LOC_Os05g01130 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os05g01130 T11347_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os05g01130.1 CCHC ZF 240 257

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

157 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
AT2G01034 Arabidopsis thaliana AT2G01034-TAIR-G N 0.722
ENSBTAG00000040266 Bos taurus ENSBTAG00000040266 N 0.722
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estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 N 0.722
gm1.300904 Emiliania huxleyi gm1.300904 N 0.722
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LOC_Os07g34860 Oryza sativa LOC_Os07g34860 N 1.000
LOC_Os07g32180 Oryza sativa LOC_Os07g32180 N 1.000
LOC_Os07g24340 Oryza sativa LOC_Os07g24340 N 1.000
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LOC_Os12g35800 Oryza sativa LOC_Os12g35800 N 1.000
LOC_Os12g39800 Oryza sativa LOC_Os12g39800 N 0.944
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LOC_Os09g09910 Oryza sativa LOC_Os09g09910 N 0.944
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