LOC_Os06g47810 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os06g47810 T11708_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os06g47810.1 CCHC ZF 357 374

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

116 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os12g16730 Oryza sativa LOC_Os12g16730 N 1.000
LOC_Os03g31620 Oryza sativa LOC_Os03g31620 N 1.000
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LOC_Os02g14370 Oryza sativa LOC_Os02g14370 N 0.944
LOC_Os01g55660 Oryza sativa LOC_Os01g55660 N 0.944
LOC_Os01g37410 Oryza sativa LOC_Os01g37410 N 0.944
LOC_Os01g09050 Oryza sativa LOC_Os01g09050 N 0.944
LOC_Os01g58810 Oryza sativa LOC_Os01g58810 N 0.944
LOC_Os12g41080 Oryza sativa LOC_Os12g41080 N 0.944
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LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 0.944
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LOC_Os11g25810 Oryza sativa LOC_Os11g25810 N 0.722
LOC_Os05g32700 Oryza sativa LOC_Os05g32700 N 0.722
LOC_Os05g25820 Oryza sativa LOC_Os05g25820 N 0.722
XM_002874266.1 Arabidopsis lyrata fgenesh1_pm.C_scaffold_6002106 N 0.722
emb1138 Arabidopsis thaliana AT5G26742-TAIR-G N 0.722
DGIL_AUG5s9216g3t1 Acyrtosiphon pisum DGIL_AUG5s9216g3t1 N 0.722