LOC_Os01g35540 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os01g35540 T10795_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os01g35540.1 CCHC ZF 374 391

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

70 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os04g05140 Oryza sativa LOC_Os04g05140 N 1.000
LOC_Os08g21030 Oryza sativa LOC_Os08g21030 N 0.944
LOC_Os08g11280 Oryza sativa LOC_Os08g11280 N 0.944
LOC_Os08g22740 Oryza sativa LOC_Os08g22740 N 0.944
LOC_Os09g14310 Oryza sativa LOC_Os09g14310 N 0.944
LOC_Os08g24970 Oryza sativa LOC_Os08g24970 N 0.944
LOC_Os07g45820 Oryza sativa LOC_Os07g45820 N 0.944
LOC_Os07g34480 Oryza sativa LOC_Os07g34480 N 0.944
LOC_Os06g15530 Oryza sativa LOC_Os06g15530 N 0.944
LOC_Os06g15070 Oryza sativa LOC_Os06g15070 N 0.944
LOC_Os01g38010 Oryza sativa LOC_Os01g38010 N 0.944
LOC_Os06g36620 Oryza sativa LOC_Os06g36620 N 0.944
LOC_Os06g48420 Oryza sativa LOC_Os06g48420 N 0.944
LOC_Os06g48410 Oryza sativa LOC_Os06g48410 N 0.944
LOC_Os09g17250 Oryza sativa LOC_Os09g17250 N 0.944
LOC_Os10g12816 Oryza sativa LOC_Os10g12816 N 0.944
LOC_Os12g30890 Oryza sativa LOC_Os12g30890 N 0.944
LOC_Os12g30240 Oryza sativa LOC_Os12g30240 N 0.944
LOC_Os12g35150 Oryza sativa LOC_Os12g35150 N 0.944
LOC_Os01g22300 Oryza sativa LOC_Os01g22300 N 0.944
LOC_Os01g35360 Oryza sativa LOC_Os01g35360 N 0.944
LOC_Os01g23160 Oryza sativa LOC_Os01g23160 N 0.944
LOC_Os12g28380 Oryza sativa LOC_Os12g28380 N 0.944
LOC_Os11g43100 Oryza sativa LOC_Os11g43100 N 0.944
LOC_Os10g24160 Oryza sativa LOC_Os10g24160 N 0.944
LOC_Os06g03280 Oryza sativa LOC_Os06g03280 N 0.944
LOC_Os10g28910 Oryza sativa LOC_Os10g28910 N 0.944
LOC_Os11g33466 Oryza sativa LOC_Os11g33466 N 0.944
LOC_Os11g43090 Oryza sativa LOC_Os11g43090 N 0.944
LOC_Os10g10660 Oryza sativa LOC_Os10g10660 N 0.944
LOC_Os06g15950 Oryza sativa LOC_Os06g15950 N 0.944
LOC_Os04g19040 Oryza sativa LOC_Os04g19040 N 0.944
LOC_Os04g24998 Oryza sativa LOC_Os04g24998 N 0.944
LOC_Os04g50140 Oryza sativa LOC_Os04g50140 N 0.944
LOC_Os05g16880 Oryza sativa LOC_Os05g16880 N 0.944
LOC_Os04g13330 Oryza sativa LOC_Os04g13330 N 0.944
LOC_Os04g06660 Oryza sativa LOC_Os04g06660 N 0.944
LOC_Os01g47220 Oryza sativa LOC_Os01g47220 N 0.944
LOC_Os02g20080 Oryza sativa LOC_Os02g20080 N 0.944
LOC_Os04g05270 Oryza sativa LOC_Os04g05270 N 0.944
LOC_Os05g17450 Oryza sativa LOC_Os05g17450 N 0.944
LOC_Os04g38150 Oryza sativa LOC_Os04g38150 N 0.944
LOC_Os05g19890 Oryza sativa LOC_Os05g19890 N 0.944
LOC_Os05g19810 Oryza sativa LOC_Os05g19810 N 0.944
LOC_Os05g17500 Oryza sativa LOC_Os05g17500 N 0.944
LOC_Os03g33319 Oryza sativa LOC_Os03g33319 N 0.889
LOC_Os02g16420 Oryza sativa LOC_Os02g16420 N 0.889
LOC_Os02g24640 Oryza sativa LOC_Os02g24640 N 0.889
LOC_Os05g20690 Oryza sativa LOC_Os05g20690 N 0.889
LOC_Os04g04860 Oryza sativa LOC_Os04g04860 N 0.833
LOC_Os01g47960 Oryza sativa LOC_Os01g47960 N 0.833
LOC_Os02g16350 Oryza sativa LOC_Os02g16350 N 0.833
LOC_Os05g26450 Oryza sativa LOC_Os05g26450 N 0.833
LOC_Os04g06390 Oryza sativa LOC_Os04g06390 N 0.833
LOC_Os03g33340 Oryza sativa LOC_Os03g33340 N 0.833
LOC_Os06g19330 Oryza sativa LOC_Os06g19330 N 0.833
LOC_Os05g17130 Oryza sativa LOC_Os05g17130 N 0.833
LOC_Os07g35440 Oryza sativa LOC_Os07g35440 N 0.833
LOC_Os07g20780 Oryza sativa LOC_Os07g20780 N 0.833
LOC_Os07g24620 Oryza sativa LOC_Os07g24620 N 0.833
LOC_Os07g22290 Oryza sativa LOC_Os07g22290 N 0.833
LOC_Os08g11010 Oryza sativa LOC_Os08g11010 N 0.833
LOC_Os06g37908 Oryza sativa LOC_Os06g37908 N 0.833
LOC_Os04g07480 Oryza sativa LOC_Os04g07480 N 0.833
LOC_Os06g37935 Oryza sativa LOC_Os06g37935 N 0.833
LOC_Os05g51990 Oryza sativa LOC_Os05g51990 N 0.833
LOC_Os01g25950 Oryza sativa LOC_Os01g25950 N 0.778
LOC_Os03g32770 Oryza sativa LOC_Os03g32770 N 0.778
LOC_Os05g51950 Oryza sativa LOC_Os05g51950 N 0.778
Cucsa.135100 Cucumis sativus Cucsa.135100 N 0.722