.000
LOC_Os10g13350 Oryza sativa LOC_Os10g13350 N 1.000
LOC_Os10g12808 Oryza sativa LOC_Os10g12808 N 1.000
LOC_Os10g12770 Oryza sativa LOC_Os10g12770 N 1.000
LOC_Os10g12690 Oryza sativa LOC_Os10g12690 N 1.000
LOC_Os09g13710 Oryza sativa LOC_Os09g13710 N 1.000
LOC_Os06g31730 Oryza sativa LOC_Os06g31730 N 1.000
LOC_Os04g21210 Oryza sativa LOC_Os04g21210 N 1.000
LOC_Os04g12250 Oryza sativa LOC_Os04g12250 N 1.000
LOC_Os04g10100 Oryza sativa LOC_Os04g10100 N 1.000
LOC_Os04g07650 Oryza sativa LOC_Os04g07650 N 1.000
LOC_Os04g07370 Oryza sativa LOC_Os04g07370 N 1.000
LOC_Os04g06430 Oryza sativa LOC_Os04g06430 N 1.000
LOC_Os04g06110 Oryza sativa LOC_Os04g06110 N 1.000
LOC_Os04g05170 Oryza sativa LOC_Os04g05170 N 1.000
LOC_Os04g05160 Oryza sativa LOC_Os04g05160 N 1.000
LOC_Os04g04850 Oryza sativa LOC_Os04g04850 N 1.000
LOC_Os04g04574 Oryza sativa LOC_Os04g04574 N 1.000
LOC_Os04g04150 Oryza sativa LOC_Os04g04150 N 1.000
LOC_Os04g01040 Oryza sativa LOC_Os04g01040 N 1.000
LOC_Os03g60050 Oryza sativa LOC_Os03g60050 N 1.000
LOC_Os04g13820 Oryza sativa LOC_Os04g13820 N 1.000
LOC_Os04g13920 Oryza sativa LOC_Os04g13920 N 1.000
LOC_Os04g21200 Oryza sativa LOC_Os04g21200 N 1.000
LOC_Os04g20040 Oryza sativa LOC_Os04g20040 N 1.000
LOC_Os04g19610 Oryza sativa LOC_Os04g19610 N 1.000
LOC_Os04g19570 Oryza sativa LOC_Os04g19570 N 1.000
LOC_Os04g19270 Oryza sativa LOC_Os04g19270 N 1.000
LOC_Os04g18760 Oryza sativa LOC_Os04g18760 N 1.000
LOC_Os04g18460 Oryza sativa LOC_Os04g18460 N 1.000
LOC_Os04g17240 Oryza sativa LOC_Os04g17240 N 1.000
LOC_Os04g16810 Oryza sativa LOC_Os04g16810 N 1.000
LOC_Os04g16500 Oryza sativa LOC_Os04g16500 N 1.000
LOC_Os04g16430 Oryza sativa LOC_Os04g16430 N 1.000
LOC_Os04g16100 Oryza sativa LOC_Os04g16100 N 1.000
LOC_Os04g13930 Oryza sativa LOC_Os04g13930 N 1.000
LOC_Os03g45670 Oryza sativa LOC_Os03g45670 N 1.000
LOC_Os03g41770 Oryza sativa LOC_Os03g41770 N 1.000
LOC_Os02g13470 Oryza sativa LOC_Os02g13470 N 1.000
LOC_Os01g60980 Oryza sativa LOC_Os01g60980 N 1.000
LOC_Os01g39570 Oryza sativa LOC_Os01g39570 N 1.000
LOC_Os01g37060 Oryza sativa LOC_Os01g37060 N 1.000
LOC_Os01g36170 Oryza sativa LOC_Os01g36170 N 1.000
LOC_Os01g36040 Oryza sativa LOC_Os01g36040 N 1.000
LOC_Os01g35660 Oryza sativa LOC_Os01g35660 N 1.000
LOC_Os01g35450 Oryza sativa LOC_Os01g35450 N 1.000
LOC_Os01g30936 Oryza sativa LOC_Os01g30936 N 1.000
LOC_Os01g23020 Oryza sativa LOC_Os01g23020 N 1.000
LOC_Os01g19000 Oryza sativa LOC_Os01g19000 N 1.000
13114.t00040 Oryza sativa 13114.t00040 N 1.000
13113.t00032 Oryza sativa 13113.t00032 N 1.000
LOC_Os02g16400 Oryza sativa LOC_Os02g16400 N 0.944
LOC_Os02g24250 Oryza sativa LOC_Os02g24250 N 1.000
LOC_Os03g32960 Oryza sativa LOC_Os03g32960 N 1.000
LOC_Os03g26750 Oryza sativa LOC_Os03g26750 N 0.944
LOC_Os03g23860 Oryza sativa LOC_Os03g23860 N 1.000
LOC_Os03g23840 Oryza sativa LOC_Os03g23840 N 1.000
LOC_Os03g23830 Oryza sativa LOC_Os03g23830 N 1.000
LOC_Os03g23800 Oryza sativa LOC_Os03g23800 N 1.000
LOC_Os03g23760 Oryza sativa LOC_Os03g23760 N 1.000
LOC_Os03g23220 Oryza sativa LOC_Os03g23220 N 1.000
LOC_Os03g23100 Oryza sativa LOC_Os03g23100 N 1.000
LOC_Os03g15160 Oryza sativa LOC_Os03g15160 N 1.000
LOC_Os02g40580 Oryza sativa LOC_Os02g40580 N 1.000
LOC_Os02g38620 Oryza sativa LOC_Os02g38620 N 1.000
LOC_Os02g38550 Oryza sativa LOC_Os02g38550 N 1.000
13113.t00024 Oryza sativa 13113.t00024 N 1.000
LOC_Os06g31540 Oryza sativa LOC_Os06g31540 N 1.000
LOC_Os05g23080 Oryza sativa LOC_Os05g23080 N 1.000
LOC_Os05g22410 Oryza sativa LOC_Os05g22410 N 1.000
LOC_Os05g21040 Oryza sativa LOC_Os05g21040 N 1.000
LOC_Os05g20510 Oryza sativa LOC_Os05g20510 N 1.000
LOC_Os05g20230 Oryza sativa LOC_Os05g20230 N 1.000
LOC_Os05g20200 Oryza sativa LOC_Os05g20200 N 1.000
LOC_Os05g20180 Oryza sativa LOC_Os05g20180 N 1.000
LOC_Os05g19870 Oryza sativa LOC_Os05g19870 N 1.000
LOC_Os05g19850 Oryza sativa LOC_Os05g19850 N 1.000
LOC_Os05g19560 Oryza sativa LOC_Os05g19560 N 1.000
LOC_Os05g19200 Oryza sativa LOC_Os05g19200 N 1.000
LOC_Os05g19190 Oryza sativa LOC_Os05g19190 N 1.000
LOC_Os05g19140 Oryza sativa LOC_Os05g19140 N 1.000
LOC_Os05g23370 Oryza sativa LOC_Os05g23370 N 1.000
LOC_Os05g26180 Oryza sativa LOC_Os05g26180 N 1.000
LOC_Os06g31430 Oryza sativa LOC_Os06g31430 N 1.000
LOC_Os06g31390 Oryza sativa LOC_Os06g31390 N 1.000
LOC_Os06g31020 Oryza sativa LOC_Os06g31020 N 1.000
LOC_Os06g25810 Oryza sativa LOC_Os06g25810 N 1.000
LOC_Os06g25100 Oryza sativa LOC_Os06g25100 N 1.000
LOC_Os06g24630 Oryza sativa LOC_Os06g24630 N 1.000
LOC_Os06g24350 Oryza sativa LOC_Os06g24350 N 1.000
LOC_Os06g18030 Oryza sativa LOC_Os06g18030 N 1.000
LOC_Os06g17750 Oryza sativa LOC_Os06g17750 N 1.000
LOC_Os06g16890 Oryza sativa LOC_Os06g16890 N 1.000
LOC_Os05g26500 Oryza sativa LOC_Os05g26500 N 0.944
LOC_Os05g26420 Oryza sativa LOC_Os05g26420 N 1.000
LOC_Os05g26320 Oryza sativa LOC_Os05g26320 N 1.000
LOC_Os05g18490 Oryza sativa LOC_Os05g18490 N 1.000
LOC_Os05g18380 Oryza sativa LOC_Os05g18380 N 1.000
LOC_Os05g03670 Oryza sativa LOC_Os05g03670 N 1.000
LOC_Os05g01650 Oryza sativa LOC_Os05g01650 N 1.000
LOC_Os04g48640 Oryza sativa LOC_Os04g48640 N 1.000
LOC_Os04g45400 Oryza sativa LOC_Os04g45400 N 1.000
LOC_Os04g38190 Oryza sativa LOC_Os04g38190 N 1.000
LOC_Os04g38180 Oryza sativa LOC_Os04g38180 N 1.000
LOC_Os04g27570 Oryza sativa LOC_Os04g27570 N 1.000
LOC_Os04g26660 Oryza sativa LOC_Os04g26660 N 1.000
LOC_Os04g25040 Oryza sativa LOC_Os04g25040 N 1.000
LOC_Os04g25030 Oryza sativa LOC_Os04g25030 N 1.000
LOC_Os04g25020 Oryza sativa LOC_Os04g25020 N 1.000
LOC_Os04g24989 Oryza sativa LOC_Os04g24989 N 1.000
LOC_Os04g22010 Oryza sativa LOC_Os04g22010 N 1.000
LOC_Os05g07350 Oryza sativa LOC_Os05g07350 N 1.000
LOC_Os05g08290 Oryza sativa LOC_Os05g08290 N 0.944
LOC_Os05g18230 Oryza sativa LOC_Os05g18230 N 1.000
LOC_Os05g17910 Oryza sativa LOC_Os05g17910 N 1.000
LOC_Os05g17480 Oryza sativa LOC_Os05g17480 N 1.000
LOC_Os05g17410 Oryza sativa LOC_Os05g17410 N 1.000
LOC_Os05g17320 Oryza sativa LOC_Os05g17320 N 1.000
LOC_Os05g17270 Oryza sativa LOC_Os05g17270 N 1.000
LOC_Os05g17260 Oryza sativa LOC_Os05g17260 N 1.000
LOC_Os05g17100 Oryza sativa LOC_Os05g17100 N 1.000
LOC_Os05g17000 Oryza sativa LOC_Os05g17000 N 1.000
LOC_Os05g16960 Oryza sativa LOC_Os05g16960 N 1.000
LOC_Os05g16790 Oryza sativa LOC_Os05g16790 N 1.000
LOC_Os05g16720 Oryza sativa LOC_Os05g16720 N 1.000
LOC_Os05g09080 Oryza sativa LOC_Os05g09080 N 1.000
LOC_Os04g21220 Oryza sativa LOC_Os04g21220 N 1.000