LOC_Os05g19900 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os05g19900 T11465_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os05g19900.1 CCHC ZF 526 543

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

263 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os09g01070 Oryza sativa LOC_Os09g01070 N 0.944
LOC_Os11g26360 Oryza sativa LOC_Os11g26360 N 0.944
LOC_Os09g01230 Oryza sativa LOC_Os09g01230 N 0.944
LOC_Os08g27110 Oryza sativa LOC_Os08g27110 N 0.944
LOC_Os08g26910 Oryza sativa LOC_Os08g26910 N 0.944
LOC_Os02g38630 Oryza sativa LOC_Os02g38630 N 0.944
LOC_Os02g23840 Oryza sativa LOC_Os02g23840 N 0.944
LOC_Os02g16190 Oryza sativa LOC_Os02g16190 N 0.944
LOC_Os02g04940 Oryza sativa LOC_Os02g04940 N 0.944
LOC_Os10g03250 Oryza sativa LOC_Os10g03250 N 0.944
LOC_Os01g46632 Oryza sativa LOC_Os01g46632 N 0.944
LOC_Os01g47150 Oryza sativa LOC_Os01g47150 N 0.944
LOC_Os09g13210 Oryza sativa LOC_Os09g13210 N 0.944
LOC_Os12g26830 Oryza sativa LOC_Os12g26830 N 0.944
LOC_Os01g60380 Oryza sativa LOC_Os01g60380 N 0.944
LOC_Os08g22990 Oryza sativa LOC_Os08g22990 N 0.944
LOC_Os08g22960 Oryza sativa LOC_Os08g22960 N 0.944
LOC_Os11g26500 Oryza sativa LOC_Os11g26500 N 0.944
LOC_Os08g12470 Oryza sativa LOC_Os08g12470 N 0.944
LOC_Os03g26760 Oryza sativa LOC_Os03g26760 N 0.944
LOC_Os08g11980 Oryza sativa LOC_Os08g11980 N 0.944
LOC_Os08g11850 Oryza sativa LOC_Os08g11850 N 0.944
LOC_Os11g26540 Oryza sativa LOC_Os11g26540 N 0.944
LOC_Os08g12540 Oryza sativa LOC_Os08g12540 N 0.944
LOC_Os08g14250 Oryza sativa LOC_Os08g14250 N 0.944
LOC_Os08g21360 Oryza sativa LOC_Os08g21360 N 0.944
LOC_Os03g21350 Oryza sativa LOC_Os03g21350 N 0.944
LOC_Os08g21110 Oryza sativa LOC_Os08g21110 N 0.944
LOC_Os08g20770 Oryza sativa LOC_Os08g20770 N 0.944
LOC_Os08g16180 Oryza sativa LOC_Os08g16180 N 0.944
LOC_Os12g20060 Oryza sativa LOC_Os12g20060 N 0.944
LOC_Os10g06520 Oryza sativa LOC_Os10g06520 N 0.944
LOC_Os10g06550 Oryza sativa LOC_Os10g06550 N 0.944
LOC_Os12g28220 Oryza sativa LOC_Os12g28220 N 0.944
LOC_Os12g35130 Oryza sativa LOC_Os12g35130 N 0.944
LOC_Os10g20190 Oryza sativa LOC_Os10g20190 N 0.944
LOC_Os10g18650 Oryza sativa LOC_Os10g18650 N 0.944
LOC_Os10g18294 Oryza sativa LOC_Os10g18294 N 0.944
LOC_Os10g18580 Oryza sativa LOC_Os10g18580 N 0.944
LOC_Os11g11170 Oryza sativa LOC_Os11g11170 N 0.944
LOC_Os12g33910 Oryza sativa LOC_Os12g33910 N 0.944
LOC_Os12g29000 Oryza sativa LOC_Os12g29000 N 0.944
LOC_Os12g28970 Oryza sativa LOC_Os12g28970 N 0.944
LOC_Os12g30400 Oryza sativa LOC_Os12g30400 N 0.944
LOC_Os12g31250 Oryza sativa LOC_Os12g31250 N 0.944
LOC_Os12g33450 Oryza sativa LOC_Os12g33450 N 0.944
LOC_Os11g12200 Oryza sativa LOC_Os11g12200 N 0.944
13113.t00059 Oryza sativa 13113.t00059 N 0.944
13113.t00063 Oryza sativa 13113.t00063 N 0.944
LOC_Os12g27140 Oryza sativa LOC_Os12g27140 N 0.944
LOC_Os01g28330 Oryza sativa LOC_Os01g28330 N 0.944
LOC_Os01g39200 Oryza sativa LOC_Os01g39200 N 0.944
LOC_Os01g39930 Oryza sativa LOC_Os01g39930 N 0.944
LOC_Os10g08180 Oryza sativa LOC_Os10g08180 N 0.944
LOC_Os01g45490 Oryza sativa LOC_Os01g45490 N 0.944
LOC_Os10g10600 Oryza sativa LOC_Os10g10600 N 0.944
LOC_Os10g11400 Oryza sativa LOC_Os10g11400 N 0.944
LOC_Os10g13530 Oryza sativa LOC_Os10g13530 N 0.944
LOC_Os01g22180 Oryza sativa LOC_Os01g22180 N 0.944
LOC_Os10g13300 Oryza sativa LOC_Os10g13300 N 0.944
LOC_Os10g12530 Oryza sativa LOC_Os10g12530 N 0.944
LOC_Os10g11702 Oryza sativa LOC_Os10g11702 N 0.944
LOC_Os01g27320 Oryza sativa LOC_Os01g27320 N 0.944
LOC_Os05g20129 Oryza sativa LOC_Os05g20129 N 0.944
LOC_Os03g48990 Oryza sativa LOC_Os03g48990 N 0.944
LOC_Os06g32010 Oryza sativa LOC_Os06g32010 N 0.944
LOC_Os04g38090 Oryza sativa LOC_Os04g38090 N 0.944
LOC_Os06g32490 Oryza sativa LOC_Os06g32490 N 0.944
LOC_Os05g15560 Oryza sativa LOC_Os05g15560 N 0.944
LOC_Os12g11810 Oryza sativa LOC_Os12g11810 N 0.944
LOC_Os12g15650 Oryza sativa LOC_Os12g15650 N 0.944
LOC_Os12g24364 Oryza sativa LOC_Os12g24364 N 0.944
LOC_Os04g22980 Oryza sativa LOC_Os04g22980 N 0.944
LOC_Os06g33950 Oryza sativa LOC_Os06g33950 N 0.944
LOC_Os04g18884 Oryza sativa LOC_Os04g18884 N 0.944
LOC_Os07g10080 Oryza sativa LOC_Os07g10080 N 0.944
LOC_Os12g11110 Oryza sativa LOC_Os12g11110 N 0.944
LOC_Os04g20850 Oryza sativa LOC_Os04g20850 N 0.944
LOC_Os04g21500 Oryza sativa LOC_Os04g21500 N 0.944
LOC_Os06g36540 Oryza sativa LOC_Os06g36540 N 0.944
LOC_Os06g21059 Oryza sativa LOC_Os06g21059 N 0.944
LOC_Os06g21050 Oryza sativa LOC_Os06g21050 N 0.944
LOC_Os05g26470 Oryza sativa LOC_Os05g26470 N 0.944
LOC_Os05g17570 Oryza sativa LOC_Os05g17570 N 0.944
LOC_Os12g16050 Oryza sativa LOC_Os12g16050 N 0.944
LOC_Os12g16800 Oryza sativa LOC_Os12g16800 N 0.944
LOC_Os05g20480 Oryza sativa LOC_Os05g20480 N 0.944
LOC_Os12g20110 Oryza sativa LOC_Os12g20110 N 0.944
LOC_Os06g03250 Oryza sativa LOC_Os06g03250 N 0.944
LOC_Os06g03474 Oryza sativa LOC_Os06g03474 N 0.944
LOC_Os06g18800 Oryza sativa LOC_Os06g18800 N 0.944
LOC_Os06g19930 Oryza sativa LOC_Os06g19930 N 0.944
LOC_Os05g17470 Oryza sativa LOC_Os05g17470 N 0.944
LOC_Os06g17610 Oryza sativa LOC_Os06g17610 N 0.944
LOC_Os06g07290 Oryza sativa LOC_Os06g07290 N 0.944
LOC_Os06g17520 Oryza sativa LOC_Os06g17520 N 0.944
LOC_Os04g18750 Oryza sativa LOC_Os04g18750 N 0.944
LOC_Os04g18600 Oryza sativa LOC_Os04g18600 N 0.944
LOC_Os04g06080 Oryza sativa LOC_Os04g06080 N 0.944
LOC_Os04g05970 Oryza sativa LOC_Os04g05970 N 0.944
LOC_Os12g26610 Oryza sativa LOC_Os12g26610 N 0.944
LOC_Os11g35680 Oryza sativa LOC_Os11g35680 N 0.944
LOC_Os11g42250 Oryza sativa LOC_Os11g42250 N 0.944
LOC_Os04g07340 Oryza sativa LOC_Os04g07340 N 0.944
LOC_Os04g07320 Oryza sativa LOC_Os04g07320 N 0.944
LOC_Os04g05200 Oryza sativa LOC_Os04g05200 N 0.944
LOC_Os07g30310 Oryza sativa LOC_Os07g30310 N 0.944
LOC_Os08g06990 Oryza sativa LOC_Os08g06990 N 0.944
LOC_Os08g09140 Oryza sativa LOC_Os08g09140 N 0.944
LOC_Os08g05180 Oryza sativa LOC_Os08g05180 N 0.944
LOC_Os11g33454 Oryza sativa LOC_Os11g33454 N 0.944
LOC_Os04g04900 Oryza sativa LOC_Os04g04900 N 0.944
LOC_Os07g45610 Oryza sativa LOC_Os07g45610 N 0.944
LOC_Os04g04160 Oryza sativa LOC_Os04g04160 N 0.944
LOC_Os07g22410 Oryza sativa LOC_Os07g22410 N 0.944
LOC_Os12g25980 Oryza sativa LOC_Os12g25980 N 0.944
LOC_Os07g16630 Oryza sativa LOC_Os07g16630 N 0.944
LOC_Os07g16570 Oryza sativa LOC_Os07g16570 N 0.944
LOC_Os11g44710 Oryza sativa LOC_Os11g44710 N 0.944
LOC_Os04g18500 Oryza sativa LOC_Os04g18500 N 0.944
LOC_Os07g16400 Oryza sativa LOC_Os07g16400 N 0.944
LOC_Os04g12310 Oryza sativa LOC_Os04g12310 N 0.944
LOC_Os07g16770 Oryza sativa LOC_Os07g16770 N 0.944
LOC_Os07g20460 Oryza sativa LOC_Os07g20460 N 0.944
LOC_Os04g07470 Oryza sativa LOC_Os04g07470 N 0.944
LOC_Os07g19370 Oryza sativa LOC_Os07g19370 N 0.944
LOC_Os04g07660 Oryza sativa LOC_Os04g07660 N 0.944
LOC_Os04g08540 Oryza sativa LOC_Os04g08540 N 0.944
LOC_Os04g07710 Oryza sativa LOC_Os04g07710 N 0.944
LOC_Os12g26780 Oryza sativa LOC_Os12g26780 N 0.889
LOC_Os12g27880 Oryza sativa LOC_Os12g27880 N 0.889
LOC_Os03g23110 Oryza sativa LOC_Os03g23110 N 0.889
LOC_Os05g15580 Oryza sativa LOC_Os05g15580 N 0.889
LOC_Os04g19660 Oryza sativa LOC_Os04g19660 N 0.889
LOC_Os04g14890 Oryza sativa LOC_Os04g14890 N 0.889
LOC_Os04g14620 Oryza sativa LOC_Os04g14620 N 0.889
LOC_Os05g17360 Oryza sativa LOC_Os05g17360 N 0.889
LOC_Os05g17420 Oryza sativa LOC_Os05g17420 N 0.889
LOC_Os05g19650 Oryza sativa LOC_Os05g19650 N 0.889
LOC_Os05g19220 Oryza sativa LOC_Os05g19220 N 0.889
LOC_Os05g17630 Oryza sativa LOC_Os05g17630 N 0.889
LOC_Os04g06360 Oryza sativa LOC_Os04g06360 N 0.889
LOC_Os04g06130 Oryza sativa LOC_Os04g06130 N 0.889
LOC_Os02g16960 Oryza sativa LOC_Os02g16960 N 0.889
LOC_Os01g63080 Oryza sativa LOC_Os01g63080 N 0.889
LOC_Os01g35710 Oryza sativa LOC_Os01g35710 N 0.889
13114.t00077 Oryza sativa 13114.t00077 N 0.889
LOC_Os03g23780 Oryza sativa LOC_Os03g23780 N 0.889
LOC_Os03g35830 Oryza sativa LOC_Os03g35830 N 0.889
LOC_Os04g05290 Oryza sativa LOC_Os04g05290 N 0.889
LOC_Os04g04550 Oryza sativa LOC_Os04g04550 N 0.889
LOC_Os03g41960 Oryza sativa LOC_Os03g41960 N 0.889
LOC_Os12g43230 Oryza sativa LOC_Os12g43230 N 0.889
LOC_Os11g21790 Oryza sativa LOC_Os11g21790 N 0.889
LOC_Os08g11430 Oryza sativa LOC_Os08g11430 N 0.889
LOC_Os08g11830 Oryza sativa LOC_Os08g11830 N 0.889
LOC_Os08g12000 Oryza sativa LOC_Os08g12000 N 0.889
LOC_Os07g43630 Oryza sativa LOC_Os07g43630 N 0.889
LOC_Os07g25330 Oryza sativa LOC_Os07g25330 N 0.889
LOC_Os07g25190 Oryza sativa LOC_Os07g25190 N 0.889
LOC_Os07g25200 Oryza sativa LOC_Os07g25200 N 0.889
LOC_Os08g23400 Oryza sativa LOC_Os08g23400 N 0.889
LOC_Os09g01100 Oryza sativa LOC_Os09g01100 N 0.889
LOC_Os10g09060 Oryza sativa LOC_Os10g09060 N 0.889
LOC_Os10g09440 Oryza sativa LOC_Os10g09440 N 0.889
LOC_Os10g06310 Oryza sativa LOC_Os10g06310 N 0.889
LOC_Os09g23860 Oryza sativa LOC_Os09g23860 N 0.889
LOC_Os09g09100 Oryza sativa LOC_Os09g09100 N 0.889
LOC_Os09g12890 Oryza sativa LOC_Os09g12890 N 0.889
LOC_Os07g25110 Oryza sativa LOC_Os07g25110 N 0.889
LOC_Os07g24660 Oryza sativa LOC_Os07g24660 N 0.889
LOC_Os06g40260 Oryza sativa LOC_Os06g40260 N 0.889
LOC_Os06g42250 Oryza sativa LOC_Os06g42250 N 0.889
LOC_Os06g25320 Oryza sativa LOC_Os06g25320 N 0.889
LOC_Os05g26230 Oryza sativa LOC_Os05g26230 N 0.889
LOC_Os05g22810 Oryza sativa LOC_Os05g22810 N 0.889
LOC_Os05g24680 Oryza sativa LOC_Os05g24680 N 0.889
LOC_Os07g11640 Oryza sativa LOC_Os07g11640 N 0.889
LOC_Os07g11800 Oryza sativa LOC_Os07g11800 N 0.889
LOC_Os07g18350 Oryza sativa LOC_Os07g18350 N 0.889
LOC_Os07g22060 Oryza sativa LOC_Os07g22060 N 0.889
LOC_Os07g16860 Oryza sativa LOC_Os07g16860 N 0.889
LOC_Os07g16700 Oryza sativa LOC_Os07g16700 N 0.889
LOC_Os07g16520 Oryza sativa LOC_Os07g16520 N 0.889
LOC_Os07g16590 Oryza sativa LOC_Os07g16590 N 0.889
LOC_Os10g09460 Oryza sativa LOC_Os10g09460 N 0.889
LOC_Os08g11960 Oryza sativa LOC_Os08g11960 N 0.889
LOC_Os11g42650 Oryza sativa LOC_Os11g42650 N 0.889
LOC_Os10g24540 Oryza sativa LOC_Os10g24540 N 0.889
LOC_Os11g22550 Oryza sativa LOC_Os11g22550 N 0.889
LOC_Os10g17900 Oryza sativa LOC_Os10g17900 N 0.889
LOC_Os11g12060 Oryza sativa LOC_Os11g12060 N 0.889
LOC_Os10g09500 Oryza sativa LOC_Os10g09500 N 0.889
LOC_Os10g17350 Oryza sativa LOC_Os10g17350 N 0.889
LOC_Os11g12130 Oryza sativa LOC_Os11g12130 N 0.889
LOC_Os11g35560 Oryza sativa LOC_Os11g35560 N 0.889
LOC_Os11g27850 Oryza sativa LOC_Os11g27850 N 0.889
LOC_Os10g09970 Oryza sativa LOC_Os10g09970 N 0.889
LOC_Os10g12160 Oryza sativa LOC_Os10g12160 N 0.889
LOC_Os11g23960 Oryza sativa LOC_Os11g23960 N 0.889
LOC_Os10g17170 Oryza sativa LOC_Os10g17170 N 0.889
LOC_Os07g45830 Oryza sativa LOC_Os07g45830 N 0.833
LOC_Os07g24910 Oryza sativa LOC_Os07g24910 N 0.833
LOC_Os07g28200 Oryza sativa LOC_Os07g28200 N 0.833
LOC_Os11g21870 Oryza sativa LOC_Os11g21870 N 0.833
LOC_Os04g56890 Oryza sativa LOC_Os04g56890 N 0.833
LOC_Os04g18900 Oryza sativa LOC_Os04g18900 N 0.833
LOC_Os04g29330 Oryza sativa LOC_Os04g29330 N 0.833
LOC_Os11g22540 Oryza sativa LOC_Os11g22540 N 0.833
LOC_Os04g13810 Oryza sativa LOC_Os04g13810 N 0.833
LOC_Os04g08832 Oryza sativa LOC_Os04g08832 N 0.833
LOC_Os04g12210 Oryza sativa LOC_Os04g12210 N 0.833
LOC_Os11g14610 Oryza sativa LOC_Os11g14610 N 0.833
LOC_Os10g23880 Oryza sativa LOC_Os10g23880 N 0.833
LOC_Os08g24220 Oryza sativa LOC_Os08g24220 N 0.833
LOC_Os05g18340 Oryza sativa LOC_Os05g18340 N 0.833
LOC_Os03g35430 Oryza sativa LOC_Os03g35430 N 0.833
LOC_Os03g45550 Oryza sativa LOC_Os03g45550 N 0.833
LOC_Os08g11800 Oryza sativa LOC_Os08g11800 N 0.833
LOC_Os11g15690 Oryza sativa LOC_Os11g15690 N 0.778
LOC_Os11g19430 Oryza sativa LOC_Os11g19430 N 0.778
LOC_Os02g25180 Oryza sativa LOC_Os02g25180 N 0.778
LOC_Os02g18340 Oryza sativa LOC_Os02g18340 N 0.778
LOC_Os06g35220 Oryza sativa LOC_Os06g35220 N 0.778
LOC_Os01g35070 Oryza sativa LOC_Os01g35070 N 0.778
LOC_Os09g03440 Oryza sativa LOC_Os09g03440 N 0.778
LOC_Os04g03190 Oryza sativa LOC_Os04g03190 N 0.778
LOC_Os07g16240 Oryza sativa LOC_Os07g16240 N 0.778
LOC_Os06g18090 Oryza sativa LOC_Os06g18090 N 0.778
LOC_Os12g19620 Oryza sativa LOC_Os12g19620 N 0.778
LOC_Os12g43050 Oryza sativa LOC_Os12g43050 N 0.778
LOC_Os07g25040 Oryza sativa LOC_Os07g25040 N 0.778
LOC_Os08g17890 Oryza sativa LOC_Os08g17890 N 0.778
LOC_Os07g17810 Oryza sativa LOC_Os07g17810 N 0.778
LOC_Os06g32120 Oryza sativa LOC_Os06g32120 N 0.722
LOC_Os04g53890 Oryza sativa LOC_Os04g53890 N 0.722
LOC_Os12g22380 Oryza sativa LOC_Os12g22380 N 0.722
LOC_Os04g55320 Oryza sativa LOC_Os04g55320 N 0.722
LOC_Os05g16850 Oryza sativa LOC_Os05g16850 N 0.722
LOC_Os06g31640 Oryza sativa LOC_Os06g31640 N 0.722
LOC_Os06g21640 Oryza sativa LOC_Os06g21640 N 0.722
LOC_Os05g37230 Oryza sativa LOC_Os05g37230 N 0.722
LOC_Os06g24790 Oryza sativa LOC_Os06g24790 N 0.722
LOC_Os05g04790 Oryza sativa LOC_Os05g04790 N 0.722
LOC_Os05g18480 Oryza sativa LOC_Os05g18480 N 0.722
LOC_Os12g14430 Oryza sativa LOC_Os12g14430 N 0.722
LOC_Os12g33690 Oryza sativa LOC_Os12g33690 N 0.722
LOC_Os02g19840 Oryza sativa LOC_Os02g19840 N 0.722
13114.t00078 Oryza sativa 13114.t00078 N 0.722
LOC_Os03g15450 Oryza sativa LOC_Os03g15450 N 0.722
LOC_Os02g18520 Oryza sativa LOC_Os02g18520 N 0.722
LOC_Os01g21536 Oryza sativa LOC_Os01g21536 N 0.722
LOC_Os01g35140 Oryza sativa LOC_Os01g35140 N 0.722
LOC_Os09g01450 Oryza sativa LOC_Os09g01450 N 0.722
LOC_Os08g21860 Oryza sativa LOC_Os08g21860 N 0.722
LOC_Os08g12210 Oryza sativa LOC_Os08g12210 N 0.722
LOC_Os06g48440 Oryza sativa LOC_Os06g48440 N 0.722
LOC_Os06g32820 Oryza sativa LOC_Os06g32820 N 0.722
LOC_Os11g14650 Oryza sativa LOC_Os11g14650 N 0.722
LOC_Os12g34650 Oryza sativa LOC_Os12g34650 N 0.722
LOC_Os03g39450 Oryza sativa LOC_Os03g39450 N 0.722
LOC_Os10g17360 Oryza sativa LOC_Os10g17360 N 0.722
LOC_Os04g34260 Oryza sativa LOC_Os04g34260 N 0.722