LOC_Os04g24100 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os04g24100 T11270_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os04g24100.1 CCHC ZF 396 413

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

112 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os01g33324 Oryza sativa LOC_Os01g33324 N 0.944
LOC_Os06g49270 Oryza sativa LOC_Os06g49270 N 0.944
LOC_Os05g19250 Oryza sativa LOC_Os05g19250 N 0.944
LOC_Os12g10500 Oryza sativa LOC_Os12g10500 N 0.889
LOC_Os12g09400 Oryza sativa LOC_Os12g09400 N 0.889
LOC_Os12g22820 Oryza sativa LOC_Os12g22820 N 0.889
LOC_Os12g06580 Oryza sativa LOC_Os12g06580 N 0.889
LOC_Os12g11730 Oryza sativa LOC_Os12g11730 N 0.889
LOC_Os12g11970 Oryza sativa LOC_Os12g11970 N 0.889
LOC_Os12g18250 Oryza sativa LOC_Os12g18250 N 0.889
LOC_Os12g12040 Oryza sativa LOC_Os12g12040 N 0.889
LOC_Os12g03304 Oryza sativa LOC_Os12g03304 N 0.889
LOC_Os12g15290 Oryza sativa LOC_Os12g15290 N 0.889
LOC_Os12g01470 Oryza sativa LOC_Os12g01470 N 0.889
LOC_Os10g33570 Oryza sativa LOC_Os10g33570 N 0.889
LOC_Os10g31220 Oryza sativa LOC_Os10g31220 N 0.889
LOC_Os10g21730 Oryza sativa LOC_Os10g21730 N 0.889
LOC_Os10g19290 Oryza sativa LOC_Os10g19290 N 0.889
LOC_Os10g34890 Oryza sativa LOC_Os10g34890 N 0.889
LOC_Os10g36460 Oryza sativa LOC_Os10g36460 N 0.889
LOC_Os11g46090 Oryza sativa LOC_Os11g46090 N 0.889
LOC_Os11g35800 Oryza sativa LOC_Os11g35800 N 0.889
LOC_Os11g16610 Oryza sativa LOC_Os11g16610 N 0.889
LOC_Os11g01700 Oryza sativa LOC_Os11g01700 N 0.889
LOC_Os12g26520 Oryza sativa LOC_Os12g26520 N 0.889
LOC_Os12g36260 Oryza sativa LOC_Os12g36260 N 0.889
LOC_Os03g14349 Oryza sativa LOC_Os03g14349 N 0.889
LOC_Os03g02500 Oryza sativa LOC_Os03g02500 N 0.889
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LOC_Os04g13240 Oryza sativa LOC_Os04g13240 N 0.889
LOC_Os03g56676 Oryza sativa LOC_Os03g56676 N 0.889
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LOC_Os01g55660 Oryza sativa LOC_Os01g55660 N 0.889
LOC_Os01g37410 Oryza sativa LOC_Os01g37410 N 0.889
LOC_Os01g32990 Oryza sativa LOC_Os01g32990 N 0.889
LOC_Os12g34580 Oryza sativa LOC_Os12g34580 N 0.889
LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 0.889
LOC_Os05g27770 Oryza sativa LOC_Os05g27770 N 0.889
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LOC_Os07g23400 Oryza sativa LOC_Os07g23400 N 0.889
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LOC_Os07g38350 Oryza sativa LOC_Os07g38350 N 0.889
LOC_Os05g15810 Oryza sativa LOC_Os05g15810 N 0.889
LOC_Os06g35840 Oryza sativa LOC_Os06g35840 N 0.889
LOC_Os05g49110 Oryza sativa LOC_Os05g49110 N 0.889
LOC_Os06g19040 Oryza sativa LOC_Os06g19040 N 0.889
LOC_Os06g13500 Oryza sativa LOC_Os06g13500 N 0.889
LOC_Os06g05460 Oryza sativa LOC_Os06g05460 N 0.889
LOC_Os06g23860 Oryza sativa LOC_Os06g23860 N 0.889
LOC_Os06g25910 Oryza sativa LOC_Os06g25910 N 0.889
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LOC_Os06g29600 Oryza sativa LOC_Os06g29600 N 0.889
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LOC_Os07g36270 Oryza sativa LOC_Os07g36270 N 0.889
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LOC_Os08g14170 Oryza sativa LOC_Os08g14170 N 0.889
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LOC_Os09g18080 Oryza sativa LOC_Os09g18080 N 0.889
LOC_Os04g34960 Oryza sativa LOC_Os04g34960 N 0.889
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LOC_Os05g07190 Oryza sativa LOC_Os05g07190 N 0.889
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LOC_Os01g34630 Oryza sativa LOC_Os01g34630 N 0.833
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LOC_Os01g43210 Oryza sativa LOC_Os01g43210 N 0.833
LOC_Os05g10510 Oryza sativa LOC_Os05g10510 N 0.833
LOC_Os02g15990 Oryza sativa LOC_Os02g15990 N 0.833
LOC_Os07g39670 Oryza sativa LOC_Os07g39670 N 0.833
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LOC_Os08g10120 Oryza sativa LOC_Os08g10120 N 0.833
LOC_Os03g11850 Oryza sativa LOC_Os03g11850 N 0.833
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LOC_Os03g20690 Oryza sativa LOC_Os03g20690 N 0.778
LOC_Os04g06220 Oryza sativa LOC_Os04g06220 N 0.778
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LOC_Os04g04990 Oryza sativa LOC_Os04g04990 N 0.778
LOC_Os02g26870 Oryza sativa LOC_Os02g26870 N 0.778
LOC_Os12g39190 Oryza sativa LOC_Os12g39190 N 0.778
LOC_Os11g29610 Oryza sativa LOC_Os11g29610 N 0.778
LOC_Os09g16840 Oryza sativa LOC_Os09g16840 N 0.778
LOC_Os05g49600 Oryza sativa LOC_Os05g49600 N 0.778
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LOC_Os01g28490 Oryza sativa LOC_Os01g28490 N 0.778
LOC_Os08g39174 Oryza sativa LOC_Os08g39174 N 0.722
LOC_Os04g41730 Oryza sativa LOC_Os04g41730 N 0.722
LOC_Os10g19338 Oryza sativa LOC_Os10g19338 N 0.722
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LOC_Os12g25080 Oryza sativa LOC_Os12g25080 N 0.722
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LOC_Os08g13340 Oryza sativa LOC_Os08g13340 N 0.722
LOC_Os05g25820 Oryza sativa LOC_Os05g25820 N 0.722