LOC_Os01g21536 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os01g21536 T10735_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os01g21536.1 CCHC ZF 500 514

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

237 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity
Action
LOC_Os05g18480 Oryza sativa LOC_Os05g18480 N 0.933
LOC_Os07g11640 Oryza sativa LOC_Os07g11640 N 0.833
LOC_Os06g42250 Oryza sativa LOC_Os06g42250 N 0.833
LOC_Os07g16520 Oryza sativa LOC_Os07g16520 N 0.833
LOC_Os07g18350 Oryza sativa LOC_Os07g18350 N 0.833
LOC_Os07g24910 Oryza sativa LOC_Os07g24910 N 0.833
LOC_Os07g24660 Oryza sativa LOC_Os07g24660 N 0.833
LOC_Os07g22060 Oryza sativa LOC_Os07g22060 N 0.833
LOC_Os06g25320 Oryza sativa LOC_Os06g25320 N 0.833
LOC_Os05g26230 Oryza sativa LOC_Os05g26230 N 0.833
LOC_Os04g14890 Oryza sativa LOC_Os04g14890 N 0.833
LOC_Os04g14620 Oryza sativa LOC_Os04g14620 N 0.833
LOC_Os05g15580 Oryza sativa LOC_Os05g15580 N 0.833
LOC_Os05g17360 Oryza sativa LOC_Os05g17360 N 0.833
LOC_Os05g19220 Oryza sativa LOC_Os05g19220 N 0.833
LOC_Os05g17420 Oryza sativa LOC_Os05g17420 N 0.833
LOC_Os07g25190 Oryza sativa LOC_Os07g25190 N 0.833
LOC_Os07g25200 Oryza sativa LOC_Os07g25200 N 0.833
LOC_Os11g23960 Oryza sativa LOC_Os11g23960 N 0.833
LOC_Os11g12130 Oryza sativa LOC_Os11g12130 N 0.833
LOC_Os11g12060 Oryza sativa LOC_Os11g12060 N 0.833
LOC_Os11g27850 Oryza sativa LOC_Os11g27850 N 0.833
LOC_Os11g35560 Oryza sativa LOC_Os11g35560 N 0.833
LOC_Os12g27880 Oryza sativa LOC_Os12g27880 N 0.833
LOC_Os12g26780 Oryza sativa LOC_Os12g26780 N 0.833
LOC_Os09g12890 Oryza sativa LOC_Os09g12890 N 0.833
LOC_Os09g09100 Oryza sativa LOC_Os09g09100 N 0.833
LOC_Os07g43630 Oryza sativa LOC_Os07g43630 N 0.833
LOC_Os07g25330 Oryza sativa LOC_Os07g25330 N 0.833
LOC_Os08g11430 Oryza sativa LOC_Os08g11430 N 0.833
LOC_Os08g11830 Oryza sativa LOC_Os08g11830 N 0.833
LOC_Os08g23400 Oryza sativa LOC_Os08g23400 N 0.833
LOC_Os08g12000 Oryza sativa LOC_Os08g12000 N 0.833
LOC_Os04g06360 Oryza sativa LOC_Os04g06360 N 0.833
LOC_Os07g25110 Oryza sativa LOC_Os07g25110 N 0.833
LOC_Os01g35710 Oryza sativa LOC_Os01g35710 N 0.833
LOC_Os03g35830 Oryza sativa LOC_Os03g35830 N 0.833
LOC_Os02g16960 Oryza sativa LOC_Os02g16960 N 0.833
LOC_Os06g31830 Oryza sativa LOC_Os06g31830 N 0.800
LOC_Os10g06550 Oryza sativa LOC_Os10g06550 N 0.778
LOC_Os10g06520 Oryza sativa LOC_Os10g06520 N 0.778
LOC_Os10g03250 Oryza sativa LOC_Os10g03250 N 0.778
LOC_Os01g47150 Oryza sativa LOC_Os01g47150 N 0.778
LOC_Os01g46632 Oryza sativa LOC_Os01g46632 N 0.778
LOC_Os09g13210 Oryza sativa LOC_Os09g13210 N 0.778
LOC_Os10g08180 Oryza sativa LOC_Os10g08180 N 0.778
LOC_Os10g06310 Oryza sativa LOC_Os10g06310 N 0.778
LOC_Os10g11400 Oryza sativa LOC_Os10g11400 N 0.778
LOC_Os10g17900 Oryza sativa LOC_Os10g17900 N 0.778
LOC_Os10g18294 Oryza sativa LOC_Os10g18294 N 0.778
LOC_Os10g18580 Oryza sativa LOC_Os10g18580 N 0.778
LOC_Os10g18650 Oryza sativa LOC_Os10g18650 N 0.778
LOC_Os10g13530 Oryza sativa LOC_Os10g13530 N 0.778
LOC_Os10g13300 Oryza sativa LOC_Os10g13300 N 0.778
LOC_Os09g03440 Oryza sativa LOC_Os09g03440 N 0.778
LOC_Os10g11702 Oryza sativa LOC_Os10g11702 N 0.778
LOC_Os10g12530 Oryza sativa LOC_Os10g12530 N 0.778
LOC_Os10g10600 Oryza sativa LOC_Os10g10600 N 0.778
LOC_Os09g01230 Oryza sativa LOC_Os09g01230 N 0.778
LOC_Os04g06080 Oryza sativa LOC_Os04g06080 N 0.778
LOC_Os08g12470 Oryza sativa LOC_Os08g12470 N 0.778
LOC_Os08g12540 Oryza sativa LOC_Os08g12540 N 0.778
LOC_Os08g14250 Oryza sativa LOC_Os08g14250 N 0.778
LOC_Os08g11850 Oryza sativa LOC_Os08g11850 N 0.778
LOC_Os02g16190 Oryza sativa LOC_Os02g16190 N 0.778
LOC_Os08g05180 Oryza sativa LOC_Os08g05180 N 0.778
LOC_Os08g06990 Oryza sativa LOC_Os08g06990 N 0.778
LOC_Os08g09140 Oryza sativa LOC_Os08g09140 N 0.778
LOC_Os08g16180 Oryza sativa LOC_Os08g16180 N 0.778
LOC_Os08g20770 Oryza sativa LOC_Os08g20770 N 0.778
LOC_Os08g24220 Oryza sativa LOC_Os08g24220 N 0.778
LOC_Os08g26910 Oryza sativa LOC_Os08g26910 N 0.778
LOC_Os08g27110 Oryza sativa LOC_Os08g27110 N 0.778
LOC_Os09g01070 Oryza sativa LOC_Os09g01070 N 0.778
LOC_Os01g60380 Oryza sativa LOC_Os01g60380 N 0.778
LOC_Os08g22990 Oryza sativa LOC_Os08g22990 N 0.778
LOC_Os08g21110 Oryza sativa LOC_Os08g21110 N 0.778
LOC_Os08g21360 Oryza sativa LOC_Os08g21360 N 0.778
LOC_Os08g22960 Oryza sativa LOC_Os08g22960 N 0.778
LOC_Os10g20190 Oryza sativa LOC_Os10g20190 N 0.778
LOC_Os11g11170 Oryza sativa LOC_Os11g11170 N 0.778
LOC_Os12g26610 Oryza sativa LOC_Os12g26610 N 0.778
LOC_Os01g28330 Oryza sativa LOC_Os01g28330 N 0.778
LOC_Os12g26830 Oryza sativa LOC_Os12g26830 N 0.778
LOC_Os12g27140 Oryza sativa LOC_Os12g27140 N 0.778
LOC_Os12g25980 Oryza sativa LOC_Os12g25980 N 0.778
LOC_Os12g24364 Oryza sativa LOC_Os12g24364 N 0.778
LOC_Os12g16050 Oryza sativa LOC_Os12g16050 N 0.778
LOC_Os12g16800 Oryza sativa LOC_Os12g16800 N 0.778
LOC_Os12g20060 Oryza sativa LOC_Os12g20060 N 0.778
LOC_Os12g20110 Oryza sativa LOC_Os12g20110 N 0.778
LOC_Os01g27320 Oryza sativa LOC_Os01g27320 N 0.778
LOC_Os12g28220 Oryza sativa LOC_Os12g28220 N 0.778
LOC_Os12g33910 Oryza sativa LOC_Os12g33910 N 0.778
LOC_Os12g35130 Oryza sativa LOC_Os12g35130 N 0.778
13113.t00059 Oryza sativa 13113.t00059 N 0.778
13113.t00063 Oryza sativa 13113.t00063 N 0.778
LOC_Os12g33450 Oryza sativa LOC_Os12g33450 N 0.778
LOC_Os12g31250 Oryza sativa LOC_Os12g31250 N 0.778
LOC_Os12g28970 Oryza sativa LOC_Os12g28970 N 0.778
LOC_Os12g29000 Oryza sativa LOC_Os12g29000 N 0.778
LOC_Os12g30400 Oryza sativa LOC_Os12g30400 N 0.778
LOC_Os12g15650 Oryza sativa LOC_Os12g15650 N 0.778
LOC_Os12g11810 Oryza sativa LOC_Os12g11810 N 0.778
LOC_Os11g19430 Oryza sativa LOC_Os11g19430 N 0.778
LOC_Os11g21790 Oryza sativa LOC_Os11g21790 N 0.778
LOC_Os11g21870 Oryza sativa LOC_Os11g21870 N 0.778
LOC_Os11g22540 Oryza sativa LOC_Os11g22540 N 0.778
LOC_Os11g14610 Oryza sativa LOC_Os11g14610 N 0.778
LOC_Os11g12200 Oryza sativa LOC_Os11g12200 N 0.778
LOC_Os07g45830 Oryza sativa LOC_Os07g45830 N 0.778
LOC_Os01g45490 Oryza sativa LOC_Os01g45490 N 0.778
LOC_Os01g39930 Oryza sativa LOC_Os01g39930 N 0.778
LOC_Os11g22550 Oryza sativa LOC_Os11g22550 N 0.778
LOC_Os01g39200 Oryza sativa LOC_Os01g39200 N 0.778
LOC_Os11g42250 Oryza sativa LOC_Os11g42250 N 0.778
LOC_Os11g42650 Oryza sativa LOC_Os11g42650 N 0.778
LOC_Os11g44710 Oryza sativa LOC_Os11g44710 N 0.778
LOC_Os12g11110 Oryza sativa LOC_Os12g11110 N 0.778
LOC_Os11g35680 Oryza sativa LOC_Os11g35680 N 0.778
LOC_Os11g33454 Oryza sativa LOC_Os11g33454 N 0.778
LOC_Os11g26360 Oryza sativa LOC_Os11g26360 N 0.778
LOC_Os11g26500 Oryza sativa LOC_Os11g26500 N 0.778
LOC_Os11g26540 Oryza sativa LOC_Os11g26540 N 0.778
LOC_Os10g23880 Oryza sativa LOC_Os10g23880 N 0.778
LOC_Os08g11980 Oryza sativa LOC_Os08g11980 N 0.778
LOC_Os05g20129 Oryza sativa LOC_Os05g20129 N 0.778
LOC_Os05g20480 Oryza sativa LOC_Os05g20480 N 0.778
LOC_Os03g45550 Oryza sativa LOC_Os03g45550 N 0.778
LOC_Os05g26470 Oryza sativa LOC_Os05g26470 N 0.778
LOC_Os03g48990 Oryza sativa LOC_Os03g48990 N 0.778
LOC_Os05g17570 Oryza sativa LOC_Os05g17570 N 0.778
LOC_Os04g04900 Oryza sativa LOC_Os04g04900 N 0.778
LOC_Os04g04160 Oryza sativa LOC_Os04g04160 N 0.778
LOC_Os05g17470 Oryza sativa LOC_Os05g17470 N 0.778
LOC_Os06g03250 Oryza sativa LOC_Os06g03250 N 0.778
LOC_Os06g03474 Oryza sativa LOC_Os06g03474 N 0.778
LOC_Os06g21050 Oryza sativa LOC_Os06g21050 N 0.778
LOC_Os06g21059 Oryza sativa LOC_Os06g21059 N 0.778
LOC_Os06g32010 Oryza sativa LOC_Os06g32010 N 0.778
LOC_Os06g32490 Oryza sativa LOC_Os06g32490 N 0.778
LOC_Os06g19930 Oryza sativa LOC_Os06g19930 N 0.778
LOC_Os06g18800 Oryza sativa LOC_Os06g18800 N 0.778
LOC_Os06g07290 Oryza sativa LOC_Os06g07290 N 0.778
LOC_Os06g17520 Oryza sativa LOC_Os06g17520 N 0.778
LOC_Os07g45610 Oryza sativa LOC_Os07g45610 N 0.778
LOC_Os05g15560 Oryza sativa LOC_Os05g15560 N 0.778
LOC_Os04g56890 Oryza sativa LOC_Os04g56890 N 0.778
LOC_Os04g07710 Oryza sativa LOC_Os04g07710 N 0.778
LOC_Os04g08540 Oryza sativa LOC_Os04g08540 N 0.778
LOC_Os04g08832 Oryza sativa LOC_Os04g08832 N 0.778
LOC_Os04g12310 Oryza sativa LOC_Os04g12310 N 0.778
LOC_Os04g07660 Oryza sativa LOC_Os04g07660 N 0.778
LOC_Os04g07470 Oryza sativa LOC_Os04g07470 N 0.778
LOC_Os04g05970 Oryza sativa LOC_Os04g05970 N 0.778
LOC_Os04g07320 Oryza sativa LOC_Os04g07320 N 0.778
LOC_Os04g07340 Oryza sativa LOC_Os04g07340 N 0.778
LOC_Os04g05200 Oryza sativa LOC_Os04g05200 N 0.778
LOC_Os04g18500 Oryza sativa LOC_Os04g18500 N 0.778
LOC_Os04g22980 Oryza sativa LOC_Os04g22980 N 0.778
LOC_Os04g29330 Oryza sativa LOC_Os04g29330 N 0.778
LOC_Os04g38090 Oryza sativa LOC_Os04g38090 N 0.778
LOC_Os04g21500 Oryza sativa LOC_Os04g21500 N 0.778
LOC_Os04g20850 Oryza sativa LOC_Os04g20850 N 0.778
LOC_Os04g18600 Oryza sativa LOC_Os04g18600 N 0.778
LOC_Os04g18884 Oryza sativa LOC_Os04g18884 N 0.778
LOC_Os04g18900 Oryza sativa LOC_Os04g18900 N 0.778
LOC_Os06g33950 Oryza sativa LOC_Os06g33950 N 0.778
LOC_Os06g17610 Oryza sativa LOC_Os06g17610 N 0.778
LOC_Os07g16570 Oryza sativa LOC_Os07g16570 N 0.778
LOC_Os07g25040 Oryza sativa LOC_Os07g25040 N 0.778
LOC_Os01g22180 Oryza sativa LOC_Os01g22180 N 0.778
LOC_Os07g20460 Oryza sativa LOC_Os07g20460 N 0.778
LOC_Os07g16400 Oryza sativa LOC_Os07g16400 N 0.778
LOC_Os02g38630 Oryza sativa LOC_Os02g38630 N 0.778
LOC_Os07g16630 Oryza sativa LOC_Os07g16630 N 0.778
LOC_Os07g17810 Oryza sativa LOC_Os07g17810 N 0.778
LOC_Os07g19370 Oryza sativa LOC_Os07g19370 N 0.778
LOC_Os07g16770 Oryza sativa LOC_Os07g16770 N 0.778
LOC_Os07g22410 Oryza sativa LOC_Os07g22410 N 0.778
LOC_Os03g21350 Oryza sativa LOC_Os03g21350 N 0.778
LOC_Os03g35430 Oryza sativa LOC_Os03g35430 N 0.778
LOC_Os03g26760 Oryza sativa LOC_Os03g26760 N 0.778
LOC_Os07g30310 Oryza sativa LOC_Os07g30310 N 0.778
LOC_Os02g23840 Oryza sativa LOC_Os02g23840 N 0.778
LOC_Os07g28200 Oryza sativa LOC_Os07g28200 N 0.778
LOC_Os06g40260 Oryza sativa LOC_Os06g40260 N 0.778
LOC_Os06g36540 Oryza sativa LOC_Os06g36540 N 0.778
LOC_Os07g10080 Oryza sativa LOC_Os07g10080 N 0.778
LOC_Os09g02990 Oryza sativa LOC_Os09g02990 N 0.733
LOC_Os12g43230 Oryza sativa LOC_Os12g43230 N 0.722
LOC_Os12g43050 Oryza sativa LOC_Os12g43050 N 0.722
13114.t00077 Oryza sativa 13114.t00077 N 0.722
LOC_Os04g19660 Oryza sativa LOC_Os04g19660 N 0.722
LOC_Os03g23110 Oryza sativa LOC_Os03g23110 N 0.722
LOC_Os04g06130 Oryza sativa LOC_Os04g06130 N 0.722
LOC_Os08g17890 Oryza sativa LOC_Os08g17890 N 0.722
LOC_Os12g22380 Oryza sativa LOC_Os12g22380 N 0.722
LOC_Os01g63080 Oryza sativa LOC_Os01g63080 N 0.722
LOC_Os04g12210 Oryza sativa LOC_Os04g12210 N 0.722
LOC_Os08g11960 Oryza sativa LOC_Os08g11960 N 0.722
LOC_Os02g25180 Oryza sativa LOC_Os02g25180 N 0.722
LOC_Os02g04940 Oryza sativa LOC_Os02g04940 N 0.722
LOC_Os04g13810 Oryza sativa LOC_Os04g13810 N 0.722
LOC_Os04g05290 Oryza sativa LOC_Os04g05290 N 0.722
LOC_Os12g34650 Oryza sativa LOC_Os12g34650 N 0.722
LOC_Os02g18340 Oryza sativa LOC_Os02g18340 N 0.722
LOC_Os08g11800 Oryza sativa LOC_Os08g11800 N 0.722
LOC_Os04g18750 Oryza sativa LOC_Os04g18750 N 0.722
LOC_Os04g04550 Oryza sativa LOC_Os04g04550 N 0.722
LOC_Os10g17350 Oryza sativa LOC_Os10g17350 N 0.722
LOC_Os10g17170 Oryza sativa LOC_Os10g17170 N 0.722
LOC_Os09g23860 Oryza sativa LOC_Os09g23860 N 0.722
LOC_Os07g11800 Oryza sativa LOC_Os07g11800 N 0.722
LOC_Os10g24540 Oryza sativa LOC_Os10g24540 N 0.722
LOC_Os06g35220 Oryza sativa LOC_Os06g35220 N 0.722
LOC_Os10g09060 Oryza sativa LOC_Os10g09060 N 0.722
LOC_Os10g09460 Oryza sativa LOC_Os10g09460 N 0.722
LOC_Os10g09500 Oryza sativa LOC_Os10g09500 N 0.722
LOC_Os10g09440 Oryza sativa LOC_Os10g09440 N 0.722
LOC_Os10g12160 Oryza sativa LOC_Os10g12160 N 0.722
LOC_Os03g41960 Oryza sativa LOC_Os03g41960 N 0.722
LOC_Os07g16240 Oryza sativa LOC_Os07g16240 N 0.722
LOC_Os05g24680 Oryza sativa LOC_Os05g24680 N 0.722
LOC_Os07g16700 Oryza sativa LOC_Os07g16700 N 0.722
LOC_Os07g16590 Oryza sativa LOC_Os07g16590 N 0.722
LOC_Os10g09970 Oryza sativa LOC_Os10g09970 N 0.722
LOC_Os01g35070 Oryza sativa LOC_Os01g35070 N 0.722
LOC_Os07g16860 Oryza sativa LOC_Os07g16860 N 0.722
LOC_Os05g17630 Oryza sativa LOC_Os05g17630 N 0.722
LOC_Os04g03190 Oryza sativa LOC_Os04g03190 N 0.722
LOC_Os11g15690 Oryza sativa LOC_Os11g15690 N 0.722
LOC_Os05g22810 Oryza sativa LOC_Os05g22810 N 0.722
LOC_Os05g19900 Oryza sativa LOC_Os05g19900 N 0.722
LOC_Os05g19650 Oryza sativa LOC_Os05g19650 N 0.722
LOC_Os09g01100 Oryza sativa LOC_Os09g01100 N 0.722
LOC_Os03g23780 Oryza sativa LOC_Os03g23780 N 0.722