AGAP001460 (Anopheles gambiae)
RRM

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00076 (RRM_1) IPR000504 AGAP001460 T32463_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
rump
M288_0.6 		Drosophila melanogaster Sequence logo not available GGAGG RIP-chip
Cook et al.(2011)
34_15781475 		0.761
For this family, RBPs with RBD identity > 0.7 will likely have a similar motif

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
AGAP001460-PA RRM 44 114
AGAP001460-PA RRM 235 304
AGAP001460-PA RRM 535 598

Links

Other RRM family RBPs
Other Anopheles gambiae RBPs

15 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
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