Glyma12g06430.1 (Glycine max)
PUF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00806 (PUF) IPR001313 Glyma12g06430.1 T24889_0.6 JGI (2010-Jan-8)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
Glyma12g06430.1 PUF 697 731
Glyma12g06430.1 PUF 733 766
Glyma12g06430.1 PUF 769 803
Glyma12g06430.1 PUF 805 839
Glyma12g06430.1 PUF 841 876
Glyma12g06430.1 PUF 878 912
Glyma12g06430.1 PUF 914 948
Glyma12g06430.1 PUF 961 990

Links

Other PUF family RBPs
Other Glycine max RBPs

78 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
13113.t00005 Oryza sativa 13113.t00005 N 0.000
LOC_Os01g29070 Oryza sativa LOC_Os01g29070 N 0.000
LOC_Os01g35400 Oryza sativa LOC_Os01g35400 N 0.000
LOC_Os02g23828 Oryza sativa LOC_Os02g23828 N 0.000
LOC_Os02g25390 Oryza sativa LOC_Os02g25390 N 0.000
LOC_Os03g23230 Oryza sativa LOC_Os03g23230 N 0.000
LOC_Os03g32970 Oryza sativa LOC_Os03g32970 N 0.000
LOC_Os04g05240 Oryza sativa LOC_Os04g05240 N 0.000
LOC_Os04g06402 Oryza sativa LOC_Os04g06402 N 0.000
LOC_Os04g14050 Oryza sativa LOC_Os04g14050 N 0.000
LOC_Os04g53900 Oryza sativa LOC_Os04g53900 N 0.000
LOC_Os05g08270 Oryza sativa LOC_Os05g08270 N 0.000
LOC_Os05g17580 Oryza sativa LOC_Os05g17580 N 0.000
LOC_Os05g17700 Oryza sativa LOC_Os05g17700 N 0.000
LOC_Os05g17720 Oryza sativa LOC_Os05g17720 N 0.000
LOC_Os05g18030 Oryza sativa LOC_Os05g18030 N 0.000
LOC_Os05g18060 Oryza sativa LOC_Os05g18060 N 0.000
LOC_Os05g19430 Oryza sativa LOC_Os05g19430 N 0.000
LOC_Os05g20800 Oryza sativa LOC_Os05g20800 N 0.000
LOC_Os05g22850 Oryza sativa LOC_Os05g22850 N 0.000
LOC_Os05g26300 Oryza sativa LOC_Os05g26300 N 0.000
LOC_Os06g18730 Oryza sativa LOC_Os06g18730 N 0.000
LOC_Os06g31750 Oryza sativa LOC_Os06g31750 N 0.000
LOC_Os07g17880 Oryza sativa LOC_Os07g17880 N 0.000
LOC_Os07g24720 Oryza sativa LOC_Os07g24720 N 0.000
LOC_Os08g12110 Oryza sativa LOC_Os08g12110 N 0.000
LOC_Os08g20952 Oryza sativa LOC_Os08g20952 N 0.000
LOC_Os08g22940 Oryza sativa LOC_Os08g22940 N 0.000
LOC_Os08g24080 Oryza sativa LOC_Os08g24080 N 0.000
LOC_Os08g24100 Oryza sativa LOC_Os08g24100 N 0.000
LOC_Os08g27380 Oryza sativa LOC_Os08g27380 N 0.000
LOC_Os08g45260 Oryza sativa LOC_Os08g45260 N 0.000
LOC_Os09g06870 Oryza sativa LOC_Os09g06870 N 0.000
LOC_Os09g09020 Oryza sativa LOC_Os09g09020 N 0.000
LOC_Os09g09080 Oryza sativa LOC_Os09g09080 N 0.000
LOC_Os09g13140 Oryza sativa LOC_Os09g13140 N 0.000
LOC_Os10g16780 Oryza sativa LOC_Os10g16780 N 0.000
LOC_Os10g17210 Oryza sativa LOC_Os10g17210 N 0.000
LOC_Os10g18730 Oryza sativa LOC_Os10g18730 N 0.000
LOC_Os11g35170 Oryza sativa LOC_Os11g35170 N 0.000
LOC_Os12g18050 Oryza sativa LOC_Os12g18050 N 0.000
LOC_Os12g25600 Oryza sativa LOC_Os12g25600 N 0.000
LOC_Os12g33800 Oryza sativa LOC_Os12g33800 N 0.000