LOC_Os05g17700 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os05g17700 T11425_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os05g17700.1 CCHC ZF 159 175
LOC_Os05g17700.1 CCHC ZF 331 347
LOC_Os05g17700.1 CCHC ZF 367 383

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

43 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
13113.t00005 Oryza sativa 13113.t00005 N 0.923
LOC_Os01g29070 Oryza sativa LOC_Os01g29070 N 0.923
LOC_Os01g35400 Oryza sativa LOC_Os01g35400 N 0.961
LOC_Os01g37570 Oryza sativa LOC_Os01g37570 N 0.942
LOC_Os02g23828 Oryza sativa LOC_Os02g23828 N 0.904
LOC_Os02g25390 Oryza sativa LOC_Os02g25390 N 0.923
LOC_Os03g23230 Oryza sativa LOC_Os03g23230 N 0.923
LOC_Os03g32970 Oryza sativa LOC_Os03g32970 N 0.885
LOC_Os04g05240 Oryza sativa LOC_Os04g05240 N 0.962
LOC_Os04g06402 Oryza sativa LOC_Os04g06402 N 0.904
LOC_Os04g14050 Oryza sativa LOC_Os04g14050 N 0.865
LOC_Os04g53900 Oryza sativa LOC_Os04g53900 N 0.904
LOC_Os05g08270 Oryza sativa LOC_Os05g08270 N 0.904
LOC_Os05g17580 Oryza sativa LOC_Os05g17580 N 0.923
LOC_Os05g17720 Oryza sativa LOC_Os05g17720 N 0.942
LOC_Os05g18030 Oryza sativa LOC_Os05g18030 N 0.923
LOC_Os05g18060 Oryza sativa LOC_Os05g18060 N 0.904
LOC_Os05g19430 Oryza sativa LOC_Os05g19430 N 0.941
LOC_Os05g20800 Oryza sativa LOC_Os05g20800 N 0.941
LOC_Os05g22850 Oryza sativa LOC_Os05g22850 N 0.904
LOC_Os05g26300 Oryza sativa LOC_Os05g26300 N 0.904
LOC_Os06g18730 Oryza sativa LOC_Os06g18730 N 0.942
LOC_Os06g31750 Oryza sativa LOC_Os06g31750 N 0.942
LOC_Os07g17880 Oryza sativa LOC_Os07g17880 N 0.904
LOC_Os07g24720 Oryza sativa LOC_Os07g24720 N 0.922
LOC_Os08g12110 Oryza sativa LOC_Os08g12110 N 0.904
LOC_Os08g20952 Oryza sativa LOC_Os08g20952 N 0.904
LOC_Os08g22940 Oryza sativa LOC_Os08g22940 N 0.922
LOC_Os08g24080 Oryza sativa LOC_Os08g24080 N 0.923
LOC_Os08g24100 Oryza sativa LOC_Os08g24100 N 0.922
LOC_Os08g27380 Oryza sativa LOC_Os08g27380 N 0.885
LOC_Os08g45260 Oryza sativa LOC_Os08g45260 N 0.904
LOC_Os09g06870 Oryza sativa LOC_Os09g06870 N 0.961
LOC_Os09g09020 Oryza sativa LOC_Os09g09020 N 0.941
LOC_Os09g09080 Oryza sativa LOC_Os09g09080 N 0.923
LOC_Os09g13140 Oryza sativa LOC_Os09g13140 N 0.904
LOC_Os10g16780 Oryza sativa LOC_Os10g16780 N 0.904
LOC_Os10g17210 Oryza sativa LOC_Os10g17210 N 0.774
LOC_Os10g18730 Oryza sativa LOC_Os10g18730 N 0.843
LOC_Os11g35170 Oryza sativa LOC_Os11g35170 N 0.904
LOC_Os12g18050 Oryza sativa LOC_Os12g18050 N 0.942
LOC_Os12g25600 Oryza sativa LOC_Os12g25600 N 0.904
LOC_Os12g33800 Oryza sativa LOC_Os12g33800 N 0.904