AAH45264 (Xenopus laevis)
RRM

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00076 (RRM_1) IPR000504 AAH45264 T59478_0.6 Xenbase (2010-Oct-22)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
sf3b4
M195_0.6 		Danio rerio CAAAAG RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00224 		0.979
Smp_067420
M201_0.6 		Schistosoma mansoni DWWUUUU RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00232 		0.881
sap-49
M261_0.6 		Caenorhabditis elegans CGUGUGAG SELEX
Cook et al.(2011)
145_9163526 		0.804
estExt_gwp_gw1.C_700168
M205_0.6 		Physcomitrella patens WUGGAG RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00237 		0.783
For this family, RBPs with RBD identity > 0.7 will likely have a similar motif

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
AAH45264 RRM 15 85
AAH45264 RRM 102 173

Links

Other RRM family RBPs
Other Xenopus laevis RBPs

129 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os08g22960 Oryza sativa LOC_Os08g22960 N 0.000
LOC_Os09g01230 Oryza sativa LOC_Os09g01230 N 0.000
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