LOC_Os04g50140 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os04g50140 T11329_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os04g50140.1 CCHC ZF 436 453

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

70 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os11g33466 Oryza sativa LOC_Os11g33466 N 1.000
LOC_Os10g28910 Oryza sativa LOC_Os10g28910 N 1.000
LOC_Os11g43090 Oryza sativa LOC_Os11g43090 N 1.000
LOC_Os11g43100 Oryza sativa LOC_Os11g43100 N 1.000
LOC_Os12g30240 Oryza sativa LOC_Os12g30240 N 1.000
LOC_Os12g28380 Oryza sativa LOC_Os12g28380 N 1.000
LOC_Os10g24160 Oryza sativa LOC_Os10g24160 N 1.000
LOC_Os05g16880 Oryza sativa LOC_Os05g16880 N 1.000
LOC_Os08g24970 Oryza sativa LOC_Os08g24970 N 1.000
LOC_Os08g22740 Oryza sativa LOC_Os08g22740 N 1.000
LOC_Os09g14310 Oryza sativa LOC_Os09g14310 N 1.000
LOC_Os09g17250 Oryza sativa LOC_Os09g17250 N 1.000
LOC_Os10g10660 Oryza sativa LOC_Os10g10660 N 1.000
LOC_Os12g30890 Oryza sativa LOC_Os12g30890 N 1.000
LOC_Os12g35150 Oryza sativa LOC_Os12g35150 N 1.000
LOC_Os04g13330 Oryza sativa LOC_Os04g13330 N 1.000
LOC_Os04g06660 Oryza sativa LOC_Os04g06660 N 1.000
LOC_Os04g19040 Oryza sativa LOC_Os04g19040 N 1.000
LOC_Os04g24998 Oryza sativa LOC_Os04g24998 N 1.000
LOC_Os04g38150 Oryza sativa LOC_Os04g38150 N 1.000
LOC_Os04g05270 Oryza sativa LOC_Os04g05270 N 1.000
LOC_Os02g20080 Oryza sativa LOC_Os02g20080 N 1.000
LOC_Os01g23160 Oryza sativa LOC_Os01g23160 N 1.000
LOC_Os01g22300 Oryza sativa LOC_Os01g22300 N 1.000
LOC_Os01g35360 Oryza sativa LOC_Os01g35360 N 1.000
LOC_Os01g38010 Oryza sativa LOC_Os01g38010 N 1.000
LOC_Os01g47220 Oryza sativa LOC_Os01g47220 N 1.000
LOC_Os08g21030 Oryza sativa LOC_Os08g21030 N 1.000
LOC_Os10g12816 Oryza sativa LOC_Os10g12816 N 1.000
LOC_Os06g36620 Oryza sativa LOC_Os06g36620 N 1.000
LOC_Os06g48410 Oryza sativa LOC_Os06g48410 N 1.000
LOC_Os06g15950 Oryza sativa LOC_Os06g15950 N 1.000
LOC_Os08g11280 Oryza sativa LOC_Os08g11280 N 1.000
LOC_Os06g15070 Oryza sativa LOC_Os06g15070 N 1.000
LOC_Os06g15530 Oryza sativa LOC_Os06g15530 N 1.000
LOC_Os06g03280 Oryza sativa LOC_Os06g03280 N 1.000
LOC_Os06g48420 Oryza sativa LOC_Os06g48420 N 1.000
LOC_Os05g17500 Oryza sativa LOC_Os05g17500 N 1.000
LOC_Os07g45820 Oryza sativa LOC_Os07g45820 N 1.000
LOC_Os05g17450 Oryza sativa LOC_Os05g17450 N 1.000
LOC_Os07g34480 Oryza sativa LOC_Os07g34480 N 1.000
LOC_Os05g19810 Oryza sativa LOC_Os05g19810 N 1.000
LOC_Os05g19890 Oryza sativa LOC_Os05g19890 N 1.000
LOC_Os04g05140 Oryza sativa LOC_Os04g05140 N 0.944
LOC_Os03g33319 Oryza sativa LOC_Os03g33319 N 0.944
LOC_Os05g20690 Oryza sativa LOC_Os05g20690 N 0.944
LOC_Os02g24640 Oryza sativa LOC_Os02g24640 N 0.944
LOC_Os01g35540 Oryza sativa LOC_Os01g35540 N 0.944
LOC_Os04g06390 Oryza sativa LOC_Os04g06390 N 0.889
LOC_Os07g20780 Oryza sativa LOC_Os07g20780 N 0.889
LOC_Os06g37935 Oryza sativa LOC_Os06g37935 N 0.889
LOC_Os04g04860 Oryza sativa LOC_Os04g04860 N 0.889
LOC_Os07g22290 Oryza sativa LOC_Os07g22290 N 0.889
LOC_Os04g07480 Oryza sativa LOC_Os04g07480 N 0.889
LOC_Os05g17130 Oryza sativa LOC_Os05g17130 N 0.889
LOC_Os08g11010 Oryza sativa LOC_Os08g11010 N 0.889
LOC_Os07g35440 Oryza sativa LOC_Os07g35440 N 0.889
LOC_Os07g24620 Oryza sativa LOC_Os07g24620 N 0.889
LOC_Os03g33340 Oryza sativa LOC_Os03g33340 N 0.889
LOC_Os06g37908 Oryza sativa LOC_Os06g37908 N 0.889
LOC_Os05g26450 Oryza sativa LOC_Os05g26450 N 0.889
LOC_Os01g47960 Oryza sativa LOC_Os01g47960 N 0.889
LOC_Os06g19330 Oryza sativa LOC_Os06g19330 N 0.889
LOC_Os05g51990 Oryza sativa LOC_Os05g51990 N 0.889
LOC_Os05g51950 Oryza sativa LOC_Os05g51950 N 0.833
LOC_Os02g16420 Oryza sativa LOC_Os02g16420 N 0.833
LOC_Os03g32770 Oryza sativa LOC_Os03g32770 N 0.833
LOC_Os01g25950 Oryza sativa LOC_Os01g25950 N 0.833
LOC_Os02g16350 Oryza sativa LOC_Os02g16350 N 0.778
Cucsa.135100 Cucumis sativus Cucsa.135100 N 0.722