LOC_Os06g29300 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os06g29300 T11642_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os06g29300.1 CCHC ZF 307 324

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

158 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os02g16520 Oryza sativa LOC_Os02g16520 N 1.000
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estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 N 0.722
AT2G01034 Arabidopsis thaliana AT2G01034-TAIR-G N 0.722
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 N 0.722
estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 Physcomitrella patens estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 N 0.722
gm1.300904 Emiliania huxleyi gm1.300904 N 0.722
ENSBTAG00000040266 Bos taurus ENSBTAG00000040266 N 0.722