Ame_R005385 (Ailuropoda melanoleuca)
RRM

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00076 (RRM_1) IPR000504 Ame_R005385 T55529_0.6 Superfamily (2011-Oct-26)

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
NCL
M245_0.6 		Homo sapiens CCGAAAKCCCGAAGYAGG SELEX
Cook et al.(2011)
1004_8676391 		0.974
For this family, RBPs with RBD identity > 0.7 will likely have a similar motif

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
Ame_R005385 RRM 272 340
Ame_R005385 RRM 358 423
Ame_R005385 RRM 451 517
Ame_R005385 RRM 537 604

Links

Other RRM family RBPs
Other Ailuropoda melanoleuca RBPs

37 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
LOC_Os08g22820 Oryza sativa LOC_Os08g22820 N 0.000
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