BRADI1G03180 (Brachypodium distachyon)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 BRADI1G03180 T09478_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
BRADI1G03180.1 CCHC ZF 751 768

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Brachypodium distachyon RBPs

28 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
emb1138 Arabidopsis thaliana AT5G26742-TAIR-G N 0.722
PK16552.1 Cannabis sativa PK16552.1 N 0.778
Cucsa.051030 Cucumis sativus Cucsa.051030 N 0.000
fgenesh2_pg.3_#_606 Fragilariopsis cylindrus fgenesh2_pg.3_#_606 N 0.000
Glyma19g41150.1 Glycine max Glyma19g41150.1 N 0.889
Glyma03g38550.1 Glycine max Glyma03g38550.1 N 0.833
LjB06P23.40.nc Lotus japonicus LjB06P23.40.nc N 0.889
cassava12877.valid.m1 Manihot esculenta cassava12877.valid.m1 N 0.833
Medtr7g134530 Medicago truncatula Medtr7g134530 N 0.889
BGIOSIBCE013536 Oryza indica BGIOSIBCE013536 N 0.889
LOC_Os10g19290 Oryza sativa LOC_Os10g19290 N 0.000
LOC_Os10g31220 Oryza sativa LOC_Os10g31220 N 0.000
LOC_Os10g33570 Oryza sativa LOC_Os10g33570 N 0.000
LOC_Os10g34890 Oryza sativa LOC_Os10g34890 N 0.000
LOC_Os10g36460 Oryza sativa LOC_Os10g36460 N 0.000
LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 0.000
LOC_Os10g03300 Oryza sativa LOC_Os10g03300 N 0.000
LOC_Os09g18080 Oryza sativa LOC_Os09g18080 N 0.000
LOC_Os08g14340 Oryza sativa LOC_Os08g14340 N 0.000
LOC_Os08g14170 Oryza sativa LOC_Os08g14170 N 0.000
LOC_Os08g06850 Oryza sativa LOC_Os08g06850 N 0.000
LOC_Os08g05150 Oryza sativa LOC_Os08g05150 N 0.000
LOC_Os07g39380 Oryza sativa LOC_Os07g39380 N 0.000
LOC_Os07g38350 Oryza sativa LOC_Os07g38350 N 0.000
LOC_Os07g36270 Oryza sativa LOC_Os07g36270 N 0.000
LOC_Os11g01700 Oryza sativa LOC_Os11g01700 N 0.000
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LOC_Os01g06810 Oryza sativa LOC_Os01g06810 N 0.000
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LOC_Os07g27900 Oryza sativa LOC_Os07g27900 N 0.000
LOC_Os04g19950 Oryza sativa LOC_Os04g19950 N 0.000
LOC_Os06g34090 Oryza sativa LOC_Os06g34090 N 0.000
B9N3Z3_POPTR Populus trichocarpa POPTR_0005s00240 N 0.778
B9N3Y9_POPTR Populus trichocarpa POPTR_0005s00200 N 0.778
ppa001778m Prunus persica ppa001778m N 0.722
PTTG_10751 Puccinia triticina PTTG_10751 N 0.000
PTTG_11057 Puccinia triticina PTTG_11057 N 0.000
30128.m009003 Ricinus communis 30128.m009003 N 0.833
Sb01g002660 Sorghum bicolor Sb01g002660 N 0.889
GSVIVG00031360001 Vitis vinifera GSVIVG00031360001 N 0.833
GRMZM2G415491 Zea mays GRMZM2G415491 N 0.889
GRMZM2G163072 Zea mays GRMZM2G163072 N 0.833