LOC_Os10g13580 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os10g13580 T12229_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os10g13580.1 CCHC ZF 77 91

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

87 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os10g09940 Oryza sativa LOC_Os10g09940 N 0.933
LOC_Os07g20620 Oryza sativa LOC_Os07g20620 N 0.867
LOC_Os09g33750 Oryza sativa LOC_Os09g33750 N 0.867
LOC_Os10g19338 Oryza sativa LOC_Os10g19338 N 0.867
LOC_Os07g30000 Oryza sativa LOC_Os07g30000 N 0.800
LOC_Os07g23400 Oryza sativa LOC_Os07g23400 N 0.778
LOC_Os07g27510 Oryza sativa LOC_Os07g27510 N 0.778
LOC_Os07g12840 Oryza sativa LOC_Os07g12840 N 0.778
LOC_Os01g43210 Oryza sativa LOC_Os01g43210 N 0.778
LOC_Os12g06580 Oryza sativa LOC_Os12g06580 N 0.778
LOC_Os05g49110 Oryza sativa LOC_Os05g49110 N 0.778
LOC_Os03g11850 Oryza sativa LOC_Os03g11850 N 0.778
LOC_Os12g22820 Oryza sativa LOC_Os12g22820 N 0.778
LOC_Os08g17700 Oryza sativa LOC_Os08g17700 N 0.778
LOC_Os10g21730 Oryza sativa LOC_Os10g21730 N 0.778
LOC_Os11g25810 Oryza sativa LOC_Os11g25810 N 0.750
LOC_Os07g20280 Oryza sativa LOC_Os07g20280 N 0.733
LOC_Os10g03300 Oryza sativa LOC_Os10g03300 N 0.722
LOC_Os05g19250 Oryza sativa LOC_Os05g19250 N 0.722
LOC_Os09g18080 Oryza sativa LOC_Os09g18080 N 0.722
LOC_Os06g13500 Oryza sativa LOC_Os06g13500 N 0.722
LOC_Os06g05460 Oryza sativa LOC_Os06g05460 N 0.722
LOC_Os05g27770 Oryza sativa LOC_Os05g27770 N 0.722
LOC_Os05g07190 Oryza sativa LOC_Os05g07190 N 0.722
LOC_Os04g13240 Oryza sativa LOC_Os04g13240 N 0.722
LOC_Os03g56676 Oryza sativa LOC_Os03g56676 N 0.722
LOC_Os04g19950 Oryza sativa LOC_Os04g19950 N 0.722
LOC_Os04g24350 Oryza sativa LOC_Os04g24350 N 0.722
LOC_Os06g19040 Oryza sativa LOC_Os06g19040 N 0.722
LOC_Os04g34960 Oryza sativa LOC_Os04g34960 N 0.722
LOC_Os05g15810 Oryza sativa LOC_Os05g15810 N 0.722
LOC_Os06g29600 Oryza sativa LOC_Os06g29600 N 0.722
LOC_Os07g27900 Oryza sativa LOC_Os07g27900 N 0.722
LOC_Os08g14170 Oryza sativa LOC_Os08g14170 N 0.722
LOC_Os08g06850 Oryza sativa LOC_Os08g06850 N 0.722
LOC_Os07g36270 Oryza sativa LOC_Os07g36270 N 0.722
LOC_Os08g05150 Oryza sativa LOC_Os08g05150 N 0.722
LOC_Os07g38350 Oryza sativa LOC_Os07g38350 N 0.722
LOC_Os08g14340 Oryza sativa LOC_Os08g14340 N 0.722
LOC_Os03g31200 Oryza sativa LOC_Os03g31200 N 0.722
LOC_Os07g39380 Oryza sativa LOC_Os07g39380 N 0.722
LOC_Os06g25910 Oryza sativa LOC_Os06g25910 N 0.722
LOC_Os06g34090 Oryza sativa LOC_Os06g34090 N 0.722
LOC_Os06g35840 Oryza sativa LOC_Os06g35840 N 0.722
LOC_Os06g49270 Oryza sativa LOC_Os06g49270 N 0.722
LOC_Os06g42300 Oryza sativa LOC_Os06g42300 N 0.722
LOC_Os06g23860 Oryza sativa LOC_Os06g23860 N 0.722
LOC_Os03g02500 Oryza sativa LOC_Os03g02500 N 0.722
LOC_Os12g11730 Oryza sativa LOC_Os12g11730 N 0.722
LOC_Os12g10500 Oryza sativa LOC_Os12g10500 N 0.722
LOC_Os12g09400 Oryza sativa LOC_Os12g09400 N 0.722
LOC_Os12g11970 Oryza sativa LOC_Os12g11970 N 0.722
LOC_Os12g12040 Oryza sativa LOC_Os12g12040 N 0.722
LOC_Os12g18250 Oryza sativa LOC_Os12g18250 N 0.722
LOC_Os12g15290 Oryza sativa LOC_Os12g15290 N 0.722
LOC_Os12g13780 Oryza sativa LOC_Os12g13780 N 0.722
LOC_Os12g03304 Oryza sativa LOC_Os12g03304 N 0.722
LOC_Os11g46090 Oryza sativa LOC_Os11g46090 N 0.722
LOC_Os10g34890 Oryza sativa LOC_Os10g34890 N 0.722
LOC_Os10g33570 Oryza sativa LOC_Os10g33570 N 0.722
LOC_Os10g31220 Oryza sativa LOC_Os10g31220 N 0.722
LOC_Os10g36460 Oryza sativa LOC_Os10g36460 N 0.722
LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 0.722
LOC_Os11g35800 Oryza sativa LOC_Os11g35800 N 0.722
LOC_Os11g16610 Oryza sativa LOC_Os11g16610 N 0.722
LOC_Os11g01700 Oryza sativa LOC_Os11g01700 N 0.722
LOC_Os12g26520 Oryza sativa LOC_Os12g26520 N 0.722
LOC_Os12g34580 Oryza sativa LOC_Os12g34580 N 0.722
LOC_Os01g58810 Oryza sativa LOC_Os01g58810 N 0.722
LOC_Os01g55660 Oryza sativa LOC_Os01g55660 N 0.722
LOC_Os01g37410 Oryza sativa LOC_Os01g37410 N 0.722
LOC_Os02g14370 Oryza sativa LOC_Os02g14370 N 0.722
LOC_Os02g18310 Oryza sativa LOC_Os02g18310 N 0.722
LOC_Os03g14349 Oryza sativa LOC_Os03g14349 N 0.722
LOC_Os10g19290 Oryza sativa LOC_Os10g19290 N 0.722
LOC_Os02g27320 Oryza sativa LOC_Os02g27320 N 0.722
LOC_Os01g34630 Oryza sativa LOC_Os01g34630 N 0.722
LOC_Os01g33324 Oryza sativa LOC_Os01g33324 N 0.722
LOC_Os01g06810 Oryza sativa LOC_Os01g06810 N 0.722
LOC_Os12g41080 Oryza sativa LOC_Os12g41080 N 0.722
LOC_Os12g36260 Oryza sativa LOC_Os12g36260 N 0.722
LOC_Os01g09050 Oryza sativa LOC_Os01g09050 N 0.722
LOC_Os01g16270 Oryza sativa LOC_Os01g16270 N 0.722
LOC_Os01g32990 Oryza sativa LOC_Os01g32990 N 0.722
LOC_Os01g29680 Oryza sativa LOC_Os01g29680 N 0.722
LOC_Os01g28760 Oryza sativa LOC_Os01g28760 N 0.722
LOC_Os03g29130 Oryza sativa LOC_Os03g29130 N 0.722