estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 (Emiliania huxleyi)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 T13580_0.6 JGI (2010-Jan-8)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 CCHC ZF 464 481

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Emiliania huxleyi RBPs

138 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 N 1.000
gm1.300904 Emiliania huxleyi gm1.300904 N 0.778
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LOC_Os07g13610 Oryza sativa LOC_Os07g13610 N 0.722
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LOC_Os07g08560 Oryza sativa LOC_Os07g08560 N 0.722
LOC_Os07g03670 Oryza sativa LOC_Os07g03670 N 0.722
LOC_Os07g03940 Oryza sativa LOC_Os07g03940 N 0.722
LOC_Os07g32180 Oryza sativa LOC_Os07g32180 N 0.722
LOC_Os07g36990 Oryza sativa LOC_Os07g36990 N 0.722
LOC_Os08g23480 Oryza sativa LOC_Os08g23480 N 0.722
LOC_Os08g34440 Oryza sativa LOC_Os08g34440 N 0.722
LOC_Os08g19250 Oryza sativa LOC_Os08g19250 N 0.722
LOC_Os08g08350 Oryza sativa LOC_Os08g08350 N 0.722
LOC_Os07g02510 Oryza sativa LOC_Os07g02510 N 0.722
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LOC_Os11g29074 Oryza sativa LOC_Os11g29074 N 0.722
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LOC_Os11g22370 Oryza sativa LOC_Os11g22370 N 0.722
LOC_Os12g10130 Oryza sativa LOC_Os12g10130 N 0.722
LOC_Os12g23730 Oryza sativa LOC_Os12g23730 N 0.722
LOC_Os12g41280 Oryza sativa LOC_Os12g41280 N 0.722
Sb01g002660 Sorghum bicolor Sb01g002660 N 0.722
30128.m009003 Ricinus communis 30128.m009003 N 0.722
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LOC_Os09g02760 Oryza sativa LOC_Os09g02760 N 0.722
LOC_Os08g43520 Oryza sativa LOC_Os08g43520 N 0.722
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LOC_Os01g36680 Oryza sativa LOC_Os01g36680 N 0.722
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LOC_Os01g22890 Oryza sativa LOC_Os01g22890 N 0.722
LOC_Os01g26240 Oryza sativa LOC_Os01g26240 N 0.722
LOC_Os01g39550 Oryza sativa LOC_Os01g39550 N 0.722
LOC_Os01g41522 Oryza sativa LOC_Os01g41522 N 0.722
LOC_Os02g06740 Oryza sativa LOC_Os02g06740 N 0.722
LOC_Os02g13910 Oryza sativa LOC_Os02g13910 N 0.722
LOC_Os02g03160 Oryza sativa LOC_Os02g03160 N 0.722
LOC_Os02g01260 Oryza sativa LOC_Os02g01260 N 0.722
LOC_Os01g48670 Oryza sativa LOC_Os01g48670 N 0.722
LOC_Os01g50180 Oryza sativa LOC_Os01g50180 N 0.722
LOC_Os01g19360 Oryza sativa LOC_Os01g19360 N 0.722
LOC_Os01g16820 Oryza sativa LOC_Os01g16820 N 0.722
s_442830 Phytophthora sojae s_442830 N 0.722
GRMZM2G163072 Zea mays GRMZM2G163072 N 0.722
GRMZM2G415491 Zea mays GRMZM2G415491 N 0.722
Glyma19g41150.1 Glycine max Glyma19g41150.1 N 0.722
Glyma03g38550.1 Glycine max Glyma03g38550.1 N 0.722
estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 Physcomitrella patens estExt_fgenesh1_pg.C_3110010 N 0.722
fgenesh3_pg.7__35 Postia placenta fgenesh3_pg.7__35 N 0.722
Genemark.983_g Serpula lacrymans Genemark.983_g N 0.722
BGIOSIBCE013536 Oryza indica BGIOSIBCE013536 N 0.722
LOC_Os01g08480 Oryza sativa LOC_Os01g08480 N 0.722
LOC_Os01g11450 Oryza sativa LOC_Os01g11450 N 0.722
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BRADI4G42725 Brachypodium distachyon BRADI4G42725 N 0.722
BRADI1G03180 Brachypodium distachyon BRADI1G03180 N 0.722
BRADI3G23364 Brachypodium distachyon BRADI3G23364 N 0.722
LOC_Os02g16520 Oryza sativa LOC_Os02g16520 N 0.722
LOC_Os02g18970 Oryza sativa LOC_Os02g18970 N 0.722
LOC_Os04g21180 Oryza sativa LOC_Os04g21180 N 0.722
LOC_Os04g26480 Oryza sativa LOC_Os04g26480 N 0.722
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LOC_Os04g18080 Oryza sativa LOC_Os04g18080 N 0.722
LOC_Os04g17020 Oryza sativa LOC_Os04g17020 N 0.722
LOC_Os04g08780 Oryza sativa LOC_Os04g08780 N 0.722
LOC_Os04g11770 Oryza sativa LOC_Os04g11770 N 0.722
LOC_Os04g34070 Oryza sativa LOC_Os04g34070 N 0.722
LOC_Os04g47600 Oryza sativa LOC_Os04g47600 N 0.722
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LOC_Os05g29720 Oryza sativa LOC_Os05g29720 N 0.722