CBN07680 (Caenorhabditis brenneri)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 CBN07680 T09614_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
CBN07680 CCHC ZF 669 686

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Caenorhabditis brenneri RBPs

132 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os04g09480 Oryza sativa LOC_Os04g09480 N 0.778
LOC_Os07g22090 Oryza sativa LOC_Os07g22090 N 0.778
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LOC_Os10g16900 Oryza sativa LOC_Os10g16900 N 0.722
LOC_Os10g16720 Oryza sativa LOC_Os10g16720 N 0.722
LOC_Os10g08820 Oryza sativa LOC_Os10g08820 N 0.722
LOC_Os10g10460 Oryza sativa LOC_Os10g10460 N 0.722
LOC_Os10g12630 Oryza sativa LOC_Os10g12630 N 0.722
LOC_Os10g17560 Oryza sativa LOC_Os10g17560 N 0.722
LOC_Os10g24460 Oryza sativa LOC_Os10g24460 N 0.722
LOC_Os10g29980 Oryza sativa LOC_Os10g29980 N 0.722
LOC_Os10g32649 Oryza sativa LOC_Os10g32649 N 0.722
LOC_Os10g28930 Oryza sativa LOC_Os10g28930 N 0.722
LOC_Os10g25720 Oryza sativa LOC_Os10g25720 N 0.722
LOC_Os10g06270 Oryza sativa LOC_Os10g06270 N 0.722
LOC_Os10g24620 Oryza sativa LOC_Os10g24620 N 0.722
LOC_Os10g17820 Oryza sativa LOC_Os10g17820 N 0.722
LOC_Os09g28260 Oryza sativa LOC_Os09g28260 N 0.722
LOC_Os08g30010 Oryza sativa LOC_Os08g30010 N 0.722
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LOC_Os08g23050 Oryza sativa LOC_Os08g23050 N 0.722
LOC_Os08g20370 Oryza sativa LOC_Os08g20370 N 0.722
LOC_Os08g04950 Oryza sativa LOC_Os08g04950 N 0.722
LOC_Os08g20170 Oryza sativa LOC_Os08g20170 N 0.722
LOC_Os09g03350 Oryza sativa LOC_Os09g03350 N 0.722
LOC_Os09g08180 Oryza sativa LOC_Os09g08180 N 0.722
LOC_Os09g17450 Oryza sativa LOC_Os09g17450 N 0.722
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LOC_Os09g17030 Oryza sativa LOC_Os09g17030 N 0.722
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LOC_Os09g08900 Oryza sativa LOC_Os09g08900 N 0.722
LOC_Os09g30494 Oryza sativa LOC_Os09g30494 N 0.722
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LOC_Os12g21580 Oryza sativa LOC_Os12g21580 N 0.722
LOC_Os12g23060 Oryza sativa LOC_Os12g23060 N 0.722
LOC_Os12g23130 Oryza sativa LOC_Os12g23130 N 0.722
LOC_Os12g20450 Oryza sativa LOC_Os12g20450 N 0.722
LOC_Os12g20250 Oryza sativa LOC_Os12g20250 N 0.722
LOC_Os12g14460 Oryza sativa LOC_Os12g14460 N 0.722
LOC_Os12g18350 Oryza sativa LOC_Os12g18350 N 0.722
LOC_Os12g25910 Oryza sativa LOC_Os12g25910 N 0.722
LOC_Os12g26790 Oryza sativa LOC_Os12g26790 N 0.722
PTSG_02809 Salpingoeca rosetta PTSG_02809 N 0.722
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LOC_Os11g21950 Oryza sativa LOC_Os11g21950 N 0.722
LOC_Os11g16870 Oryza sativa LOC_Os11g16870 N 0.722
LOC_Os11g12874 Oryza sativa LOC_Os11g12874 N 0.722
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LOC_Os11g27050 Oryza sativa LOC_Os11g27050 N 0.722
LOC_Os11g27410 Oryza sativa LOC_Os11g27410 N 0.722
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LOC_Os05g23010 Oryza sativa LOC_Os05g23010 N 0.722
LOC_Os05g23110 Oryza sativa LOC_Os05g23110 N 0.722
LOC_Os05g19310 Oryza sativa LOC_Os05g19310 N 0.722
LOC_Os05g18520 Oryza sativa LOC_Os05g18520 N 0.722
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LOC_Os07g30730 Oryza sativa LOC_Os07g30730 N 0.722