LOC_Os06g01534 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os06g01534 T11559_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os06g01534.1 CCHC ZF 392 409

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

75 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os01g61270 Oryza sativa LOC_Os01g61270 N 1.000
LOC_Os01g58920 Oryza sativa LOC_Os01g58920 N 1.000
LOC_Os01g63550 Oryza sativa LOC_Os01g63550 N 1.000
LOC_Os01g68410 Oryza sativa LOC_Os01g68410 N 1.000
LOC_Os02g25770 Oryza sativa LOC_Os02g25770 N 1.000
LOC_Os01g73320 Oryza sativa LOC_Os01g73320 N 1.000
LOC_Os01g45330 Oryza sativa LOC_Os01g45330 N 1.000
LOC_Os01g23980 Oryza sativa LOC_Os01g23980 N 1.000
LOC_Os12g37300 Oryza sativa LOC_Os12g37300 N 1.000
LOC_Os12g31070 Oryza sativa LOC_Os12g31070 N 1.000
LOC_Os12g38030 Oryza sativa LOC_Os12g38030 N 1.000
13114.t00030 Oryza sativa 13114.t00030 N 1.000
LOC_Os01g06770 Oryza sativa LOC_Os01g06770 N 1.000
LOC_Os06g35040 Oryza sativa LOC_Os06g35040 N 1.000
LOC_Os02g33910 Oryza sativa LOC_Os02g33910 N 1.000
LOC_Os02g36100 Oryza sativa LOC_Os02g36100 N 1.000
LOC_Os04g47100 Oryza sativa LOC_Os04g47100 N 1.000
LOC_Os02g50510 Oryza sativa LOC_Os02g50510 N 1.000
LOC_Os03g04860 Oryza sativa LOC_Os03g04860 N 1.000
LOC_Os03g59140 Oryza sativa LOC_Os03g59140 N 1.000
LOC_Os04g29700 Oryza sativa LOC_Os04g29700 N 1.000
LOC_Os04g27490 Oryza sativa LOC_Os04g27490 N 1.000
LOC_Os02g46880 Oryza sativa LOC_Os02g46880 N 1.000
LOC_Os02g46240 Oryza sativa LOC_Os02g46240 N 1.000
LOC_Os04g53590 Oryza sativa LOC_Os04g53590 N 1.000
LOC_Os02g40570 Oryza sativa LOC_Os02g40570 N 1.000
LOC_Os02g43390 Oryza sativa LOC_Os02g43390 N 1.000
LOC_Os02g43450 Oryza sativa LOC_Os02g43450 N 1.000
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LOC_Os02g43800 Oryza sativa LOC_Os02g43800 N 1.000
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LOC_Os04g56260 Oryza sativa LOC_Os04g56260 N 1.000
LOC_Os08g06310 Oryza sativa LOC_Os08g06310 N 1.000
LOC_Os08g04510 Oryza sativa LOC_Os08g04510 N 1.000
LOC_Os08g30190 Oryza sativa LOC_Os08g30190 N 1.000
LOC_Os08g31540 Oryza sativa LOC_Os08g31540 N 1.000
LOC_Os10g06830 Oryza sativa LOC_Os10g06830 N 1.000
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LOC_Os07g30320 Oryza sativa LOC_Os07g30320 N 1.000
LOC_Os07g03560 Oryza sativa LOC_Os07g03560 N 1.000
LOC_Os07g01430 Oryza sativa LOC_Os07g01430 N 1.000
LOC_Os07g03630 Oryza sativa LOC_Os07g03630 N 1.000
LOC_Os07g11590 Oryza sativa LOC_Os07g11590 N 1.000
LOC_Os07g18770 Oryza sativa LOC_Os07g18770 N 1.000
LOC_Os07g12360 Oryza sativa LOC_Os07g12360 N 1.000
LOC_Os12g27870 Oryza sativa LOC_Os12g27870 N 1.000
LOC_Os10g29490 Oryza sativa LOC_Os10g29490 N 1.000
LOC_Os11g40730 Oryza sativa LOC_Os11g40730 N 1.000
LOC_Os11g40470 Oryza sativa LOC_Os11g40470 N 1.000
LOC_Os05g18760 Oryza sativa LOC_Os05g18760 N 1.000
LOC_Os04g59250 Oryza sativa LOC_Os04g59250 N 1.000
LOC_Os12g26340 Oryza sativa LOC_Os12g26340 N 1.000
LOC_Os12g17510 Oryza sativa LOC_Os12g17510 N 1.000
LOC_Os10g38370 Oryza sativa LOC_Os10g38370 N 1.000
LOC_Os11g39790 Oryza sativa LOC_Os11g39790 N 1.000
LOC_Os10g42364 Oryza sativa LOC_Os10g42364 N 1.000
LOC_Os11g02780 Oryza sativa LOC_Os11g02780 N 1.000
LOC_Os05g35390 Oryza sativa LOC_Os05g35390 N 1.000
LOC_Os11g06920 Oryza sativa LOC_Os11g06920 N 1.000
LOC_Os11g08150 Oryza sativa LOC_Os11g08150 N 1.000
LOC_Os05g36400 Oryza sativa LOC_Os05g36400 N 0.944
LOC_Os04g55020 Oryza sativa LOC_Os04g55020 N 0.944
LOC_Os04g45440 Oryza sativa LOC_Os04g45440 N 0.944
LOC_Os01g03610 Oryza sativa LOC_Os01g03610 N 0.944
LOC_Os11g34490 Oryza sativa LOC_Os11g34490 N 0.944
LOC_Os08g36620 Oryza sativa LOC_Os08g36620 N 0.944
LOC_Os02g41740 Oryza sativa LOC_Os02g41740 N 0.944
LOC_Os11g44150 Oryza sativa LOC_Os11g44150 N 0.944
LOC_Os12g07750 Oryza sativa LOC_Os12g07750 N 0.889
LOC_Os07g43790 Oryza sativa LOC_Os07g43790 N 0.833
LOC_Os12g29020 Oryza sativa LOC_Os12g29020 N 0.778
LOC_Os03g36239 Oryza sativa LOC_Os03g36239 N 0.778
LOC_Os02g52690 Oryza sativa LOC_Os02g52690 N 0.722
AT1G33813 Arabidopsis thaliana AT1G33813-TAIR-G N 0.722