LOC_Os05g52070 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os05g52070 T11557_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os05g52070.1 CCHC ZF 607 624

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

219 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os12g21640 Oryza sativa LOC_Os12g21640 N 0.944
LOC_Os11g43460 Oryza sativa LOC_Os11g43460 N 0.944
LOC_Os05g19330 Oryza sativa LOC_Os05g19330 N 0.944
LOC_Os09g02110 Oryza sativa LOC_Os09g02110 N 0.944
LOC_Os09g14790 Oryza sativa LOC_Os09g14790 N 0.944
LOC_Os08g12210 Oryza sativa LOC_Os08g12210 N 0.889
LOC_Os12g33690 Oryza sativa LOC_Os12g33690 N 0.889
LOC_Os04g55320 Oryza sativa LOC_Os04g55320 N 0.889
LOC_Os04g53890 Oryza sativa LOC_Os04g53890 N 0.889
LOC_Os03g30970 Oryza sativa LOC_Os03g30970 N 0.889
LOC_Os02g19840 Oryza sativa LOC_Os02g19840 N 0.889
LOC_Os02g02060 Oryza sativa LOC_Os02g02060 N 0.889
LOC_Os01g35140 Oryza sativa LOC_Os01g35140 N 0.889
LOC_Os09g01450 Oryza sativa LOC_Os09g01450 N 0.889
13114.t00078 Oryza sativa 13114.t00078 N 0.889
LOC_Os03g15450 Oryza sativa LOC_Os03g15450 N 0.889
LOC_Os05g04790 Oryza sativa LOC_Os05g04790 N 0.889
LOC_Os04g34260 Oryza sativa LOC_Os04g34260 N 0.889
LOC_Os05g37230 Oryza sativa LOC_Os05g37230 N 0.889
LOC_Os05g16850 Oryza sativa LOC_Os05g16850 N 0.889
LOC_Os06g31640 Oryza sativa LOC_Os06g31640 N 0.889
LOC_Os06g32120 Oryza sativa LOC_Os06g32120 N 0.889
LOC_Os06g48440 Oryza sativa LOC_Os06g48440 N 0.889
LOC_Os12g04830 Oryza sativa LOC_Os12g04830 N 0.889
LOC_Os06g24790 Oryza sativa LOC_Os06g24790 N 0.833
LOC_Os09g09580 Oryza sativa LOC_Os09g09580 N 0.833
LOC_Os06g18090 Oryza sativa LOC_Os06g18090 N 0.833
LOC_Os02g18520 Oryza sativa LOC_Os02g18520 N 0.833
LOC_Os06g21640 Oryza sativa LOC_Os06g21640 N 0.833
LOC_Os10g16950 Oryza sativa LOC_Os10g16950 N 0.833
LOC_Os12g17860 Oryza sativa LOC_Os12g17860 N 0.833
LOC_Os07g20810 Oryza sativa LOC_Os07g20810 N 0.833
LOC_Os12g18350 Oryza sativa LOC_Os12g18350 N 0.778
LOC_Os01g23040 Oryza sativa LOC_Os01g23040 N 0.778
LOC_Os06g14570 Oryza sativa LOC_Os06g14570 N 0.778
LOC_Os01g28950 Oryza sativa LOC_Os01g28950 N 0.778
LOC_Os01g29530 Oryza sativa LOC_Os01g29530 N 0.778
LOC_Os01g27960 Oryza sativa LOC_Os01g27960 N 0.778
LOC_Os01g63120 Oryza sativa LOC_Os01g63120 N 0.778
LOC_Os12g12410 Oryza sativa LOC_Os12g12410 N 0.778
LOC_Os01g73344 Oryza sativa LOC_Os01g73344 N 0.778
LOC_Os12g14460 Oryza sativa LOC_Os12g14460 N 0.778
LOC_Os12g04910 Oryza sativa LOC_Os12g04910 N 0.778
LOC_Os01g14450 Oryza sativa LOC_Os01g14450 N 0.778
LOC_Os12g20250 Oryza sativa LOC_Os12g20250 N 0.778
LOC_Os12g29100 Oryza sativa LOC_Os12g29100 N 0.778
LOC_Os12g30200 Oryza sativa LOC_Os12g30200 N 0.778
LOC_Os12g28470 Oryza sativa LOC_Os12g28470 N 0.778
LOC_Os12g25910 Oryza sativa LOC_Os12g25910 N 0.778
LOC_Os11g44720 Oryza sativa LOC_Os11g44720 N 0.778
LOC_Os12g23130 Oryza sativa LOC_Os12g23130 N 0.778
LOC_Os12g31570 Oryza sativa LOC_Os12g31570 N 0.778
LOC_Os12g08620 Oryza sativa LOC_Os12g08620 N 0.778
13114.t00059 Oryza sativa 13114.t00059 N 0.778
LOC_Os11g27410 Oryza sativa LOC_Os11g27410 N 0.778
LOC_Os11g37440 Oryza sativa LOC_Os11g37440 N 0.778
LOC_Os11g38090 Oryza sativa LOC_Os11g38090 N 0.778
LOC_Os12g20450 Oryza sativa LOC_Os12g20450 N 0.778
LOC_Os12g21580 Oryza sativa LOC_Os12g21580 N 0.778
LOC_Os02g46580 Oryza sativa LOC_Os02g46580 N 0.778
LOC_Os05g03690 Oryza sativa LOC_Os05g03690 N 0.778
LOC_Os05g05890 Oryza sativa LOC_Os05g05890 N 0.778
LOC_Os05g07380 Oryza sativa LOC_Os05g07380 N 0.778
LOC_Os04g54650 Oryza sativa LOC_Os04g54650 N 0.778
LOC_Os04g51740 Oryza sativa LOC_Os04g51740 N 0.778
LOC_Os04g22490 Oryza sativa LOC_Os04g22490 N 0.778
LOC_Os04g24060 Oryza sativa LOC_Os04g24060 N 0.778
LOC_Os04g48094 Oryza sativa LOC_Os04g48094 N 0.778
LOC_Os05g07400 Oryza sativa LOC_Os05g07400 N 0.778
LOC_Os05g07500 Oryza sativa LOC_Os05g07500 N 0.778
LOC_Os05g19310 Oryza sativa LOC_Os05g19310 N 0.778
LOC_Os05g23010 Oryza sativa LOC_Os05g23010 N 0.778
LOC_Os05g23110 Oryza sativa LOC_Os05g23110 N 0.778
LOC_Os05g18520 Oryza sativa LOC_Os05g18520 N 0.778
LOC_Os05g16390 Oryza sativa LOC_Os05g16390 N 0.778
LOC_Os05g07520 Oryza sativa LOC_Os05g07520 N 0.778
LOC_Os05g10960 Oryza sativa LOC_Os05g10960 N 0.778
LOC_Os04g17410 Oryza sativa LOC_Os04g17410 N 0.778
LOC_Os04g13970 Oryza sativa LOC_Os04g13970 N 0.778
LOC_Os02g42750 Oryza sativa LOC_Os02g42750 N 0.778
LOC_Os11g22910 Oryza sativa LOC_Os11g22910 N 0.778
LOC_Os02g47690 Oryza sativa LOC_Os02g47690 N 0.778
LOC_Os02g42080 Oryza sativa LOC_Os02g42080 N 0.778
LOC_Os02g37460 Oryza sativa LOC_Os02g37460 N 0.778
LOC_Os02g01670 Oryza sativa LOC_Os02g01670 N 0.778
LOC_Os02g22520 Oryza sativa LOC_Os02g22520 N 0.778
LOC_Os02g57930 Oryza sativa LOC_Os02g57930 N 0.778
LOC_Os03g23200 Oryza sativa LOC_Os03g23200 N 0.778
LOC_Os03g36350 Oryza sativa LOC_Os03g36350 N 0.778
LOC_Os04g01030 Oryza sativa LOC_Os04g01030 N 0.778
LOC_Os04g09480 Oryza sativa LOC_Os04g09480 N 0.778
LOC_Os03g36030 Oryza sativa LOC_Os03g36030 N 0.778
LOC_Os03g32360 Oryza sativa LOC_Os03g32360 N 0.778
LOC_Os03g30710 Oryza sativa LOC_Os03g30710 N 0.778
LOC_Os03g31930 Oryza sativa LOC_Os03g31930 N 0.778
LOC_Os02g01640 Oryza sativa LOC_Os02g01640 N 0.778
LOC_Os12g04810 Oryza sativa LOC_Os12g04810 N 0.778
LOC_Os09g08900 Oryza sativa LOC_Os09g08900 N 0.778
LOC_Os09g16350 Oryza sativa LOC_Os09g16350 N 0.778
LOC_Os09g17030 Oryza sativa LOC_Os09g17030 N 0.778
LOC_Os09g08180 Oryza sativa LOC_Os09g08180 N 0.778
LOC_Os09g03350 Oryza sativa LOC_Os09g03350 N 0.778
LOC_Os08g30010 Oryza sativa LOC_Os08g30010 N 0.778
LOC_Os08g32790 Oryza sativa LOC_Os08g32790 N 0.778
LOC_Os09g17450 Oryza sativa LOC_Os09g17450 N 0.778
LOC_Os09g28260 Oryza sativa LOC_Os09g28260 N 0.778
LOC_Os10g12630 Oryza sativa LOC_Os10g12630 N 0.778
LOC_Os10g16720 Oryza sativa LOC_Os10g16720 N 0.778
LOC_Os10g16900 Oryza sativa LOC_Os10g16900 N 0.778
LOC_Os10g10460 Oryza sativa LOC_Os10g10460 N 0.778
LOC_Os10g08820 Oryza sativa LOC_Os10g08820 N 0.778
LOC_Os09g30494 Oryza sativa LOC_Os09g30494 N 0.778
LOC_Os10g06270 Oryza sativa LOC_Os10g06270 N 0.778
LOC_Os08g23050 Oryza sativa LOC_Os08g23050 N 0.778
LOC_Os08g20370 Oryza sativa LOC_Os08g20370 N 0.778
LOC_Os07g04090 Oryza sativa LOC_Os07g04090 N 0.778
LOC_Os07g14250 Oryza sativa LOC_Os07g14250 N 0.778
LOC_Os07g22090 Oryza sativa LOC_Os07g22090 N 0.778
LOC_Os06g48900 Oryza sativa LOC_Os06g48900 N 0.778
LOC_Os06g48380 Oryza sativa LOC_Os06g48380 N 0.778
LOC_Os06g32450 Oryza sativa LOC_Os06g32450 N 0.778
LOC_Os06g48370 Oryza sativa LOC_Os06g48370 N 0.778
LOC_Os07g24290 Oryza sativa LOC_Os07g24290 N 0.778
LOC_Os07g24990 Oryza sativa LOC_Os07g24990 N 0.778
LOC_Os08g14290 Oryza sativa LOC_Os08g14290 N 0.778
LOC_Os08g20170 Oryza sativa LOC_Os08g20170 N 0.778
LOC_Os08g04950 Oryza sativa LOC_Os08g04950 N 0.778
LOC_Os07g30910 Oryza sativa LOC_Os07g30910 N 0.778
LOC_Os07g28510 Oryza sativa LOC_Os07g28510 N 0.778
LOC_Os07g30730 Oryza sativa LOC_Os07g30730 N 0.778
LOC_Os10g17050 Oryza sativa LOC_Os10g17050 N 0.778
LOC_Os08g40770 Oryza sativa LOC_Os08g40770 N 0.778
LOC_Os11g07790 Oryza sativa LOC_Os11g07790 N 0.778
LOC_Os10g29980 Oryza sativa LOC_Os10g29980 N 0.778
LOC_Os10g25720 Oryza sativa LOC_Os10g25720 N 0.778
LOC_Os10g24620 Oryza sativa LOC_Os10g24620 N 0.778
LOC_Os11g10900 Oryza sativa LOC_Os11g10900 N 0.778
LOC_Os11g12850 Oryza sativa LOC_Os11g12850 N 0.778
LOC_Os11g16870 Oryza sativa LOC_Os11g16870 N 0.778
LOC_Os11g12874 Oryza sativa LOC_Os11g12874 N 0.778
LOC_Os10g17560 Oryza sativa LOC_Os10g17560 N 0.778
LOC_Os10g24460 Oryza sativa LOC_Os10g24460 N 0.778
LOC_Os10g32649 Oryza sativa LOC_Os10g32649 N 0.778
LOC_Os10g17820 Oryza sativa LOC_Os10g17820 N 0.778
LOC_Os11g21950 Oryza sativa LOC_Os11g21950 N 0.778
LOC_Os07g25200 Oryza sativa LOC_Os07g25200 N 0.722
LOC_Os07g25330 Oryza sativa LOC_Os07g25330 N 0.722
LOC_Os05g26230 Oryza sativa LOC_Os05g26230 N 0.722
LOC_Os07g25190 Oryza sativa LOC_Os07g25190 N 0.722
LOC_Os07g25110 Oryza sativa LOC_Os07g25110 N 0.722
LOC_Os11g20610 Oryza sativa LOC_Os11g20610 N 0.722
LOC_Os07g24660 Oryza sativa LOC_Os07g24660 N 0.722
LOC_Os11g20220 Oryza sativa LOC_Os11g20220 N 0.722
LOC_Os07g26220 Oryza sativa LOC_Os07g26220 N 0.722
LOC_Os04g22680 Oryza sativa LOC_Os04g22680 N 0.722
LOC_Os06g25320 Oryza sativa LOC_Os06g25320 N 0.722
LOC_Os07g30430 Oryza sativa LOC_Os07g30430 N 0.722
LOC_Os11g21790 Oryza sativa LOC_Os11g21790 N 0.722
LOC_Os04g18660 Oryza sativa LOC_Os04g18660 N 0.722
LOC_Os04g22000 Oryza sativa LOC_Os04g22000 N 0.722
LOC_Os11g17230 Oryza sativa LOC_Os11g17230 N 0.722
LOC_Os05g26810 Oryza sativa LOC_Os05g26810 N 0.722
LOC_Os11g35560 Oryza sativa LOC_Os11g35560 N 0.722
LOC_Os05g24310 Oryza sativa LOC_Os05g24310 N 0.722
LOC_Os07g11640 Oryza sativa LOC_Os07g11640 N 0.722
LOC_Os05g15580 Oryza sativa LOC_Os05g15580 N 0.722
LOC_Os06g42250 Oryza sativa LOC_Os06g42250 N 0.722
LOC_Os11g27850 Oryza sativa LOC_Os11g27850 N 0.722
LOC_Os05g17360 Oryza sativa LOC_Os05g17360 N 0.722
LOC_Os11g23960 Oryza sativa LOC_Os11g23960 N 0.722
LOC_Os05g17420 Oryza sativa LOC_Os05g17420 N 0.722
LOC_Os05g15430 Oryza sativa LOC_Os05g15430 N 0.722
LOC_Os11g30860 Oryza sativa LOC_Os11g30860 N 0.722
LOC_Os07g20330 Oryza sativa LOC_Os07g20330 N 0.722
LOC_Os07g22060 Oryza sativa LOC_Os07g22060 N 0.722
LOC_Os05g19220 Oryza sativa LOC_Os05g19220 N 0.722
LOC_Os07g18350 Oryza sativa LOC_Os07g18350 N 0.722
LOC_Os07g16520 Oryza sativa LOC_Os07g16520 N 0.722
LOC_Os07g16000 Oryza sativa LOC_Os07g16000 N 0.722
LOC_Os04g14890 Oryza sativa LOC_Os04g14890 N 0.722
LOC_Os11g27050 Oryza sativa LOC_Os11g27050 N 0.722
LOC_Os04g06360 Oryza sativa LOC_Os04g06360 N 0.722
LOC_Os09g09100 Oryza sativa LOC_Os09g09100 N 0.722
LOC_Os09g12890 Oryza sativa LOC_Os09g12890 N 0.722
LOC_Os01g35710 Oryza sativa LOC_Os01g35710 N 0.722
LOC_Os10g28930 Oryza sativa LOC_Os10g28930 N 0.722
LOC_Os02g16960 Oryza sativa LOC_Os02g16960 N 0.722
LOC_Os02g34450 Oryza sativa LOC_Os02g34450 N 0.722
LOC_Os09g03830 Oryza sativa LOC_Os09g03830 N 0.722
LOC_Os09g08750 Oryza sativa LOC_Os09g08750 N 0.722
LOC_Os12g23060 Oryza sativa LOC_Os12g23060 N 0.722
LOC_Os12g25220 Oryza sativa LOC_Os12g25220 N 0.722
LOC_Os12g26790 Oryza sativa LOC_Os12g26790 N 0.722
LOC_Os12g27880 Oryza sativa LOC_Os12g27880 N 0.722
LOC_Os10g20570 Oryza sativa LOC_Os10g20570 N 0.722
LOC_Os01g19100 Oryza sativa LOC_Os01g19100 N 0.722
LOC_Os12g26780 Oryza sativa LOC_Os12g26780 N 0.722
LOC_Os10g23880 Oryza sativa LOC_Os10g23880 N 0.722
LOC_Os01g25679 Oryza sativa LOC_Os01g25679 N 0.722
LOC_Os09g03420 Oryza sativa LOC_Os09g03420 N 0.722
LOC_Os11g22550 Oryza sativa LOC_Os11g22550 N 0.722
LOC_Os03g59810 Oryza sativa LOC_Os03g59810 N 0.722
LOC_Os08g11430 Oryza sativa LOC_Os08g11430 N 0.722
LOC_Os03g35830 Oryza sativa LOC_Os03g35830 N 0.722
LOC_Os07g43630 Oryza sativa LOC_Os07g43630 N 0.722
LOC_Os04g05730 Oryza sativa LOC_Os04g05730 N 0.722
LOC_Os04g11310 Oryza sativa LOC_Os04g11310 N 0.722
LOC_Os04g08832 Oryza sativa LOC_Os04g08832 N 0.722
LOC_Os04g07510 Oryza sativa LOC_Os04g07510 N 0.722
LOC_Os03g35430 Oryza sativa LOC_Os03g35430 N 0.722
LOC_Os03g33140 Oryza sativa LOC_Os03g33140 N 0.722
LOC_Os08g23400 Oryza sativa LOC_Os08g23400 N 0.722
LOC_Os11g03250 Oryza sativa LOC_Os11g03250 N 0.722
LOC_Os12g17980 Oryza sativa LOC_Os12g17980 N 0.722
LOC_Os11g12060 Oryza sativa LOC_Os11g12060 N 0.722
LOC_Os11g12130 Oryza sativa LOC_Os11g12130 N 0.722
LOC_Os08g11830 Oryza sativa LOC_Os08g11830 N 0.722
LOC_Os08g12000 Oryza sativa LOC_Os08g12000 N 0.722
LOC_Os04g14620 Oryza sativa LOC_Os04g14620 N 0.722