LOC_Os12g18250 (Oryza sativa)
CCHC ZF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00098 (zf-CCHC) IPR001878 LOC_Os12g18250 T12531_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
LOC_Os12g18250.1 CCHC ZF 397 414

Links

Other CCHC ZF family RBPs
Other Oryza sativa RBPs

118 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
emb1138 Arabidopsis thaliana AT5G26742-TAIR-G N 0.722
DGIL_AUG5s9216g3t1 Acyrtosiphon pisum DGIL_AUG5s9216g3t1 N 0.722
XM_002874266.1 Arabidopsis lyrata fgenesh1_pm.C_scaffold_6002106 N 0.722
LOC_Os01g06810 Oryza sativa LOC_Os01g06810 N 1.000
LOC_Os01g09050 Oryza sativa LOC_Os01g09050 N 1.000
LOC_Os01g16270 Oryza sativa LOC_Os01g16270 N 1.000
LOC_Os01g28490 Oryza sativa LOC_Os01g28490 N 0.889
LOC_Os01g28760 Oryza sativa LOC_Os01g28760 N 1.000
LOC_Os01g29680 Oryza sativa LOC_Os01g29680 N 0.889
LOC_Os01g32990 Oryza sativa LOC_Os01g32990 N 1.000
LOC_Os01g33324 Oryza sativa LOC_Os01g33324 N 0.944
LOC_Os01g34630 Oryza sativa LOC_Os01g34630 N 0.889
LOC_Os01g37410 Oryza sativa LOC_Os01g37410 N 1.000
LOC_Os01g43210 Oryza sativa LOC_Os01g43210 N 0.889
LOC_Os01g55660 Oryza sativa LOC_Os01g55660 N 1.000
LOC_Os01g58810 Oryza sativa LOC_Os01g58810 N 1.000
LOC_Os02g14370 Oryza sativa LOC_Os02g14370 N 1.000
LOC_Os02g15990 Oryza sativa LOC_Os02g15990 N 0.944
LOC_Os02g18310 Oryza sativa LOC_Os02g18310 N 1.000
LOC_Os02g26870 Oryza sativa LOC_Os02g26870 N 0.833
LOC_Os02g27320 Oryza sativa LOC_Os02g27320 N 1.000
LOC_Os03g02500 Oryza sativa LOC_Os03g02500 N 1.000
LOC_Os03g11850 Oryza sativa LOC_Os03g11850 N 0.944
LOC_Os03g14349 Oryza sativa LOC_Os03g14349 N 1.000
LOC_Os03g20690 Oryza sativa LOC_Os03g20690 N 0.833
LOC_Os03g29130 Oryza sativa LOC_Os03g29130 N 1.000
LOC_Os03g31200 Oryza sativa LOC_Os03g31200 N 1.000
LOC_Os03g31620 Oryza sativa LOC_Os03g31620 N 0.944
LOC_Os03g56676 Oryza sativa LOC_Os03g56676 N 1.000
LOC_Os04g04120 Oryza sativa LOC_Os04g04120 N 0.833
LOC_Os04g04990 Oryza sativa LOC_Os04g04990 N 0.889
LOC_Os04g06220 Oryza sativa LOC_Os04g06220 N 0.833
LOC_Os04g13240 Oryza sativa LOC_Os04g13240 N 1.000
LOC_Os04g19950 Oryza sativa LOC_Os04g19950 N 1.000
LOC_Os04g24100 Oryza sativa LOC_Os04g24100 N 0.889
LOC_Os04g24350 Oryza sativa LOC_Os04g24350 N 0.944
LOC_Os04g34960 Oryza sativa LOC_Os04g34960 N 1.000
LOC_Os04g41730 Oryza sativa LOC_Os04g41730 N 0.778
LOC_Os05g07190 Oryza sativa LOC_Os05g07190 N 1.000
LOC_Os05g10510 Oryza sativa LOC_Os05g10510 N 0.944
LOC_Os05g15810 Oryza sativa LOC_Os05g15810 N 1.000
LOC_Os05g19250 Oryza sativa LOC_Os05g19250 N 0.889
LOC_Os05g25820 Oryza sativa LOC_Os05g25820 N 0.778
LOC_Os05g27770 Oryza sativa LOC_Os05g27770 N 1.000
LOC_Os05g32700 Oryza sativa LOC_Os05g32700 N 0.722
LOC_Os05g49110 Oryza sativa LOC_Os05g49110 N 0.944
LOC_Os05g49600 Oryza sativa LOC_Os05g49600 N 0.833
LOC_Os06g05460 Oryza sativa LOC_Os06g05460 N 1.000
LOC_Os06g13500 Oryza sativa LOC_Os06g13500 N 1.000
LOC_Os06g19040 Oryza sativa LOC_Os06g19040 N 1.000
LOC_Os06g23860 Oryza sativa LOC_Os06g23860 N 1.000
LOC_Os06g25910 Oryza sativa LOC_Os06g25910 N 1.000
LOC_Os06g29600 Oryza sativa LOC_Os06g29600 N 1.000
LOC_Os06g34090 Oryza sativa LOC_Os06g34090 N 1.000
LOC_Os06g35840 Oryza sativa LOC_Os06g35840 N 1.000
LOC_Os06g42300 Oryza sativa LOC_Os06g42300 N 1.000
LOC_Os06g47810 Oryza sativa LOC_Os06g47810 N 0.944
LOC_Os06g49270 Oryza sativa LOC_Os06g49270 N 0.944
LOC_Os07g12840 Oryza sativa LOC_Os07g12840 N 0.944
LOC_Os07g20280 Oryza sativa LOC_Os07g20280 N 0.722
LOC_Os07g20620 Oryza sativa LOC_Os07g20620 N 0.833
LOC_Os07g23400 Oryza sativa LOC_Os07g23400 N 0.944
LOC_Os07g27510 Oryza sativa LOC_Os07g27510 N 0.944
LOC_Os07g27900 Oryza sativa LOC_Os07g27900 N 0.944
LOC_Os07g31590 Oryza sativa LOC_Os07g31590 N 0.778
LOC_Os07g36270 Oryza sativa LOC_Os07g36270 N 1.000
LOC_Os07g38350 Oryza sativa LOC_Os07g38350 N 1.000
LOC_Os07g39380 Oryza sativa LOC_Os07g39380 N 1.000
LOC_Os07g39670 Oryza sativa LOC_Os07g39670 N 0.944
LOC_Os07g41110 Oryza sativa LOC_Os07g41110 N 0.944
LOC_Os08g03810 Oryza sativa LOC_Os08g03810 N 0.889
LOC_Os08g05150 Oryza sativa LOC_Os08g05150 N 1.000
LOC_Os08g06850 Oryza sativa LOC_Os08g06850 N 1.000
LOC_Os08g10120 Oryza sativa LOC_Os08g10120 N 0.944
LOC_Os08g13340 Oryza sativa LOC_Os08g13340 N 0.833
LOC_Os08g14170 Oryza sativa LOC_Os08g14170 N 1.000
LOC_Os08g14340 Oryza sativa LOC_Os08g14340 N 1.000
LOC_Os08g17700 Oryza sativa LOC_Os08g17700 N 0.944
LOC_Os08g38660 Oryza sativa LOC_Os08g38660 N 0.944
LOC_Os08g39174 Oryza sativa LOC_Os08g39174 N 0.778
LOC_Os09g16840 Oryza sativa LOC_Os09g16840 N 0.889
LOC_Os09g18080 Oryza sativa LOC_Os09g18080 N 1.000
LOC_Os09g27180 Oryza sativa LOC_Os09g27180 N 0.944
LOC_Os09g33750 Oryza sativa LOC_Os09g33750 N 0.833
LOC_Os10g03300 Oryza sativa LOC_Os10g03300 N 1.000
LOC_Os10g13580 Oryza sativa LOC_Os10g13580 N 0.722
LOC_Os10g19290 Oryza sativa LOC_Os10g19290 N 1.000
LOC_Os10g19338 Oryza sativa LOC_Os10g19338 N 0.833
LOC_Os10g21730 Oryza sativa LOC_Os10g21730 N 0.944
LOC_Os10g31220 Oryza sativa LOC_Os10g31220 N 1.000
LOC_Os10g33570 Oryza sativa LOC_Os10g33570 N 1.000
LOC_Os10g34890 Oryza sativa LOC_Os10g34890 N 1.000
LOC_Os10g36460 Oryza sativa LOC_Os10g36460 N 1.000
LOC_Os10g37468 Oryza sativa LOC_Os10g37468 N 1.000
LOC_Os11g01700 Oryza sativa LOC_Os11g01700 N 1.000
LOC_Os11g16610 Oryza sativa LOC_Os11g16610 N 1.000
LOC_Os11g25810 Oryza sativa LOC_Os11g25810 N 0.722
LOC_Os11g29610 Oryza sativa LOC_Os11g29610 N 0.889
LOC_Os11g35800 Oryza sativa LOC_Os11g35800 N 1.000
LOC_Os11g46090 Oryza sativa LOC_Os11g46090 N 1.000
LOC_Os12g01470 Oryza sativa LOC_Os12g01470 N 0.889
LOC_Os12g03304 Oryza sativa LOC_Os12g03304 N 1.000
LOC_Os12g06580 Oryza sativa LOC_Os12g06580 N 0.944
LOC_Os12g09400 Oryza sativa LOC_Os12g09400 N 1.000
LOC_Os12g10500 Oryza sativa LOC_Os12g10500 N 1.000
LOC_Os12g11730 Oryza sativa LOC_Os12g11730 N 1.000
LOC_Os12g11970 Oryza sativa LOC_Os12g11970 N 1.000
LOC_Os12g12040 Oryza sativa LOC_Os12g12040 N 1.000
LOC_Os12g13780 Oryza sativa LOC_Os12g13780 N 0.944
LOC_Os12g15290 Oryza sativa LOC_Os12g15290 N 1.000
LOC_Os12g16730 Oryza sativa LOC_Os12g16730 N 0.944
LOC_Os12g22820 Oryza sativa LOC_Os12g22820 N 0.944
LOC_Os12g25080 Oryza sativa LOC_Os12g25080 N 0.778
LOC_Os12g26520 Oryza sativa LOC_Os12g26520 N 1.000
LOC_Os12g34580 Oryza sativa LOC_Os12g34580 N 1.000
LOC_Os12g36260 Oryza sativa LOC_Os12g36260 N 1.000
LOC_Os12g39190 Oryza sativa LOC_Os12g39190 N 0.833
LOC_Os12g41080 Oryza sativa LOC_Os12g41080 N 1.000