LOC_Os02g01640 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os02g01640 T10859_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os02g01640.1 CCHC ZF 353 370

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

659 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os05g21040 Oryza sativa LOC_Os05g21040 N 0.778
LOC_Os05g17410 Oryza sativa LOC_Os05g17410 N 0.778
LOC_Os05g17320 Oryza sativa LOC_Os05g17320 N 0.778
LOC_Os05g17270 Oryza sativa LOC_Os05g17270 N 0.778
LOC_Os05g17260 Oryza sativa LOC_Os05g17260 N 0.778
LOC_Os05g17100 Oryza sativa LOC_Os05g17100 N 0.778
LOC_Os05g17000 Oryza sativa LOC_Os05g17000 N 0.778
LOC_Os05g16960 Oryza sativa LOC_Os05g16960 N 0.778
LOC_Os05g16790 Oryza sativa LOC_Os05g16790 N 0.778
LOC_Os05g16720 Oryza sativa LOC_Os05g16720 N 0.778
LOC_Os05g09080 Oryza sativa LOC_Os05g09080 N 0.778
LOC_Os05g07350 Oryza sativa LOC_Os05g07350 N 0.778
LOC_Os05g03670 Oryza sativa LOC_Os05g03670 N 0.778
LOC_Os05g17480 Oryza sativa LOC_Os05g17480 N 0.778
LOC_Os05g17910 Oryza sativa LOC_Os05g17910 N 0.778
LOC_Os05g18230 Oryza sativa LOC_Os05g18230 N 0.778
LOC_Os05g20510 Oryza sativa LOC_Os05g20510 N 0.778
LOC_Os05g20230 Oryza sativa LOC_Os05g20230 N 0.778
LOC_Os05g20200 Oryza sativa LOC_Os05g20200 N 0.778
LOC_Os05g20180 Oryza sativa LOC_Os05g20180 N 0.778
LOC_Os05g19870 Oryza sativa LOC_Os05g19870 N 0.778
LOC_Os05g19850 Oryza sativa LOC_Os05g19850 N 0.778
LOC_Os05g19560 Oryza sativa LOC_Os05g19560 N 0.778
LOC_Os05g19200 Oryza sativa LOC_Os05g19200 N 0.778
LOC_Os05g19190 Oryza sativa LOC_Os05g19190 N 0.778
LOC_Os05g19140 Oryza sativa LOC_Os05g19140 N 0.778
LOC_Os05g18490 Oryza sativa LOC_Os05g18490 N 0.778
LOC_Os05g18380 Oryza sativa LOC_Os05g18380 N 0.778
LOC_Os05g01650 Oryza sativa LOC_Os05g01650 N 0.778
LOC_Os04g48640 Oryza sativa LOC_Os04g48640 N 0.778
LOC_Os04g45400 Oryza sativa LOC_Os04g45400 N 0.778
LOC_Os04g01040 Oryza sativa LOC_Os04g01040 N 0.778
LOC_Os03g60050 Oryza sativa LOC_Os03g60050 N 0.778
LOC_Os03g45670 Oryza sativa LOC_Os03g45670 N 0.778
LOC_Os03g41770 Oryza sativa LOC_Os03g41770 N 0.778
LOC_Os03g32960 Oryza sativa LOC_Os03g32960 N 0.778
LOC_Os03g23860 Oryza sativa LOC_Os03g23860 N 0.778
LOC_Os03g23840 Oryza sativa LOC_Os03g23840 N 0.778
LOC_Os03g23830 Oryza sativa LOC_Os03g23830 N 0.778
LOC_Os03g23800 Oryza sativa LOC_Os03g23800 N 0.778
LOC_Os02g38620 Oryza sativa LOC_Os02g38620 N 0.778
LOC_Os02g38550 Oryza sativa LOC_Os02g38550 N 0.778
LOC_Os02g24250 Oryza sativa LOC_Os02g24250 N 0.778
LOC_Os04g04150 Oryza sativa LOC_Os04g04150 N 0.778
LOC_Os04g04574 Oryza sativa LOC_Os04g04574 N 0.778
LOC_Os04g19610 Oryza sativa LOC_Os04g19610 N 0.778
LOC_Os04g38190 Oryza sativa LOC_Os04g38190 N 0.778
LOC_Os04g38180 Oryza sativa LOC_Os04g38180 N 0.778
LOC_Os04g27570 Oryza sativa LOC_Os04g27570 N 0.778
LOC_Os04g25040 Oryza sativa LOC_Os04g25040 N 0.778
LOC_Os04g25030 Oryza sativa LOC_Os04g25030 N 0.778
LOC_Os04g25020 Oryza sativa LOC_Os04g25020 N 0.778
LOC_Os04g24989 Oryza sativa LOC_Os04g24989 N 0.778
LOC_Os04g22010 Oryza sativa LOC_Os04g22010 N 0.778
LOC_Os04g21220 Oryza sativa LOC_Os04g21220 N 0.778
LOC_Os04g21210 Oryza sativa LOC_Os04g21210 N 0.778
LOC_Os04g21200 Oryza sativa LOC_Os04g21200 N 0.778
LOC_Os04g20040 Oryza sativa LOC_Os04g20040 N 0.778
LOC_Os02g13470 Oryza sativa LOC_Os02g13470 N 0.778