29908.m006046 (Ricinus communis)
RRM

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00076 (RRM_1) IPR000504 29908.m006046 T48707_0.6 JGI (2010-Jan-8)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
AT1G76460-TAIR-G
M239_0.6 		Arabidopsis thaliana DGWGUGD RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00284 		0.765
For this family, RBPs with RBD identity > 0.7 will likely have a similar motif

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
29908.m006046 RRM 15 82

Links

Other RRM family RBPs
Other Ricinus communis RBPs

81 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os01g05320 Oryza sativa LOC_Os01g05320 N 0.000
LOC_Os01g08480 Oryza sativa LOC_Os01g08480 N 0.000
LOC_Os01g11450 Oryza sativa LOC_Os01g11450 N 0.000
LOC_Os01g16820 Oryza sativa LOC_Os01g16820 N 0.000
LOC_Os01g22890 Oryza sativa LOC_Os01g22890 N 0.000
LOC_Os01g26240 Oryza sativa LOC_Os01g26240 N 0.000
LOC_Os01g27420 Oryza sativa LOC_Os01g27420 N 0.000
LOC_Os01g31840 Oryza sativa LOC_Os01g31840 N 0.000
LOC_Os01g33100 Oryza sativa LOC_Os01g33100 N 0.000
LOC_Os01g36680 Oryza sativa LOC_Os01g36680 N 0.000
LOC_Os01g36960 Oryza sativa LOC_Os01g36960 N 0.000
LOC_Os01g39550 Oryza sativa LOC_Os01g39550 N 0.000
LOC_Os01g41522 Oryza sativa LOC_Os01g41522 N 0.000
LOC_Os01g48670 Oryza sativa LOC_Os01g48670 N 0.000
LOC_Os01g50180 Oryza sativa LOC_Os01g50180 N 0.000
LOC_Os02g01260 Oryza sativa LOC_Os02g01260 N 0.000
LOC_Os02g03160 Oryza sativa LOC_Os02g03160 N 0.000
LOC_Os02g06740 Oryza sativa LOC_Os02g06740 N 0.000
LOC_Os02g25790 Oryza sativa LOC_Os02g25790 N 0.000
LOC_Os02g40230 Oryza sativa LOC_Os02g40230 N 0.000
LOC_Os02g51980 Oryza sativa LOC_Os02g51980 N 0.000
LOC_Os02g52680 Oryza sativa LOC_Os02g52680 N 0.000
LOC_Os03g31134 Oryza sativa LOC_Os03g31134 N 0.000
LOC_Os03g33640 Oryza sativa LOC_Os03g33640 N 0.000
LOC_Os03g41000 Oryza sativa LOC_Os03g41000 N 0.000
LOC_Os03g44270 Oryza sativa LOC_Os03g44270 N 0.000
LOC_Os03g49910 Oryza sativa LOC_Os03g49910 N 0.000
LOC_Os03g53560 Oryza sativa LOC_Os03g53560 N 0.000
LOC_Os03g54804 Oryza sativa LOC_Os03g54804 N 0.000
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LOC_Os04g08780 Oryza sativa LOC_Os04g08780 N 0.000
LOC_Os04g11770 Oryza sativa LOC_Os04g11770 N 0.000
LOC_Os04g17020 Oryza sativa LOC_Os04g17020 N 0.000
LOC_Os04g26480 Oryza sativa LOC_Os04g26480 N 0.000
LOC_Os04g31220 Oryza sativa LOC_Os04g31220 N 0.000
LOC_Os04g34070 Oryza sativa LOC_Os04g34070 N 0.000
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LOC_Os05g29720 Oryza sativa LOC_Os05g29720 N 0.000
LOC_Os05g32290 Oryza sativa LOC_Os05g32290 N 0.000
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LOC_Os05g49540 Oryza sativa LOC_Os05g49540 N 0.000
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LOC_Os06g29300 Oryza sativa LOC_Os06g29300 N 0.000
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LOC_Os06g35550 Oryza sativa LOC_Os06g35550 N 0.000
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LOC_Os07g02510 Oryza sativa LOC_Os07g02510 N 0.000
LOC_Os07g03670 Oryza sativa LOC_Os07g03670 N 0.000
LOC_Os07g03940 Oryza sativa LOC_Os07g03940 N 0.000
LOC_Os07g08560 Oryza sativa LOC_Os07g08560 N 0.000
LOC_Os07g13610 Oryza sativa LOC_Os07g13610 N 0.000
LOC_Os07g17030 Oryza sativa LOC_Os07g17030 N 0.000
LOC_Os07g18620 Oryza sativa LOC_Os07g18620 N 0.000
LOC_Os07g24340 Oryza sativa LOC_Os07g24340 N 0.000
LOC_Os07g32180 Oryza sativa LOC_Os07g32180 N 0.000
LOC_Os07g34860 Oryza sativa LOC_Os07g34860 N 0.000
LOC_Os07g36990 Oryza sativa LOC_Os07g36990 N 0.000
LOC_Os08g08350 Oryza sativa LOC_Os08g08350 N 0.000
LOC_Os08g15870 Oryza sativa LOC_Os08g15870 N 0.000
LOC_Os08g34440 Oryza sativa LOC_Os08g34440 N 0.000
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LOC_Os08g36290 Oryza sativa LOC_Os08g36290 N 0.000
LOC_Os08g42090 Oryza sativa LOC_Os08g42090 N 0.000
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LOC_Os09g02760 Oryza sativa LOC_Os09g02760 N 0.000
LOC_Os09g23100 Oryza sativa LOC_Os09g23100 N 0.000
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LOC_Os11g17200 Oryza sativa LOC_Os11g17200 N 0.000
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LOC_Os12g23730 Oryza sativa LOC_Os12g23730 N 0.000
LOC_Os12g27730 Oryza sativa LOC_Os12g27730 N 0.000
LOC_Os12g30310 Oryza sativa LOC_Os12g30310 N 0.000
LOC_Os12g34700 Oryza sativa LOC_Os12g34700 N 0.000
LOC_Os12g35800 Oryza sativa LOC_Os12g35800 N 0.000
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LOC_Os12g41280 Oryza sativa LOC_Os12g41280 N 0.000