LOC_Os11g01700 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os11g01700 T12326_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os11g01700.1 CCHC ZF 400 417

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

118 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os06g25910 Oryza sativa LOC_Os06g25910 N 1.000
LOC_Os03g02500 Oryza sativa LOC_Os03g02500 N 1.000
LOC_Os02g27320 Oryza sativa LOC_Os02g27320 N 1.000
LOC_Os03g14349 Oryza sativa LOC_Os03g14349 N 1.000
LOC_Os08g14340 Oryza sativa LOC_Os08g14340 N 1.000
LOC_Os03g31200 Oryza sativa LOC_Os03g31200 N 1.000
LOC_Os03g29130 Oryza sativa LOC_Os03g29130 N 1.000
LOC_Os06g29600 Oryza sativa LOC_Os06g29600 N 1.000
LOC_Os02g18310 Oryza sativa LOC_Os02g18310 N 1.000
LOC_Os06g35840 Oryza sativa LOC_Os06g35840 N 1.000
LOC_Os01g37410 Oryza sativa LOC_Os01g37410 N 1.000
LOC_Os01g55660 Oryza sativa LOC_Os01g55660 N 1.000
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LOC_Os11g25810 Oryza sativa LOC_Os11g25810 N 0.722
LOC_Os07g20280 Oryza sativa LOC_Os07g20280 N 0.722
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LOC_Os05g32700 Oryza sativa LOC_Os05g32700 N 0.722
XM_002874266.1 Arabidopsis lyrata fgenesh1_pm.C_scaffold_6002106 N 0.722
emb1138 Arabidopsis thaliana AT5G26742-TAIR-G N 0.722
DGIL_AUG5s9216g3t1 Acyrtosiphon pisum DGIL_AUG5s9216g3t1 N 0.722