LOC_Os11g34490 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os11g34490 T12428_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os11g34490.1 CCHC ZF 55 72

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

76 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os05g47610 Oryza sativa LOC_Os05g47610 N 0.944
LOC_Os05g35390 Oryza sativa LOC_Os05g35390 N 0.944
LOC_Os05g18760 Oryza sativa LOC_Os05g18760 N 0.944
LOC_Os06g01534 Oryza sativa LOC_Os06g01534 N 0.944
LOC_Os06g35040 Oryza sativa LOC_Os06g35040 N 0.944
LOC_Os07g03560 Oryza sativa LOC_Os07g03560 N 0.944
LOC_Os07g01430 Oryza sativa LOC_Os07g01430 N 0.944
LOC_Os04g59250 Oryza sativa LOC_Os04g59250 N 0.944
LOC_Os04g56260 Oryza sativa LOC_Os04g56260 N 0.944
LOC_Os04g27490 Oryza sativa LOC_Os04g27490 N 0.944
LOC_Os03g59140 Oryza sativa LOC_Os03g59140 N 0.944
LOC_Os11g39790 Oryza sativa LOC_Os11g39790 N 0.944
LOC_Os04g29700 Oryza sativa LOC_Os04g29700 N 0.944
LOC_Os04g45430 Oryza sativa LOC_Os04g45430 N 0.944
LOC_Os04g53590 Oryza sativa LOC_Os04g53590 N 0.944
LOC_Os04g47100 Oryza sativa LOC_Os04g47100 N 0.944
LOC_Os07g03630 Oryza sativa LOC_Os07g03630 N 0.944
LOC_Os07g11590 Oryza sativa LOC_Os07g11590 N 0.944
LOC_Os10g38370 Oryza sativa LOC_Os10g38370 N 0.944
LOC_Os10g29490 Oryza sativa LOC_Os10g29490 N 0.944
LOC_Os10g06830 Oryza sativa LOC_Os10g06830 N 0.944
LOC_Os10g42364 Oryza sativa LOC_Os10g42364 N 0.944
LOC_Os11g02780 Oryza sativa LOC_Os11g02780 N 0.944
LOC_Os11g08150 Oryza sativa LOC_Os11g08150 N 0.944
LOC_Os11g06920 Oryza sativa LOC_Os11g06920 N 0.944
LOC_Os09g38180 Oryza sativa LOC_Os09g38180 N 0.944
LOC_Os08g31540 Oryza sativa LOC_Os08g31540 N 0.944
LOC_Os07g18770 Oryza sativa LOC_Os07g18770 N 0.944
LOC_Os07g12360 Oryza sativa LOC_Os07g12360 N 0.944
LOC_Os07g30320 Oryza sativa LOC_Os07g30320 N 0.944
LOC_Os08g04510 Oryza sativa LOC_Os08g04510 N 0.944
LOC_Os08g30190 Oryza sativa LOC_Os08g30190 N 0.944
LOC_Os08g06310 Oryza sativa LOC_Os08g06310 N 0.944
LOC_Os02g50510 Oryza sativa LOC_Os02g50510 N 0.944
LOC_Os03g04860 Oryza sativa LOC_Os03g04860 N 0.944
LOC_Os01g23980 Oryza sativa LOC_Os01g23980 N 0.944
LOC_Os01g06770 Oryza sativa LOC_Os01g06770 N 0.944
13114.t00030 Oryza sativa 13114.t00030 N 0.944
LOC_Os01g45330 Oryza sativa LOC_Os01g45330 N 0.944
LOC_Os02g46880 Oryza sativa LOC_Os02g46880 N 0.944
LOC_Os01g63550 Oryza sativa LOC_Os01g63550 N 0.944
LOC_Os01g61270 Oryza sativa LOC_Os01g61270 N 0.944
LOC_Os12g38030 Oryza sativa LOC_Os12g38030 N 0.944
LOC_Os12g37300 Oryza sativa LOC_Os12g37300 N 0.944
LOC_Os11g40730 Oryza sativa LOC_Os11g40730 N 0.944
LOC_Os11g40470 Oryza sativa LOC_Os11g40470 N 0.944
LOC_Os12g17510 Oryza sativa LOC_Os12g17510 N 0.944
LOC_Os12g26340 Oryza sativa LOC_Os12g26340 N 0.944
LOC_Os12g31070 Oryza sativa LOC_Os12g31070 N 0.944
LOC_Os12g27870 Oryza sativa LOC_Os12g27870 N 0.944
LOC_Os01g68410 Oryza sativa LOC_Os01g68410 N 0.944
LOC_Os01g58920 Oryza sativa LOC_Os01g58920 N 0.944
LOC_Os02g43800 Oryza sativa LOC_Os02g43800 N 0.944
LOC_Os02g43450 Oryza sativa LOC_Os02g43450 N 0.944
LOC_Os02g45370 Oryza sativa LOC_Os02g45370 N 0.944
LOC_Os02g43390 Oryza sativa LOC_Os02g43390 N 0.944
LOC_Os02g40570 Oryza sativa LOC_Os02g40570 N 0.944
LOC_Os02g46240 Oryza sativa LOC_Os02g46240 N 0.944
LOC_Os02g25770 Oryza sativa LOC_Os02g25770 N 0.944
LOC_Os01g73320 Oryza sativa LOC_Os01g73320 N 0.944
LOC_Os02g33910 Oryza sativa LOC_Os02g33910 N 0.944
LOC_Os02g36100 Oryza sativa LOC_Os02g36100 N 0.944
LOC_Os08g36620 Oryza sativa LOC_Os08g36620 N 0.889
LOC_Os04g45440 Oryza sativa LOC_Os04g45440 N 0.889
LOC_Os02g41740 Oryza sativa LOC_Os02g41740 N 0.889
LOC_Os04g55020 Oryza sativa LOC_Os04g55020 N 0.889
LOC_Os01g03610 Oryza sativa LOC_Os01g03610 N 0.889
LOC_Os11g44150 Oryza sativa LOC_Os11g44150 N 0.889
LOC_Os05g36400 Oryza sativa LOC_Os05g36400 N 0.889
LOC_Os12g07750 Oryza sativa LOC_Os12g07750 N 0.833
LOC_Os07g43790 Oryza sativa LOC_Os07g43790 N 0.778
LOC_Os02g52690 Oryza sativa LOC_Os02g52690 N 0.722
XP_001180278.1 Strongylocentrotus purpuratus XP_001180278.1 N 0.722
XP_001200167.1 Strongylocentrotus purpuratus XP_001200167.1 N 0.722
LOC_Os12g29020 Oryza sativa LOC_Os12g29020 N 0.722
LOC_Os03g36239 Oryza sativa LOC_Os03g36239 N 0.722