LOC_Os09g16840 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os09g16840 T12138_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os09g16840.1 CCHC ZF 210 227

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

112 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os08g38660 Oryza sativa LOC_Os08g38660 N 0.944
LOC_Os02g18310 Oryza sativa LOC_Os02g18310 N 0.889
LOC_Os02g14370 Oryza sativa LOC_Os02g14370 N 0.889
LOC_Os02g27320 Oryza sativa LOC_Os02g27320 N 0.889
LOC_Os01g58810 Oryza sativa LOC_Os01g58810 N 0.889
LOC_Os03g02500 Oryza sativa LOC_Os03g02500 N 0.889
LOC_Os03g14349 Oryza sativa LOC_Os03g14349 N 0.889
LOC_Os09g18080 Oryza sativa LOC_Os09g18080 N 0.889
LOC_Os01g55660 Oryza sativa LOC_Os01g55660 N 0.889
LOC_Os01g32990 Oryza sativa LOC_Os01g32990 N 0.889
LOC_Os01g16270 Oryza sativa LOC_Os01g16270 N 0.889
LOC_Os05g27770 Oryza sativa LOC_Os05g27770 N 0.889
LOC_Os01g06810 Oryza sativa LOC_Os01g06810 N 0.889
LOC_Os07g36270 Oryza sativa LOC_Os07g36270 N 0.889
LOC_Os01g28760 Oryza sativa LOC_Os01g28760 N 0.889
LOC_Os03g29130 Oryza sativa LOC_Os03g29130 N 0.889
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LOC_Os01g37410 Oryza sativa LOC_Os01g37410 N 0.889
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LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 0.889
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LOC_Os12g09400 Oryza sativa LOC_Os12g09400 N 0.889
LOC_Os12g18250 Oryza sativa LOC_Os12g18250 N 0.889
LOC_Os12g10500 Oryza sativa LOC_Os12g10500 N 0.889
LOC_Os07g39380 Oryza sativa LOC_Os07g39380 N 0.889
LOC_Os12g26520 Oryza sativa LOC_Os12g26520 N 0.889
LOC_Os12g36260 Oryza sativa LOC_Os12g36260 N 0.889
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LOC_Os05g32700 Oryza sativa LOC_Os05g32700 N 0.778
LOC_Os10g19338 Oryza sativa LOC_Os10g19338 N 0.722
LOC_Os09g33750 Oryza sativa LOC_Os09g33750 N 0.722
LOC_Os08g39174 Oryza sativa LOC_Os08g39174 N 0.722
LOC_Os05g25820 Oryza sativa LOC_Os05g25820 N 0.722
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LOC_Os02g26870 Oryza sativa LOC_Os02g26870 N 0.722