PCBP4 (Homo sapiens)
KH

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00013 (KH_1) IPR018111 ENSG00000090097 T18786_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
Pcbp3
M188_0.6 		Mus musculus UUUYCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00215 		0.742
pcbp2
M211_0.6 		Danio rerio WWUCCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00246 		0.716
PCBP2
M043_0.6 		Homo sapiens CCYYCCH RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00044 		0.716
Pcbp1
M207_0.6 		Mus musculus CYUUCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00239 		0.705
PCBP1
M177_0.6 		Homo sapiens CCWWHCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00186 		0.705
For this family, RBPs with RBD identity > 0.7 will likely have a similar motif

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
ENSP00000294192 KH 19 79
ENSP00000294192 KH 103 166
ENSP00000294192 KH 243 305
ENSP00000322341 KH 19 79
ENSP00000322341 KH 103 166
ENSP00000322341 KH 243 305
ENSP00000338014 KH 86 148
ENSP00000348111 KH 19 79
ENSP00000348111 KH 103 166
ENSP00000348111 KH 243 305
ENSP00000378460 KH 11 45
ENSP00000378460 KH 69 132
ENSP00000378460 KH 209 271
ENSP00000378461 KH 11 45
ENSP00000378461 KH 69 98
ENSP00000378461 KH 150 187
ENSP00000378461 KH 264 326
ENSP00000395030 KH 26 57
ENSP00000395030 KH 83 145
ENSP00000417100 KH 19 79
ENSP00000417100 KH 103 131
ENSP00000417100 KH 200 262
ENSP00000417196 KH 19 79
ENSP00000417196 KH 103 166
ENSP00000417196 KH 243 305
ENSP00000417916 KH 19 79
ENSP00000418312 KH 19 79
ENSP00000418613 KH 19 47
ENSP00000418925 KH 19 79
ENSP00000418925 KH 103 166
ENSP00000418925 KH 243 305
ENSP00000418997 KH 19 75
ENSP00000419557 KH 19 79
ENSP00000419557 KH 103 124
ENSP00000419672 KH 19 46
ENSP00000419694 KH 19 79
ENSP00000419694 KH 103 166
ENSP00000420008 KH 19 79

Links

Other KH family RBPs
Other Homo sapiens RBPs

126 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
13113.t00024 Oryza sativa 13113.t00024 N 0.000
13113.t00032 Oryza sativa 13113.t00032 N 0.000
13113.t00059 Oryza sativa 13113.t00059 N 0.000
13113.t00063 Oryza sativa 13113.t00063 N 0.000
13114.t00040 Oryza sativa 13114.t00040 N 0.000
13114.t00059 Oryza sativa 13114.t00059 N 0.000
13114.t00077 Oryza sativa 13114.t00077 N 0.000
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