Q3SYT9_BOVIN (Bos taurus)
KH

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00013 (KH_1) IPR018111 ENSBTAG00000020757 T18442_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
PCBP2
M043_0.6 		Homo sapiens CCYYCCH RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00044 		1.000
pcbp2
M211_0.6 		Danio rerio WWUCCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00246 		0.957
Pcbp1
M207_0.6 		Mus musculus CYUUCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00239 		0.936
PCBP1
M177_0.6 		Homo sapiens CCWWHCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00186 		0.936
Pcbp3
M188_0.6 		Mus musculus UUUYCC RNAcompete
Ray et al.(2013)
RNCMPT00215 		0.883
For this family, RBPs with RBD identity > 0.7 will likely have a similar motif

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
ENSBTAP00000027662 KH 15 75
ENSBTAP00000027662 KH 99 162
ENSBTAP00000027662 KH 273 335
ENSBTAP00000038330 KH 15 75
ENSBTAP00000038330 KH 99 162
ENSBTAP00000038330 KH 255 317

Links

Other KH family RBPs
Other Bos taurus RBPs

131 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os08g20967 Oryza sativa LOC_Os08g20967 N 0.000
LOC_Os08g40770 Oryza sativa LOC_Os08g40770 N 0.000
LOC_Os09g01060 Oryza sativa LOC_Os09g01060 N 0.000
LOC_Os09g01250 Oryza sativa LOC_Os09g01250 N 0.000
LOC_Os09g01260 Oryza sativa LOC_Os09g01260 N 0.000
LOC_Os09g01270 Oryza sativa LOC_Os09g01270 N 0.000
LOC_Os09g01450 Oryza sativa LOC_Os09g01450 N 0.000
LOC_Os09g02020 Oryza sativa LOC_Os09g02020 N 0.000
LOC_Os09g02110 Oryza sativa LOC_Os09g02110 N 0.000
LOC_Os09g03350 Oryza sativa LOC_Os09g03350 N 0.000
LOC_Os09g03420 Oryza sativa LOC_Os09g03420 N 0.000
LOC_Os09g03830 Oryza sativa LOC_Os09g03830 N 0.000
LOC_Os09g08180 Oryza sativa LOC_Os09g08180 N 0.000
LOC_Os09g08750 Oryza sativa LOC_Os09g08750 N 0.000
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LOC_Os08g22110 Oryza sativa LOC_Os08g22110 N 0.000
LOC_Os08g22680 Oryza sativa LOC_Os08g22680 N 0.000
LOC_Os08g22820 Oryza sativa LOC_Os08g22820 N 0.000
LOC_Os08g23050 Oryza sativa LOC_Os08g23050 N 0.000
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LOC_Os08g23080 Oryza sativa LOC_Os08g23080 N 0.000
LOC_Os08g23400 Oryza sativa LOC_Os08g23400 N 0.000
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LOC_Os08g27900 Oryza sativa LOC_Os08g27900 N 0.000
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