PGTG_13387 (Puccinia graminis)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 PGTG_13387 T08197_0.6 Broad (2011-Oct-27)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
PGTT_13387 CCHC ZF 406 423

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Puccinia graminis RBPs

7 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
30128.m009003 Ricinus communis 30128.m009003 N 0.000
BGIOSIBCE013536 Oryza indica BGIOSIBCE013536 N 0.000
BRADI1G03180 Brachypodium distachyon BRADI1G03180 N 0.000
BRADI3G23364 Brachypodium distachyon BRADI3G23364 N 0.000
BRADI4G42725 Brachypodium distachyon BRADI4G42725 N 0.000
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 N 0.000
estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 Physcomitrella patens estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 N 0.000
fgenesh3_pg.7__35 Postia placenta fgenesh3_pg.7__35 N 0.000
Genemark.983_g Serpula lacrymans Genemark.983_g N 0.000
Glyma03g38550.1 Glycine max Glyma03g38550.1 N 0.000
Glyma19g41150.1 Glycine max Glyma19g41150.1 N 0.000
gm1.300904 Emiliania huxleyi gm1.300904 N 0.000
GRMZM2G163072 Zea mays GRMZM2G163072 N 0.000
GRMZM2G415491 Zea mays GRMZM2G415491 N 0.000
LOC_Os01g05320 Oryza sativa LOC_Os01g05320 N 0.000
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Sb01g002660 Sorghum bicolor Sb01g002660 N 0.000
s_442830 Phytophthora sojae s_442830 N 0.000