MBNL2 (Sus scrofa)
CCCH ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00642 (zf-CCCH) IPR000571 ENSSSCG00000009505 T03378_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
MBNL1
M320_0.6 		Homo sapiens YYYGCUKY; YGCY SELEX
Cook et al.(2011)
669_20071745 		0.882
MBNL1
M037_0.6 		Homo sapiens GCUUGC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00038 		0.882
For this family, RBPs with RBD identity > 0.7 will likely have a similar motif

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
ENSSSCP00000010151 CCCH ZF 16 40
ENSSSCP00000010151 CCCH ZF 57 72
ENSSSCP00000010151 CCCH ZF 177 203
ENSSSCP00000010151 CCCH ZF 215 237

Links

Other CCCH ZF family RBPs
Other Sus scrofa RBPs

111 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
CBN07680 Caenorhabditis brenneri CBN07680 N 0.000
fgenesh2_pg.C_scaffold_2000617 Heterobasidion annosum fgenesh2_pg.C_scaffold_2000617 N 0.000
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