LOC_Os07g43790 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os07g43790 T11880_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os07g43790.1 CCHC ZF 437 454

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

73 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os02g41740 Oryza sativa LOC_Os02g41740 N 0.889
LOC_Os02g46240 Oryza sativa LOC_Os02g46240 N 0.833
LOC_Os02g45370 Oryza sativa LOC_Os02g45370 N 0.833
LOC_Os02g46880 Oryza sativa LOC_Os02g46880 N 0.833
LOC_Os02g50510 Oryza sativa LOC_Os02g50510 N 0.833
LOC_Os04g27490 Oryza sativa LOC_Os04g27490 N 0.833
LOC_Os03g59140 Oryza sativa LOC_Os03g59140 N 0.833
LOC_Os03g04860 Oryza sativa LOC_Os03g04860 N 0.833
LOC_Os02g43800 Oryza sativa LOC_Os02g43800 N 0.833
LOC_Os02g43450 Oryza sativa LOC_Os02g43450 N 0.833
LOC_Os02g25770 Oryza sativa LOC_Os02g25770 N 0.833
LOC_Os08g04510 Oryza sativa LOC_Os08g04510 N 0.833
LOC_Os02g33910 Oryza sativa LOC_Os02g33910 N 0.833
LOC_Os02g36100 Oryza sativa LOC_Os02g36100 N 0.833
LOC_Os02g43390 Oryza sativa LOC_Os02g43390 N 0.833
LOC_Os02g40570 Oryza sativa LOC_Os02g40570 N 0.833
LOC_Os04g29700 Oryza sativa LOC_Os04g29700 N 0.833
LOC_Os04g45430 Oryza sativa LOC_Os04g45430 N 0.833
LOC_Os07g03630 Oryza sativa LOC_Os07g03630 N 0.833
LOC_Os07g03560 Oryza sativa LOC_Os07g03560 N 0.833
LOC_Os07g01430 Oryza sativa LOC_Os07g01430 N 0.833
LOC_Os07g11590 Oryza sativa LOC_Os07g11590 N 0.833
LOC_Os07g12360 Oryza sativa LOC_Os07g12360 N 0.833
LOC_Os07g30320 Oryza sativa LOC_Os07g30320 N 0.833
LOC_Os07g18770 Oryza sativa LOC_Os07g18770 N 0.833
LOC_Os06g35040 Oryza sativa LOC_Os06g35040 N 0.833
LOC_Os06g01534 Oryza sativa LOC_Os06g01534 N 0.833
LOC_Os04g56260 Oryza sativa LOC_Os04g56260 N 0.833
LOC_Os04g53590 Oryza sativa LOC_Os04g53590 N 0.833
LOC_Os04g47100 Oryza sativa LOC_Os04g47100 N 0.833
LOC_Os04g59250 Oryza sativa LOC_Os04g59250 N 0.833
LOC_Os05g18760 Oryza sativa LOC_Os05g18760 N 0.833
LOC_Os05g47610 Oryza sativa LOC_Os05g47610 N 0.833
LOC_Os05g35390 Oryza sativa LOC_Os05g35390 N 0.833
LOC_Os01g68410 Oryza sativa LOC_Os01g68410 N 0.833
LOC_Os01g73320 Oryza sativa LOC_Os01g73320 N 0.833
LOC_Os11g40470 Oryza sativa LOC_Os11g40470 N 0.833
LOC_Os11g39790 Oryza sativa LOC_Os11g39790 N 0.833
LOC_Os11g40730 Oryza sativa LOC_Os11g40730 N 0.833
LOC_Os01g63550 Oryza sativa LOC_Os01g63550 N 0.833
LOC_Os08g31540 Oryza sativa LOC_Os08g31540 N 0.833
LOC_Os11g44150 Oryza sativa LOC_Os11g44150 N 0.833
LOC_Os09g38180 Oryza sativa LOC_Os09g38180 N 0.833
LOC_Os11g08150 Oryza sativa LOC_Os11g08150 N 0.833
LOC_Os10g42364 Oryza sativa LOC_Os10g42364 N 0.833
LOC_Os10g38370 Oryza sativa LOC_Os10g38370 N 0.833
LOC_Os11g02780 Oryza sativa LOC_Os11g02780 N 0.833
LOC_Os10g06830 Oryza sativa LOC_Os10g06830 N 0.833
LOC_Os11g06920 Oryza sativa LOC_Os11g06920 N 0.833
LOC_Os12g17510 Oryza sativa LOC_Os12g17510 N 0.833
LOC_Os12g26340 Oryza sativa LOC_Os12g26340 N 0.833
LOC_Os01g06770 Oryza sativa LOC_Os01g06770 N 0.833
LOC_Os08g06310 Oryza sativa LOC_Os08g06310 N 0.833
LOC_Os01g23980 Oryza sativa LOC_Os01g23980 N 0.833
LOC_Os01g45330 Oryza sativa LOC_Os01g45330 N 0.833
LOC_Os01g61270 Oryza sativa LOC_Os01g61270 N 0.833
LOC_Os01g58920 Oryza sativa LOC_Os01g58920 N 0.833
AT1G33813 Arabidopsis thaliana AT1G33813-TAIR-G N 0.833
LOC_Os08g30190 Oryza sativa LOC_Os08g30190 N 0.833
LOC_Os12g31070 Oryza sativa LOC_Os12g31070 N 0.833
LOC_Os12g27870 Oryza sativa LOC_Os12g27870 N 0.833
LOC_Os12g37300 Oryza sativa LOC_Os12g37300 N 0.833
LOC_Os12g38030 Oryza sativa LOC_Os12g38030 N 0.833
LOC_Os10g29490 Oryza sativa LOC_Os10g29490 N 0.833
13114.t00030 Oryza sativa 13114.t00030 N 0.833
LOC_Os08g36620 Oryza sativa LOC_Os08g36620 N 0.778
LOC_Os04g45440 Oryza sativa LOC_Os04g45440 N 0.778
LOC_Os01g03610 Oryza sativa LOC_Os01g03610 N 0.778
LOC_Os12g07750 Oryza sativa LOC_Os12g07750 N 0.778
LOC_Os04g55020 Oryza sativa LOC_Os04g55020 N 0.778
LOC_Os05g36400 Oryza sativa LOC_Os05g36400 N 0.778
LOC_Os11g34490 Oryza sativa LOC_Os11g34490 N 0.778
AT1G17495 Arabidopsis thaliana AT1G17495-TAIR-G N 0.722