LOC_Os05g19540 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os05g19540 T11455_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os05g19540.1 CCHC ZF 295 312

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

153 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
AT2G01034 Arabidopsis thaliana AT2G01034-TAIR-G N 0.722
ENSBTAG00000040266 Bos taurus ENSBTAG00000040266 N 0.722
LOC_Os07g36990 Oryza sativa LOC_Os07g36990 N 0.944
LOC_Os07g34860 Oryza sativa LOC_Os07g34860 N 0.944
LOC_Os07g32180 Oryza sativa LOC_Os07g32180 N 0.944
LOC_Os07g24340 Oryza sativa LOC_Os07g24340 N 0.944
LOC_Os07g24110 Oryza sativa LOC_Os07g24110 N 0.833
LOC_Os07g23460 Oryza sativa LOC_Os07g23460 N 0.833
LOC_Os07g18620 Oryza sativa LOC_Os07g18620 N 0.944
LOC_Os07g41610 Oryza sativa LOC_Os07g41610 N 0.889
LOC_Os08g08350 Oryza sativa LOC_Os08g08350 N 0.944
LOC_Os08g08870 Oryza sativa LOC_Os08g08870 N 0.833
LOC_Os08g15870 Oryza sativa LOC_Os08g15870 N 0.889
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LOC_Os08g23480 Oryza sativa LOC_Os08g23480 N 0.889
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LOC_Os11g34930 Oryza sativa LOC_Os11g34930 N 0.944
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LOC_Os12g27730 Oryza sativa LOC_Os12g27730 N 0.944
LOC_Os12g30310 Oryza sativa LOC_Os12g30310 N 0.944
LOC_Os12g34700 Oryza sativa LOC_Os12g34700 N 0.889
LOC_Os12g35800 Oryza sativa LOC_Os12g35800 N 0.944
LOC_Os12g39800 Oryza sativa LOC_Os12g39800 N 0.889
LOC_Os11g27650 Oryza sativa LOC_Os11g27650 N 0.944
LOC_Os11g22370 Oryza sativa LOC_Os11g22370 N 0.944
LOC_Os11g20640 Oryza sativa LOC_Os11g20640 N 0.889
LOC_Os09g05060 Oryza sativa LOC_Os09g05060 N 0.833
LOC_Os09g06350 Oryza sativa LOC_Os09g06350 N 0.889
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LOC_Os09g13800 Oryza sativa LOC_Os09g13800 N 0.889
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LOC_Os10g18190 Oryza sativa LOC_Os10g18190 N 0.833
LOC_Os10g29970 Oryza sativa LOC_Os10g29970 N 0.944
LOC_Os10g30832 Oryza sativa LOC_Os10g30832 N 0.889
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LOC_Os10g36720 Oryza sativa LOC_Os10g36720 N 0.944
LOC_Os11g03940 Oryza sativa LOC_Os11g03940 N 0.944
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LOC_Os11g17200 Oryza sativa LOC_Os11g17200 N 0.944
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LOC_Os05g51200 Oryza sativa LOC_Os05g51200 N 0.889
LOC_Os01g05320 Oryza sativa LOC_Os01g05320 N 0.944
LOC_Os02g06740 Oryza sativa LOC_Os02g06740 N 0.944
LOC_Os02g09870 Oryza sativa LOC_Os02g09870 N 0.722
LOC_Os02g13910 Oryza sativa LOC_Os02g13910 N 0.889
LOC_Os02g16520 Oryza sativa LOC_Os02g16520 N 0.889
LOC_Os02g18970 Oryza sativa LOC_Os02g18970 N 0.833
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LOC_Os02g40230 Oryza sativa LOC_Os02g40230 N 0.944
LOC_Os02g44150 Oryza sativa LOC_Os02g44150 N 0.833
LOC_Os02g51980 Oryza sativa LOC_Os02g51980 N 0.944
LOC_Os02g52680 Oryza sativa LOC_Os02g52680 N 0.944
LOC_Os03g14060 Oryza sativa LOC_Os03g14060 N 0.889
LOC_Os03g21050 Oryza sativa LOC_Os03g21050 N 0.889
LOC_Os03g31134 Oryza sativa LOC_Os03g31134 N 0.944
LOC_Os03g33640 Oryza sativa LOC_Os03g33640 N 0.944
LOC_Os02g03160 Oryza sativa LOC_Os02g03160 N 0.944
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LOC_Os03g51724 Oryza sativa LOC_Os03g51724 N 0.889
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LOC_Os04g26480 Oryza sativa LOC_Os04g26480 N 0.944
LOC_Os04g31220 Oryza sativa LOC_Os04g31220 N 0.944
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LOC_Os05g51170 Oryza sativa LOC_Os05g51170 N 0.944