estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 (Emiliania huxleyi)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 T13581_0.6 JGI (2010-Jan-8)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 CCHC ZF 464 481

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Emiliania huxleyi RBPs

138 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 N 1.000
gm1.300904 Emiliania huxleyi gm1.300904 N 0.778
LOC_Os07g18620 Oryza sativa LOC_Os07g18620 N 0.722
LOC_Os07g24340 Oryza sativa LOC_Os07g24340 N 0.722
LOC_Os07g32180 Oryza sativa LOC_Os07g32180 N 0.722
LOC_Os07g17030 Oryza sativa LOC_Os07g17030 N 0.722
LOC_Os07g13610 Oryza sativa LOC_Os07g13610 N 0.722
LOC_Os07g08560 Oryza sativa LOC_Os07g08560 N 0.722
LOC_Os07g34860 Oryza sativa LOC_Os07g34860 N 0.722
LOC_Os07g03940 Oryza sativa LOC_Os07g03940 N 0.722
LOC_Os07g41610 Oryza sativa LOC_Os07g41610 N 0.722
LOC_Os08g34440 Oryza sativa LOC_Os08g34440 N 0.722
LOC_Os08g35170 Oryza sativa LOC_Os08g35170 N 0.722
LOC_Os08g23480 Oryza sativa LOC_Os08g23480 N 0.722
LOC_Os08g19250 Oryza sativa LOC_Os08g19250 N 0.722
LOC_Os07g03670 Oryza sativa LOC_Os07g03670 N 0.722
LOC_Os08g08350 Oryza sativa LOC_Os08g08350 N 0.722
LOC_Os07g36990 Oryza sativa LOC_Os07g36990 N 0.722
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LOC_Os05g51170 Oryza sativa LOC_Os05g51170 N 0.722
LOC_Os05g51200 Oryza sativa LOC_Os05g51200 N 0.722
LOC_Os06g08630 Oryza sativa LOC_Os06g08630 N 0.722
LOC_Os05g49550 Oryza sativa LOC_Os05g49550 N 0.722
LOC_Os05g49540 Oryza sativa LOC_Os05g49540 N 0.722
LOC_Os05g37070 Oryza sativa LOC_Os05g37070 N 0.722
LOC_Os05g47740 Oryza sativa LOC_Os05g47740 N 0.722
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LOC_Os06g35550 Oryza sativa LOC_Os06g35550 N 0.722
LOC_Os08g36160 Oryza sativa LOC_Os08g36160 N 0.722
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LOC_Os06g29300 Oryza sativa LOC_Os06g29300 N 0.722
LOC_Os06g24360 Oryza sativa LOC_Os06g24360 N 0.722
LOC_Os06g25270 Oryza sativa LOC_Os06g25270 N 0.722
LOC_Os07g02510 Oryza sativa LOC_Os07g02510 N 0.722
LOC_Os08g42090 Oryza sativa LOC_Os08g42090 N 0.722
LOC_Os11g31970 Oryza sativa LOC_Os11g31970 N 0.722
LOC_Os12g04310 Oryza sativa LOC_Os12g04310 N 0.722
LOC_Os12g10130 Oryza sativa LOC_Os12g10130 N 0.722
LOC_Os11g31840 Oryza sativa LOC_Os11g31840 N 0.722
LOC_Os11g29074 Oryza sativa LOC_Os11g29074 N 0.722
LOC_Os11g22370 Oryza sativa LOC_Os11g22370 N 0.722
LOC_Os11g27650 Oryza sativa LOC_Os11g27650 N 0.722
LOC_Os12g23730 Oryza sativa LOC_Os12g23730 N 0.722
LOC_Os12g27730 Oryza sativa LOC_Os12g27730 N 0.722
Sb01g002660 Sorghum bicolor Sb01g002660 N 0.722
30128.m009003 Ricinus communis 30128.m009003 N 0.722
LOC_Os12g41280 Oryza sativa LOC_Os12g41280 N 0.722
LOC_Os12g35800 Oryza sativa LOC_Os12g35800 N 0.722
LOC_Os12g30310 Oryza sativa LOC_Os12g30310 N 0.722
LOC_Os12g34700 Oryza sativa LOC_Os12g34700 N 0.722
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LOC_Os11g17200 Oryza sativa LOC_Os11g17200 N 0.722
LOC_Os09g07740 Oryza sativa LOC_Os09g07740 N 0.722
LOC_Os09g13800 Oryza sativa LOC_Os09g13800 N 0.722
LOC_Os09g21020 Oryza sativa LOC_Os09g21020 N 0.722
LOC_Os09g06350 Oryza sativa LOC_Os09g06350 N 0.722
LOC_Os09g02760 Oryza sativa LOC_Os09g02760 N 0.722
LOC_Os05g33340 Oryza sativa LOC_Os05g33340 N 0.722
LOC_Os08g43520 Oryza sativa LOC_Os08g43520 N 0.722
LOC_Os09g23100 Oryza sativa LOC_Os09g23100 N 0.722
LOC_Os10g18190 Oryza sativa LOC_Os10g18190 N 0.722
LOC_Os11g03940 Oryza sativa LOC_Os11g03940 N 0.722
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LOC_Os10g36720 Oryza sativa LOC_Os10g36720 N 0.722
LOC_Os10g31020 Oryza sativa LOC_Os10g31020 N 0.722
LOC_Os10g29970 Oryza sativa LOC_Os10g29970 N 0.722
LOC_Os10g30832 Oryza sativa LOC_Os10g30832 N 0.722
LOC_Os08g36290 Oryza sativa LOC_Os08g36290 N 0.722
LOC_Os05g29720 Oryza sativa LOC_Os05g29720 N 0.722
LOC_Os01g36680 Oryza sativa LOC_Os01g36680 N 0.722
LOC_Os01g36960 Oryza sativa LOC_Os01g36960 N 0.722
LOC_Os01g39550 Oryza sativa LOC_Os01g39550 N 0.722
LOC_Os01g33100 Oryza sativa LOC_Os01g33100 N 0.722
LOC_Os01g31840 Oryza sativa LOC_Os01g31840 N 0.722
LOC_Os01g26240 Oryza sativa LOC_Os01g26240 N 0.722
LOC_Os01g27420 Oryza sativa LOC_Os01g27420 N 0.722
LOC_Os01g41522 Oryza sativa LOC_Os01g41522 N 0.722
LOC_Os01g48670 Oryza sativa LOC_Os01g48670 N 0.722
LOC_Os02g13910 Oryza sativa LOC_Os02g13910 N 0.722
LOC_Os02g16520 Oryza sativa LOC_Os02g16520 N 0.722
LOC_Os02g18970 Oryza sativa LOC_Os02g18970 N 0.722
LOC_Os02g06740 Oryza sativa LOC_Os02g06740 N 0.722
LOC_Os02g03160 Oryza sativa LOC_Os02g03160 N 0.722
LOC_Os01g50180 Oryza sativa LOC_Os01g50180 N 0.722
LOC_Os02g01260 Oryza sativa LOC_Os02g01260 N 0.722
LOC_Os01g22890 Oryza sativa LOC_Os01g22890 N 0.722
LOC_Os01g19360 Oryza sativa LOC_Os01g19360 N 0.722
GRMZM2G163072 Zea mays GRMZM2G163072 N 0.722
GRMZM2G415491 Zea mays GRMZM2G415491 N 0.722
Genemark.983_g Serpula lacrymans Genemark.983_g N 0.722
s_442830 Phytophthora sojae s_442830 N 0.722
Glyma19g41150.1 Glycine max Glyma19g41150.1 N 0.722
fgenesh3_pg.7__35 Postia placenta fgenesh3_pg.7__35 N 0.722
Glyma03g38550.1 Glycine max Glyma03g38550.1 N 0.722
BGIOSIBCE013536 Oryza indica BGIOSIBCE013536 N 0.722
BRADI1G03180 Brachypodium distachyon BRADI1G03180 N 0.722
LOC_Os01g11450 Oryza sativa LOC_Os01g11450 N 0.722
LOC_Os01g16820 Oryza sativa LOC_Os01g16820 N 0.722
LOC_Os01g08480 Oryza sativa LOC_Os01g08480 N 0.722
LOC_Os01g05320 Oryza sativa LOC_Os01g05320 N 0.722
BRADI3G23364 Brachypodium distachyon BRADI3G23364 N 0.722
BRADI4G42725 Brachypodium distachyon BRADI4G42725 N 0.722
LOC_Os02g25790 Oryza sativa LOC_Os02g25790 N 0.722
LOC_Os02g28020 Oryza sativa LOC_Os02g28020 N 0.722
LOC_Os04g31220 Oryza sativa LOC_Os04g31220 N 0.722
LOC_Os04g34070 Oryza sativa LOC_Os04g34070 N 0.722
LOC_Os04g47600 Oryza sativa LOC_Os04g47600 N 0.722
LOC_Os04g26480 Oryza sativa LOC_Os04g26480 N 0.722
LOC_Os04g21180 Oryza sativa LOC_Os04g21180 N 0.722
LOC_Os04g17020 Oryza sativa LOC_Os04g17020 N 0.722
LOC_Os04g18080 Oryza sativa LOC_Os04g18080 N 0.722
LOC_Os04g49640 Oryza sativa LOC_Os04g49640 N 0.722
LOC_Os05g01130 Oryza sativa LOC_Os05g01130 N 0.722
LOC_Os05g24190 Oryza sativa LOC_Os05g24190 N 0.722
estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 Physcomitrella patens estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 N 0.722
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LOC_Os05g15250 Oryza sativa LOC_Os05g15250 N 0.722
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LOC_Os03g31134 Oryza sativa LOC_Os03g31134 N 0.722
LOC_Os03g33640 Oryza sativa LOC_Os03g33640 N 0.722
LOC_Os03g14060 Oryza sativa LOC_Os03g14060 N 0.722
LOC_Os02g52680 Oryza sativa LOC_Os02g52680 N 0.722
LOC_Os02g40230 Oryza sativa LOC_Os02g40230 N 0.722
LOC_Os02g51980 Oryza sativa LOC_Os02g51980 N 0.722
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LOC_Os03g44270 Oryza sativa LOC_Os03g44270 N 0.722
LOC_Os03g61220 Oryza sativa LOC_Os03g61220 N 0.722
LOC_Os04g02960 Oryza sativa LOC_Os04g02960 N 0.722
LOC_Os03g54804 Oryza sativa LOC_Os03g54804 N 0.722
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LOC_Os03g49910 Oryza sativa LOC_Os03g49910 N 0.722
LOC_Os03g51724 Oryza sativa LOC_Os03g51724 N 0.722
LOC_Os05g32290 Oryza sativa LOC_Os05g32290 N 0.722