LOC_Os11g20220 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os11g20220 T12375_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os11g20220.1 CCHC ZF 21 38

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

183 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os08g14290 Oryza sativa LOC_Os08g14290 N 0.889
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LOC_Os12g33690 Oryza sativa LOC_Os12g33690 N 0.722
LOC_Os08g20030 Oryza sativa LOC_Os08g20030 N 0.722
GRMZM2G415491 Zea mays GRMZM2G415491 N 0.722
GRMZM2G163072 Zea mays GRMZM2G163072 N 0.722
Glyma19g41150.1 Glycine max Glyma19g41150.1 N 0.722
Sb01g002660 Sorghum bicolor Sb01g002660 N 0.722
LOC_Os09g14790 Oryza sativa LOC_Os09g14790 N 0.722