LOC_Os12g39190 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os12g39190 T12653_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os12g39190.1 CCHC ZF 201 218

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

123 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os04g04120 Oryza sativa LOC_Os04g04120 N 1.000
LOC_Os04g06220 Oryza sativa LOC_Os04g06220 N 1.000
LOC_Os03g20690 Oryza sativa LOC_Os03g20690 N 1.000
LOC_Os05g49600 Oryza sativa LOC_Os05g49600 N 1.000
LOC_Os04g41730 Oryza sativa LOC_Os04g41730 N 0.944
LOC_Os08g39174 Oryza sativa LOC_Os08g39174 N 0.944
LOC_Os07g31590 Oryza sativa LOC_Os07g31590 N 0.889
LOC_Os07g23400 Oryza sativa LOC_Os07g23400 N 0.889
LOC_Os07g27510 Oryza sativa LOC_Os07g27510 N 0.889
LOC_Os10g21730 Oryza sativa LOC_Os10g21730 N 0.889
LOC_Os08g17700 Oryza sativa LOC_Os08g17700 N 0.889
LOC_Os07g41110 Oryza sativa LOC_Os07g41110 N 0.889
LOC_Os12g06580 Oryza sativa LOC_Os12g06580 N 0.889
LOC_Os01g34630 Oryza sativa LOC_Os01g34630 N 0.889
LOC_Os07g12840 Oryza sativa LOC_Os07g12840 N 0.889
LOC_Os12g22820 Oryza sativa LOC_Os12g22820 N 0.889
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LOC_Os05g49110 Oryza sativa LOC_Os05g49110 N 0.889
LOC_Os12g25080 Oryza sativa LOC_Os12g25080 N 0.889
LOC_Os07g39380 Oryza sativa LOC_Os07g39380 N 0.833
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LOC_Os08g05150 Oryza sativa LOC_Os08g05150 N 0.833
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LOC_Os12g11970 Oryza sativa LOC_Os12g11970 N 0.833
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LOC_Os12g36260 Oryza sativa LOC_Os12g36260 N 0.833
LOC_Os12g34580 Oryza sativa LOC_Os12g34580 N 0.833
LOC_Os12g26520 Oryza sativa LOC_Os12g26520 N 0.833
LOC_Os12g18250 Oryza sativa LOC_Os12g18250 N 0.833
LOC_Os12g03304 Oryza sativa LOC_Os12g03304 N 0.833
LOC_Os11g46090 Oryza sativa LOC_Os11g46090 N 0.833
LOC_Os10g31220 Oryza sativa LOC_Os10g31220 N 0.833
LOC_Os10g33570 Oryza sativa LOC_Os10g33570 N 0.833
LOC_Os10g19290 Oryza sativa LOC_Os10g19290 N 0.833
LOC_Os10g03300 Oryza sativa LOC_Os10g03300 N 0.833
LOC_Os06g19040 Oryza sativa LOC_Os06g19040 N 0.833
LOC_Os10g34890 Oryza sativa LOC_Os10g34890 N 0.833
LOC_Os10g36460 Oryza sativa LOC_Os10g36460 N 0.833
LOC_Os11g35800 Oryza sativa LOC_Os11g35800 N 0.833
LOC_Os11g16610 Oryza sativa LOC_Os11g16610 N 0.833
LOC_Os11g01700 Oryza sativa LOC_Os11g01700 N 0.833
LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 0.833
LOC_Os08g14340 Oryza sativa LOC_Os08g14340 N 0.833
LOC_Os06g23860 Oryza sativa LOC_Os06g23860 N 0.833
LOC_Os01g29680 Oryza sativa LOC_Os01g29680 N 0.833
LOC_Os03g02500 Oryza sativa LOC_Os03g02500 N 0.833
LOC_Os02g27320 Oryza sativa LOC_Os02g27320 N 0.833
LOC_Os01g28760 Oryza sativa LOC_Os01g28760 N 0.833
LOC_Os03g14349 Oryza sativa LOC_Os03g14349 N 0.833
LOC_Os01g28490 Oryza sativa LOC_Os01g28490 N 0.833
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LOC_Os01g32990 Oryza sativa LOC_Os01g32990 N 0.833
LOC_Os02g26870 Oryza sativa LOC_Os02g26870 N 0.833
LOC_Os02g14370 Oryza sativa LOC_Os02g14370 N 0.833
LOC_Os01g58810 Oryza sativa LOC_Os01g58810 N 0.833
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LOC_Os06g13500 Oryza sativa LOC_Os06g13500 N 0.833
LOC_Os01g33324 Oryza sativa LOC_Os01g33324 N 0.833
LOC_Os02g18310 Oryza sativa LOC_Os02g18310 N 0.833
LOC_Os03g31200 Oryza sativa LOC_Os03g31200 N 0.833
LOC_Os01g16270 Oryza sativa LOC_Os01g16270 N 0.833
LOC_Os05g25820 Oryza sativa LOC_Os05g25820 N 0.833
LOC_Os05g27770 Oryza sativa LOC_Os05g27770 N 0.833
LOC_Os04g34960 Oryza sativa LOC_Os04g34960 N 0.833
LOC_Os05g07190 Oryza sativa LOC_Os05g07190 N 0.833
LOC_Os05g19250 Oryza sativa LOC_Os05g19250 N 0.833
LOC_Os04g19950 Oryza sativa LOC_Os04g19950 N 0.833
LOC_Os01g06810 Oryza sativa LOC_Os01g06810 N 0.833
LOC_Os03g56676 Oryza sativa LOC_Os03g56676 N 0.833
LOC_Os03g31620 Oryza sativa LOC_Os03g31620 N 0.833
LOC_Os01g09050 Oryza sativa LOC_Os01g09050 N 0.833
LOC_Os06g05460 Oryza sativa LOC_Os06g05460 N 0.833
LOC_Os04g13240 Oryza sativa LOC_Os04g13240 N 0.833
LOC_Os05g15810 Oryza sativa LOC_Os05g15810 N 0.833
AT1G54930 Arabidopsis thaliana AT1G54930-TAIR-G N 0.778
LOC_Os11g25810 Oryza sativa LOC_Os11g25810 N 0.778
LOC_Os01g43210 Oryza sativa LOC_Os01g43210 N 0.778
LOC_Os12g13780 Oryza sativa LOC_Os12g13780 N 0.778
GSTUMT00000433001 Tuber melanosporum GSTUMT00000433001 N 0.778
LOC_Os09g27180 Oryza sativa LOC_Os09g27180 N 0.778
LOC_Os07g27900 Oryza sativa LOC_Os07g27900 N 0.778
LOC_Os04g04990 Oryza sativa LOC_Os04g04990 N 0.778
LOC_Os02g15990 Oryza sativa LOC_Os02g15990 N 0.778
LOC_Os04g24100 Oryza sativa LOC_Os04g24100 N 0.778
LOC_Os04g24350 Oryza sativa LOC_Os04g24350 N 0.778
LOC_Os05g10510 Oryza sativa LOC_Os05g10510 N 0.778
LOC_Os07g39670 Oryza sativa LOC_Os07g39670 N 0.778
LOC_Os08g38660 Oryza sativa LOC_Os08g38660 N 0.778
LOC_Os09g16840 Oryza sativa LOC_Os09g16840 N 0.778
LOC_Os08g10120 Oryza sativa LOC_Os08g10120 N 0.778
LOC_Os03g11850 Oryza sativa LOC_Os03g11850 N 0.778
GSTUMT00008340001 Tuber melanosporum GSTUMT00008340001 N 0.722
GSTUMT00009478001 Tuber melanosporum GSTUMT00009478001 N 0.722
GSTUMT00002974001 Tuber melanosporum GSTUMT00002974001 N 0.722
GSTUMT00002439001 Tuber melanosporum GSTUMT00002439001 N 0.722
GSTUMT00000525001 Tuber melanosporum GSTUMT00000525001 N 0.722
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GSTUMT00000045001 Tuber melanosporum GSTUMT00000045001 N 0.722
XM_002894567.1 Arabidopsis lyrata fgenesh1_pm.C_scaffold_1003658 N 0.722
LOC_Os11g29610 Oryza sativa LOC_Os11g29610 N 0.722
LOC_Os08g13340 Oryza sativa LOC_Os08g13340 N 0.722
LOC_Os08g03810 Oryza sativa LOC_Os08g03810 N 0.722
LOC_Os12g01470 Oryza sativa LOC_Os12g01470 N 0.722
GSTUMT00010588001 Tuber melanosporum GSTUMT00010588001 N 0.722
CNBG_1048 Cryptococcus neoformans CNBG_1048 N 0.722
GSTUMT00009895001 Tuber melanosporum GSTUMT00009895001 N 0.722