LOC_Os02g02060 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os02g02060 T10862_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os02g02060.1 CCHC ZF 348 365

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

153 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os09g02110 Oryza sativa LOC_Os09g02110 N 0.944
LOC_Os05g19330 Oryza sativa LOC_Os05g19330 N 0.944
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LOC_Os08g12210 Oryza sativa LOC_Os08g12210 N 0.889
LOC_Os05g04790 Oryza sativa LOC_Os05g04790 N 0.889
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LOC_Os09g30494 Oryza sativa LOC_Os09g30494 N 0.722