BRADI2G39410 (Brachypodium distachyon)
PUF

RBP Information

Pfam ID Interpro ID Gene ID CISBP-RNA ID Sequence source
PF00806 (PUF) IPR001313 BRADI2G39410 T24060_0.6 Ensembl (2011-Oct-26) Link out

Directly determined binding motifs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No direct experiments

Motifs from related RBPs

Name/Motif ID Species Sequence Logo IUPAC Type/Study/Study ID RBD
Identity
No RBPs with similar RNA binding domains

RNA Binding Domains

Protein ID Domain From To Sequence
BRADI2G39410.1 PUF 315 349
BRADI2G39410.1 PUF 351 385
BRADI2G39410.1 PUF 387 421
BRADI2G39410.1 PUF 423 457
BRADI2G39410.1 PUF 459 493
BRADI2G39410.1 PUF 496 530
BRADI2G39410.1 PUF 532 566
BRADI2G39410.1 PUF 576 608

Links

Other PUF family RBPs
Other Brachypodium distachyon RBPs

78 Related RBPs

Due to potential differences in protein isoforms or tested constructs, some RBPs without inferred motifs might appear in this list.
Name Species Gene ID Motif Evidence RBD
Identity		 Action
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_1020080 N 0.000
estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 Emiliania huxleyi estExtDG_fgeneshEH_pg.C_710018 N 0.000
Glyma03g38550.1 Glycine max Glyma03g38550.1 N 0.000
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Medtr7g134530 Medicago truncatula Medtr7g134530 N 0.000
PTTG_05310 Puccinia triticina PTTG_05310 N 0.000
PTTG_09070 Puccinia triticina PTTG_09070 N 0.000
PTTG_10291 Puccinia triticina PTTG_10291 N 0.000
s_442830 Phytophthora sojae s_442830 N 0.000