LOC_Os01g28760 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os01g28760 T10762_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os01g28760.1 CCHC ZF 165 182

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

118 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os10g03300 Oryza sativa LOC_Os10g03300 N 1.000
LOC_Os09g18080 Oryza sativa LOC_Os09g18080 N 1.000
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LOC_Os10g34890 Oryza sativa LOC_Os10g34890 N 1.000
LOC_Os10g33570 Oryza sativa LOC_Os10g33570 N 1.000
LOC_Os08g06850 Oryza sativa LOC_Os08g06850 N 1.000
LOC_Os08g05150 Oryza sativa LOC_Os08g05150 N 1.000
LOC_Os06g29600 Oryza sativa LOC_Os06g29600 N 1.000
LOC_Os06g25910 Oryza sativa LOC_Os06g25910 N 1.000
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LOC_Os05g25820 Oryza sativa LOC_Os05g25820 N 0.778
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LOC_Os12g25080 Oryza sativa LOC_Os12g25080 N 0.778
LOC_Os11g25810 Oryza sativa LOC_Os11g25810 N 0.722
LOC_Os05g32700 Oryza sativa LOC_Os05g32700 N 0.722
LOC_Os07g20280 Oryza sativa LOC_Os07g20280 N 0.722
DGIL_AUG5s9216g3t1 Acyrtosiphon pisum DGIL_AUG5s9216g3t1 N 0.722
LOC_Os10g13580 Oryza sativa LOC_Os10g13580 N 0.722
emb1138 Arabidopsis thaliana AT5G26742-TAIR-G N 0.722
XM_002874266.1 Arabidopsis lyrata fgenesh1_pm.C_scaffold_6002106 N 0.722