CISBP-RNA Database: Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences of RNA binding proteins
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LOC_Os02g26690
(
Oryza sativa
)
CCHC ZF
RBP Information
Pfam ID
Interpro ID
Gene ID
CISBP-RNA ID
Sequence source
PF00098 (zf-CCHC)
IPR001878
LOC_Os02g26690
T10923_0.6
Ensembl (2011-Oct-26)
Link out
Directly determined binding motifs
Name/Motif ID
Species
Sequence Logo
IUPAC
Type/Study/Study ID
RBD
Identity
No direct experiments
Motifs from related RBPs
Name/Motif ID
Species
Sequence Logo
IUPAC
Type/Study/Study ID
RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains
RNA Binding Domains
Protein ID
Domain
From
To
Sequence
LOC_Os02g26690.1
CCHC ZF
110
127
KTCFVCGQPSHLARKCPQ
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CCHC ZF
family RBPs
Other
Oryza sativa
RBPs
150 Related RBPs
Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
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Oryza sativa
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