LOC_Os02g16190 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os02g16190 T10880_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os02g16190.1 CCHC ZF 310 327

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

598 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os07g30310 Oryza sativa LOC_Os07g30310 N 1.000
LOC_Os09g01070 Oryza sativa LOC_Os09g01070 N 1.000
LOC_Os09g01230 Oryza sativa LOC_Os09g01230 N 1.000
LOC_Os09g13210 Oryza sativa LOC_Os09g13210 N 1.000
LOC_Os10g03250 Oryza sativa LOC_Os10g03250 N 1.000
LOC_Os10g06520 Oryza sativa LOC_Os10g06520 N 1.000
LOC_Os10g06550 Oryza sativa LOC_Os10g06550 N 1.000
LOC_Os10g08180 Oryza sativa LOC_Os10g08180 N 1.000
LOC_Os10g10600 Oryza sativa LOC_Os10g10600 N 1.000
LOC_Os10g11400 Oryza sativa LOC_Os10g11400 N 1.000
LOC_Os10g11702 Oryza sativa LOC_Os10g11702 N 1.000
LOC_Os10g12530 Oryza sativa LOC_Os10g12530 N 1.000
LOC_Os10g13300 Oryza sativa LOC_Os10g13300 N 1.000
LOC_Os10g13530 Oryza sativa LOC_Os10g13530 N 1.000
LOC_Os10g18294 Oryza sativa LOC_Os10g18294 N 1.000
LOC_Os08g27110 Oryza sativa LOC_Os08g27110 N 1.000
LOC_Os08g26910 Oryza sativa LOC_Os08g26910 N 1.000
LOC_Os08g22990 Oryza sativa LOC_Os08g22990 N 1.000
LOC_Os07g45610 Oryza sativa LOC_Os07g45610 N 1.000
LOC_Os08g05180 Oryza sativa LOC_Os08g05180 N 1.000
LOC_Os08g06990 Oryza sativa LOC_Os08g06990 N 1.000
LOC_Os08g09140 Oryza sativa LOC_Os08g09140 N 1.000
LOC_Os08g11850 Oryza sativa LOC_Os08g11850 N 1.000
LOC_Os08g11980 Oryza sativa LOC_Os08g11980 N 1.000
LOC_Os08g12470 Oryza sativa LOC_Os08g12470 N 1.000
LOC_Os08g12540 Oryza sativa LOC_Os08g12540 N 1.000
LOC_Os08g14250 Oryza sativa LOC_Os08g14250 N 1.000
LOC_Os08g16180 Oryza sativa LOC_Os08g16180 N 1.000
LOC_Os08g20770 Oryza sativa LOC_Os08g20770 N 1.000
LOC_Os08g21110 Oryza sativa LOC_Os08g21110 N 1.000
LOC_Os08g21360 Oryza sativa LOC_Os08g21360 N 1.000
LOC_Os08g22960 Oryza sativa LOC_Os08g22960 N 1.000
LOC_Os10g18580 Oryza sativa LOC_Os10g18580 N 1.000
LOC_Os10g18650 Oryza sativa LOC_Os10g18650 N 1.000
LOC_Os10g20190 Oryza sativa LOC_Os10g20190 N 1.000
LOC_Os12g20060 Oryza sativa LOC_Os12g20060 N 1.000
LOC_Os12g20110 Oryza sativa LOC_Os12g20110 N 1.000
LOC_Os12g24364 Oryza sativa LOC_Os12g24364 N 1.000
LOC_Os12g25980 Oryza sativa LOC_Os12g25980 N 1.000
LOC_Os12g26610 Oryza sativa LOC_Os12g26610 N 1.000
LOC_Os12g26830 Oryza sativa LOC_Os12g26830 N 1.000
LOC_Os12g27140 Oryza sativa LOC_Os12g27140 N 1.000
LOC_Os12g28220 Oryza sativa LOC_Os12g28220 N 1.000
LOC_Os12g28970 Oryza sativa LOC_Os12g28970 N 1.000
LOC_Os12g29000 Oryza sativa LOC_Os12g29000 N 1.000
LOC_Os12g30400 Oryza sativa LOC_Os12g30400 N 1.000
LOC_Os12g31250 Oryza sativa LOC_Os12g31250 N 1.000
LOC_Os12g33450 Oryza sativa LOC_Os12g33450 N 1.000
LOC_Os12g33910 Oryza sativa LOC_Os12g33910 N 1.000
LOC_Os12g16800 Oryza sativa LOC_Os12g16800 N 1.000
LOC_Os12g16050 Oryza sativa LOC_Os12g16050 N 1.000
LOC_Os12g15650 Oryza sativa LOC_Os12g15650 N 1.000
LOC_Os11g11170 Oryza sativa LOC_Os11g11170 N 1.000
LOC_Os11g12060 Oryza sativa LOC_Os11g12060 N 0.944
LOC_Os11g12130 Oryza sativa LOC_Os11g12130 N 0.944
LOC_Os11g12200 Oryza sativa LOC_Os11g12200 N 1.000
LOC_Os11g26360 Oryza sativa LOC_Os11g26360 N 1.000
LOC_Os11g26500 Oryza sativa LOC_Os11g26500 N 1.000
LOC_Os11g26540 Oryza sativa LOC_Os11g26540 N 1.000
LOC_Os11g27850 Oryza sativa LOC_Os11g27850 N 0.944
LOC_Os11g33454 Oryza sativa LOC_Os11g33454 N 1.000
LOC_Os11g35680 Oryza sativa LOC_Os11g35680 N 1.000
LOC_Os11g42250 Oryza sativa LOC_Os11g42250 N 1.000
LOC_Os11g44710 Oryza sativa LOC_Os11g44710 N 1.000
LOC_Os12g11110 Oryza sativa LOC_Os12g11110 N 1.000
LOC_Os12g11810 Oryza sativa LOC_Os12g11810 N 1.000
LOC_Os12g35130 Oryza sativa LOC_Os12g35130 N 1.000
13113.t00059 Oryza sativa 13113.t00059 N 1.000
LOC_Os04g04160 Oryza sativa LOC_Os04g04160 N 1.000
LOC_Os04g04900 Oryza sativa LOC_Os04g04900 N 1.000
LOC_Os04g05200 Oryza sativa LOC_Os04g05200 N 1.000
LOC_Os04g05970 Oryza sativa LOC_Os04g05970 N 1.000
LOC_Os04g06080 Oryza sativa LOC_Os04g06080 N 1.000
LOC_Os04g07320 Oryza sativa LOC_Os04g07320 N 1.000
LOC_Os04g07340 Oryza sativa LOC_Os04g07340 N 1.000
LOC_Os04g07470 Oryza sativa LOC_Os04g07470 N 1.000
LOC_Os04g07660 Oryza sativa LOC_Os04g07660 N 1.000
LOC_Os04g07710 Oryza sativa LOC_Os04g07710 N 1.000
LOC_Os04g08540 Oryza sativa LOC_Os04g08540 N 1.000
LOC_Os04g12310 Oryza sativa LOC_Os04g12310 N 1.000
LOC_Os04g18500 Oryza sativa LOC_Os04g18500 N 1.000
LOC_Os04g18600 Oryza sativa LOC_Os04g18600 N 1.000
LOC_Os03g48990 Oryza sativa LOC_Os03g48990 N 1.000
LOC_Os03g26760 Oryza sativa LOC_Os03g26760 N 1.000
LOC_Os03g21350 Oryza sativa LOC_Os03g21350 N 1.000
13113.t00063 Oryza sativa 13113.t00063 N 1.000
LOC_Os01g22180 Oryza sativa LOC_Os01g22180 N 1.000
LOC_Os01g27320 Oryza sativa LOC_Os01g27320 N 1.000
LOC_Os01g28330 Oryza sativa LOC_Os01g28330 N 1.000
LOC_Os01g39200 Oryza sativa LOC_Os01g39200 N 1.000
LOC_Os01g39930 Oryza sativa LOC_Os01g39930 N 1.000
LOC_Os01g45490 Oryza sativa LOC_Os01g45490 N 1.000
LOC_Os01g46632 Oryza sativa LOC_Os01g46632 N 1.000
LOC_Os01g47150 Oryza sativa LOC_Os01g47150 N 1.000
LOC_Os01g60380 Oryza sativa LOC_Os01g60380 N 1.000
LOC_Os01g63080 Oryza sativa LOC_Os01g63080 N 0.944
LOC_Os02g23840 Oryza sativa LOC_Os02g23840 N 1.000
LOC_Os02g38630 Oryza sativa LOC_Os02g38630 N 1.000
LOC_Os04g18884 Oryza sativa LOC_Os04g18884 N 1.000
LOC_Os04g20850 Oryza sativa LOC_Os04g20850 N 1.000
LOC_Os04g21500 Oryza sativa LOC_Os04g21500 N 1.000
LOC_Os06g21050 Oryza sativa LOC_Os06g21050 N 1.000
LOC_Os06g21059 Oryza sativa LOC_Os06g21059 N 1.000
LOC_Os06g32490 Oryza sativa LOC_Os06g32490 N 1.000
LOC_Os06g33950 Oryza sativa LOC_Os06g33950 N 1.000
LOC_Os06g36540 Oryza sativa LOC_Os06g36540 N 1.000
LOC_Os07g10080 Oryza sativa LOC_Os07g10080 N 1.000
LOC_Os07g16400 Oryza sativa LOC_Os07g16400 N 1.000
LOC_Os07g16570 Oryza sativa LOC_Os07g16570 N 1.000
LOC_Os07g16630 Oryza sativa LOC_Os07g16630 N 1.000
LOC_Os07g16770 Oryza sativa LOC_Os07g16770 N 1.000
LOC_Os07g19370 Oryza sativa LOC_Os07g19370 N 1.000
LOC_Os07g20460 Oryza sativa LOC_Os07g20460 N 1.000
LOC_Os07g22410 Oryza sativa LOC_Os07g22410 N 1.000
LOC_Os07g24660 Oryza sativa LOC_Os07g24660 N 0.944
LOC_Os06g19930 Oryza sativa LOC_Os06g19930 N 1.000
LOC_Os06g18800 Oryza sativa LOC_Os06g18800 N 1.000
LOC_Os06g17610 Oryza sativa LOC_Os06g17610 N 1.000
LOC_Os04g22980 Oryza sativa LOC_Os04g22980 N 1.000
LOC_Os04g38090 Oryza sativa LOC_Os04g38090 N 1.000
LOC_Os05g15560 Oryza sativa LOC_Os05g15560 N 1.000
LOC_Os05g17470 Oryza sativa LOC_Os05g17470 N 1.000
LOC_Os05g17570 Oryza sativa LOC_Os05g17570 N 1.000
LOC_Os05g20129 Oryza sativa LOC_Os05g20129 N 1.000
LOC_Os05g20480 Oryza sativa LOC_Os05g20480 N 1.000
LOC_Os05g24680 Oryza sativa LOC_Os05g24680 N 0.944
LOC_Os05g26230 Oryza sativa LOC_Os05g26230 N 0.944
LOC_Os05g26470 Oryza sativa LOC_Os05g26470 N 1.000
LOC_Os06g03250 Oryza sativa LOC_Os06g03250 N 1.000
LOC_Os06g03474 Oryza sativa LOC_Os06g03474 N 1.000
LOC_Os06g07290 Oryza sativa LOC_Os06g07290 N 1.000
LOC_Os06g17520 Oryza sativa LOC_Os06g17520 N 1.000
LOC_Os07g25110 Oryza sativa LOC_Os07g25110 N 0.944