LOC_Os08g39174 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os08g39174 T12043_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os08g39174.1 CCHC ZF 1226 1243

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

111 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os04g06220 Oryza sativa LOC_Os04g06220 N 0.944
LOC_Os05g49600 Oryza sativa LOC_Os05g49600 N 0.944
LOC_Os12g39190 Oryza sativa LOC_Os12g39190 N 0.944
LOC_Os03g20690 Oryza sativa LOC_Os03g20690 N 0.944
LOC_Os04g04120 Oryza sativa LOC_Os04g04120 N 0.944
LOC_Os04g41730 Oryza sativa LOC_Os04g41730 N 0.889
LOC_Os05g32700 Oryza sativa LOC_Os05g32700 N 0.833
LOC_Os07g12840 Oryza sativa LOC_Os07g12840 N 0.833
LOC_Os12g06580 Oryza sativa LOC_Os12g06580 N 0.833
LOC_Os12g25080 Oryza sativa LOC_Os12g25080 N 0.833
LOC_Os12g22820 Oryza sativa LOC_Os12g22820 N 0.833
LOC_Os07g27510 Oryza sativa LOC_Os07g27510 N 0.833
LOC_Os10g21730 Oryza sativa LOC_Os10g21730 N 0.833
LOC_Os07g23400 Oryza sativa LOC_Os07g23400 N 0.833
LOC_Os07g41110 Oryza sativa LOC_Os07g41110 N 0.833
LOC_Os05g49110 Oryza sativa LOC_Os05g49110 N 0.833
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LOC_Os01g34630 Oryza sativa LOC_Os01g34630 N 0.833
LOC_Os07g31590 Oryza sativa LOC_Os07g31590 N 0.833
LOC_Os05g19250 Oryza sativa LOC_Os05g19250 N 0.778
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LOC_Os03g14349 Oryza sativa LOC_Os03g14349 N 0.778
LOC_Os03g31620 Oryza sativa LOC_Os03g31620 N 0.778
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LOC_Os02g26870 Oryza sativa LOC_Os02g26870 N 0.778
LOC_Os06g25910 Oryza sativa LOC_Os06g25910 N 0.778
LOC_Os06g29600 Oryza sativa LOC_Os06g29600 N 0.778
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LOC_Os06g34090 Oryza sativa LOC_Os06g34090 N 0.778
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LOC_Os02g27320 Oryza sativa LOC_Os02g27320 N 0.778
LOC_Os12g11970 Oryza sativa LOC_Os12g11970 N 0.778
LOC_Os12g12040 Oryza sativa LOC_Os12g12040 N 0.778
LOC_Os12g11730 Oryza sativa LOC_Os12g11730 N 0.778
LOC_Os12g10500 Oryza sativa LOC_Os12g10500 N 0.778
LOC_Os12g09400 Oryza sativa LOC_Os12g09400 N 0.778
LOC_Os12g15290 Oryza sativa LOC_Os12g15290 N 0.778
LOC_Os12g16730 Oryza sativa LOC_Os12g16730 N 0.778
LOC_Os12g36260 Oryza sativa LOC_Os12g36260 N 0.778
LOC_Os12g34580 Oryza sativa LOC_Os12g34580 N 0.778
LOC_Os02g18310 Oryza sativa LOC_Os02g18310 N 0.778
LOC_Os12g18250 Oryza sativa LOC_Os12g18250 N 0.778
LOC_Os12g03304 Oryza sativa LOC_Os12g03304 N 0.778
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LOC_Os10g31220 Oryza sativa LOC_Os10g31220 N 0.778
LOC_Os10g33570 Oryza sativa LOC_Os10g33570 N 0.778
LOC_Os10g19290 Oryza sativa LOC_Os10g19290 N 0.778
LOC_Os10g03300 Oryza sativa LOC_Os10g03300 N 0.778
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LOC_Os10g34890 Oryza sativa LOC_Os10g34890 N 0.778
LOC_Os10g36460 Oryza sativa LOC_Os10g36460 N 0.778
LOC_Os11g35800 Oryza sativa LOC_Os11g35800 N 0.778
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LOC_Os11g01700 Oryza sativa LOC_Os11g01700 N 0.778
LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 0.778
LOC_Os12g41080 Oryza sativa LOC_Os12g41080 N 0.778
LOC_Os12g26520 Oryza sativa LOC_Os12g26520 N 0.778
LOC_Os01g58810 Oryza sativa LOC_Os01g58810 N 0.778
LOC_Os01g16270 Oryza sativa LOC_Os01g16270 N 0.778
LOC_Os02g14370 Oryza sativa LOC_Os02g14370 N 0.778
LOC_Os01g28490 Oryza sativa LOC_Os01g28490 N 0.778
LOC_Os01g28760 Oryza sativa LOC_Os01g28760 N 0.778
LOC_Os01g09050 Oryza sativa LOC_Os01g09050 N 0.778
LOC_Os01g55660 Oryza sativa LOC_Os01g55660 N 0.778
AT1G54930 Arabidopsis thaliana AT1G54930-TAIR-G N 0.778
LOC_Os01g37410 Oryza sativa LOC_Os01g37410 N 0.778
LOC_Os01g33324 Oryza sativa LOC_Os01g33324 N 0.778
LOC_Os01g32990 Oryza sativa LOC_Os01g32990 N 0.778
LOC_Os01g06810 Oryza sativa LOC_Os01g06810 N 0.778
LOC_Os01g29680 Oryza sativa LOC_Os01g29680 N 0.778
LOC_Os08g10120 Oryza sativa LOC_Os08g10120 N 0.722
LOC_Os09g16840 Oryza sativa LOC_Os09g16840 N 0.722
LOC_Os08g38660 Oryza sativa LOC_Os08g38660 N 0.722
LOC_Os09g27180 Oryza sativa LOC_Os09g27180 N 0.722
LOC_Os02g15990 Oryza sativa LOC_Os02g15990 N 0.722
LOC_Os07g39670 Oryza sativa LOC_Os07g39670 N 0.722
LOC_Os03g11850 Oryza sativa LOC_Os03g11850 N 0.722
LOC_Os11g25810 Oryza sativa LOC_Os11g25810 N 0.722
LOC_Os12g13780 Oryza sativa LOC_Os12g13780 N 0.722
LOC_Os05g10510 Oryza sativa LOC_Os05g10510 N 0.722
XM_002894567.1 Arabidopsis lyrata fgenesh1_pm.C_scaffold_1003658 N 0.722
CNBG_1048 Cryptococcus neoformans CNBG_1048 N 0.722
LOC_Os04g24350 Oryza sativa LOC_Os04g24350 N 0.722
LOC_Os04g24100 Oryza sativa LOC_Os04g24100 N 0.722
LOC_Os07g27900 Oryza sativa LOC_Os07g27900 N 0.722
GSTUMT00000433001 Tuber melanosporum GSTUMT00000433001 N 0.722
LOC_Os04g04990 Oryza sativa LOC_Os04g04990 N 0.722
LOC_Os01g43210 Oryza sativa LOC_Os01g43210 N 0.722